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2011 Fiscal Year Annual Research Report

タンパク質内エネルギー散逸の時空間分解観測による機構解明

Research Project

Project/Area Number 23350007
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

水谷 泰久  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (60270469)

Keywordsエネルギー移動 / 共鳴ラマン分光法 / 時間分解分光法
Research Abstract

本研究では、トリプトファン残基のアンチストークススペクトルをピコ秒の時間分解で測定することによって、タンパク質内の余剰エネルギー移動を調べた。その観測のためには、強度に関して高精度の測定能力が装置として必要である。そのため、光反応の効率を上げることとラマン散乱検出の効率をあげることの二面から現有のピコ秒時間分解共鳴ラマン分光装置の性能向上を図った。試料には、立体構造が詳細に調べられているマッコウクジラ由来のミオグロビンを用いた。このミオグロビンにはトリプトファンが2残基含まれているため、まずこれらをラマン散乱強度の弱いチロシン、フェニルアラニンに置換した。この変異体にトリプトファン残基を1残基導入することによって、望みの位置にトリプトファン残基をもつミオグロビン変異体を作製した。この変異体について、ヘムからトリプトファン残基への振動エネルギー移動を観測した。今年度は、ヘムからほぼ同じ距離でかつ方向の異なった位置にトリプトファンを導入した変異体3種、F43W、V68W、L89W変異体、を作製し、ヘムからのエネルギー伝搬の異方性について調べた。振動励起状態の生成および減衰の時定数は、V68W変異体については3ピコ秒であった。また、V68W変異体に比べF43W、L89W変異体は安定性が悪く、長時間のデータ積算ができなかったため、時定数を求めるレベルのデータはまだ得られていない。現在、安定性向上のための実験条件を検討している。
タンパク質内のエネルギー散逸機構の解明には、実験データとモデル計算との対比が必要不可欠である。そこで、タンパク質の立体構造を考慮に入れたモデルについても考察した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

試験実験として行ったチトクロムcの実験データを詳細に解析し、論文としてまとめた(発表済)。また、ミオグロビンのいくつかの変異体に関する成果については、現在モデル計算を行い、論文としてまとめているところである。一部の変異体については安定な試料が得られていないが、変異体試料が不安定であることは当初から予想されていたことなので、そのための対策は考えてあり、現在はそれに沿って改善を図っているところである。

Strategy for Future Research Activity

不安定な変異体試料の安定化を図ること、また新しい変異体試料の作製を試みることのふたつの方向で、試料の種類を増やし、タンパク質内のエネルギー移動の異方性について詳細に調べていく。また、二次構造に特徴のあるさまざまなタンパク質について測定を行うことによって、エネルギー散逸の立体構造依存性を調べる。

  • Research Products

    (8 results)

All 2011 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (6 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Direct observation of vibrational energy flow in cytochrome C2011

    • Author(s)
      Yasuhisa Mizutani、Naoki Fujii
    • Journal Title

      J.Phys.Chem.B

      Volume: 115 Pages: 13057-13064

    • DOI

      10.1021/jp207500b

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 時間分解振動分光法で観えるもの、そして考えるもの2011

    • Author(s)
      水谷泰久
    • Organizer
      大阪大学蛋白質研究所セミナー「タンパク質科学の未来を語る:実験・理論研究者の対話」
    • Place of Presentation
      大阪大学会館講堂(大阪府)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-11-22
  • [Presentation] タンパク質内エネルギー散逸の時空間マッピング2011

    • Author(s)
      水谷泰久
    • Organizer
      シンポジウム「分子アンサンブル2011」
    • Place of Presentation
      理化学研究所(埼玉県)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-11-12
  • [Presentation] タンパク質内エネルギー散逸の時空間マッピング2011

    • Author(s)
      水谷泰久
    • Organizer
      分子研研究会「実験と理論による高次分子システムの機能発現の分子論的理解」
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-11-02
  • [Presentation] タンパク質内エネルギー散逸の時空間分解観測:ヒーター分子からの距離依存性2011

    • Author(s)
      水谷泰久
    • Organizer
      第5回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2011-09-23
  • [Presentation] Watching energy flow in hemeproteins2011

    • Author(s)
      Yasuhisa Mizutani
    • Organizer
      Telluride Science Research Center Workshop on Protein Dynamics
    • Place of Presentation
      Telluride Science Research Center, Colorado, USA(招待講演)
    • Year and Date
      2011-08-05
  • [Presentation] Watching energy flow in hemeproteins2011

    • Author(s)
      Yasuhisa Mizutani
    • Organizer
      Fifteenth International Conference on Time-resolved Vibrational Spectroscopy
    • Place of Presentation
      Centro Stefano Franscini, Monte Verit, Ascona, Switzerland
    • Year and Date
      2011-06-23
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.chem.sci.osaka-u.ac.jp/lab/mizutani/index-jp.html

URL: 

Published: 2013-06-26  

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