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2013 Fiscal Year Annual Research Report

外向き型及び内向き型バンド3/抗体複合体の三次元結晶構造解析

Research Project

Project/Area Number 23370049
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

小林 拓也  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (20311730)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 濱崎 直孝  長崎国際大学, 薬学部, 名誉教授 (00091265)
Project Period (FY) 2011-04-01 – 2014-03-31
Keywords赤血球 / アニオントランスポーター / バンド3 / X線結晶構造解析 / 抗体
Research Abstract

バンド3は赤血球膜タンパク質の25%を占める主要膜タンパク質であり、世界中でこれまで30年以上、多くの研究者によって研究がなされている。赤血球膜タンパク質バンド3は、陰イオン交換トランスポーター(Anion Exchanger)ファミリーの一員であり、塩化物イオン(Cl-)と重炭酸イオン(HCO3-)など一価の陰イオンを交換輸送することが知られている。バンド3 は分子量約100 KDaで、大きく二つのドメインから構成されている。バンド3は細胞質に突出したN末ドメイン(40kDa)を介して、アンキリンやスペクトリンなどの細胞骨格タンパク質ネットワークを細胞膜に繋ぎ止め、赤血球の形態を維持している。また、膜貫通部分であるC末ドメイン(55kDa)はCl-とHCO3-の交換反応を司り、炭酸脱水素酵素と協調して組織や細胞の必要酸素量を検出するメタボリックセンサーとして機能し、赤血球の酸素と二酸化炭素運搬に必須の役割を果たしている。従って、C末ドメインの構造異常は陰イオン透過活性だけでなく細胞膜裏打ちタンパク質ネットワーク全体の破綻にも結びついていると考えられる。実際、バンド3異常で溶血性貧血がおこる原因のかなりの部分が細胞膜貫通ドメインの不安定化と推測されている。我々はバンド3の膜貫通ドメインの立体構造を解明し、バンド3タンパクの陰イオン透過機構の解明を目的としている。これまでに分解能3.4オングストロームの電子密度図に対しモデル構築と精密化を進めてきた。しかし、今回の結晶構造では見えていない構造があり、分解能を向上させる必要が出てきた。外向き型バンド3の結晶構造をさらに高分解能で解明し、さらに内向き型バンド3の結晶構造も明らかにしたいと考えている。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (12 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 5 results) Book (3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] GPCRの立体構造から解き明かす生命科学2014

    • Author(s)
      小林拓也、岩田想
    • Journal Title

      実験医学増刊 羊土社

      Volume: Vol. 32, No. 10 Pages: 84-91

  • [Journal Article] Synthesis of photoreactive 2-phenethylamine derivatives - Synthesis of adenosine derivative enabling functional analysis of adenosine receptors by photoaffinity labeling.2013

    • Author(s)
      Murai Y. et al.
    • Journal Title

      Eur. J. Org. Chem.

      Volume: 2013 Pages: 2428-2433

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] G蛋白質共役受容体のX線結晶構造解析の進歩2013

    • Author(s)
      小林拓也
    • Journal Title

      血栓と循環 メディカルレビュー社

      Volume: Vol. 21, No. 3 Pages: 33-40

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Crystallization of human membrane proteins using antibody fragments.

    • Author(s)
      Kobayashi T.
    • Organizer
      Protein Island Matsuyama (PIM) International Symposium 2013
    • Place of Presentation
      Matsuyama
    • Invited
  • [Presentation] Crystallization of mammalian membrane proteins using antibody fragments.

    • Author(s)
      Kobayashi T.
    • Organizer
      4th International Symposium on Diffraction Structural Biology
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Invited
  • [Presentation] 機能性抗体を利用したGPCRのX線結晶構造解析への試み

    • Author(s)
      小林拓也
    • Organizer
      千里ライフサイエンスセミナー
    • Place of Presentation
      大阪市
    • Invited
  • [Presentation] GPCRのシグナル伝達分子機構の解明から創薬に向けて

    • Author(s)
      小林拓也
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Invited
  • [Presentation] GPCRのX線結晶構造解析と創薬に必要なGPCRの構造情報について

    • Author(s)
      小林拓也
    • Organizer
      よこはまNMR構造生物学研究会 第47回ワークショップ
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Invited
  • [Book] 「膜タンパク質」の重要性とその構造が拓く未来 膜タンパク質構造研究 最前線2013

    • Author(s)
      村田武士、小林拓也、野村紀通、岩田想
    • Total Pages
      pp. 1-10
    • Publisher
      化学同人
  • [Book] ムスカリン性アセチルコリン受容体の構造解析から創薬に向けて 膜タンパク質構造研究 最前線2013

    • Author(s)
      小林拓也
    • Total Pages
      pp. 19-25
    • Publisher
      化学同人
  • [Book] 膜タンパク質の発現と精製 「昆虫細胞による生産」 膜タンパク質構造研究 最前線2013

    • Author(s)
      浅田秀基、小林拓也
    • Total Pages
      pp. 96-102
    • Publisher
      化学同人
  • [Remarks] http://cell.mfour.med.kyoto-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2015-05-28  

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