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2012 Fiscal Year Annual Research Report

ヌクレオソームイメージングを用いたヒトゲノムクロマチンの細胞内ダイナミクスの解析

Research Project

Project/Area Number 23370078
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

前島 一博  国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 教授 (00392118)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2014-03-31
Keywordsゲノム / 遺伝学 / 核酸 / 生物物理
Research Abstract

24年度実績報告でも記述したように、全長2mにもおよぶヒトゲノムDNAは人体の設計図であり、ヒストンに巻かれてヌクレオソーム構造を作り、直径約10μmの細胞核のなかに折り畳まれている。最近、代表者はこのヌクレオソーム構造がとても不規則な形で 、核内や染色体内に折り畳まれていることを見出した。このことは、個々のヌクレオソームが規則的な構造として縛られず、ある範囲でダイナミックに動ける可能性を示唆する。このようなヌクレオソームの「ゆらぎ」に基づく動きが、遺伝子の発現、DNA複製、染色体凝縮などのゲノム機能に重要な役割を果たしていると思われる。本研究では、このことを実証するため、生細胞内のヌクレオソーム1分子の動きを直接イメージングする技術を開発し、ヒトゲノムクロマチンの細胞内ダイナミクスを明らかにする。24年度は以下の実験をおこなった。
PA-GFP-H4安定発現細胞のライブ観察と動きの解析
1分子観察には、徳永らが考案した細胞核内の1分子観察に適した斜光照明のシステム (Tokunaga et al., Nat. Methods, 2008)を用いた。はじめに固定したPA-GFP-H4安定発現細胞株を利用して、1分子の観察のための測定検討を行った。幸運なことに、代表者らは405 nmのレーザー刺激を行わなくても、PAGFP-H4の輝点を観察できることを見出した。おそらく、多数のPA-GFP-H4のうち、ごく少数は偶発的にPA-GFPが活性化したと考えられる。このようにして、固定した細胞を用いて観察条件を決定した。さらに1個1個のヌクレオソームの動きをトラッキングし、動いた距離を算出してその分布図を作製した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

生細胞のなかで、ヌクレオソームの動きを実際に観察し、その「ゆらぎ」を証明でき、論文としても報告した。

Strategy for Future Research Activity

当初の目的は達成された。今後は、その「ゆらぎ」の性質を細かく調べていく。また、今までPA-GFP-H4安定発現細胞のライブ観察をおこなっており、順調に結果が出た。その一方、ヒストンH4のN末テール部分はアセチル化、メチル化など多くの修飾が起こることが知られているため、PA-GFPによる立体障害によって、H4のN末テールの適切な修飾が起こらない可能性も否定できない。このため、H4の末側にPA-GFPを融合させたコンストラクトH4-PA-GFPを作製し、安定発現細胞を作製し、解析する。

  • Research Products

    (10 results)

All 2013 2012

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Chromosome Engineering Allows the Efficient Isolation of Vertebrate Neocentromeres.2013

    • Author(s)
      Shang, W.H.
    • Journal Title

      Dev Cell.

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      10.1016/j.devcel.2013.02.009

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 30nmクロマチン線維は存在しない!2013

    • Author(s)
      野崎慎
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 51 Pages: 177-182

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ヒトゲノムDNAの不規則で柔軟な収納原理2013

    • Author(s)
      前島一博
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 53 Pages: 4-10

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The organisation of genomic DNA in mitotic chromosomes: a novel view.2013

    • Author(s)
      Hideaki Takata
    • Journal Title

      Plant Genome Diversity

      Volume: 2 Pages: 33-34

    • DOI

      10.1007/978-3-7091-1160-4_3

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Local Nucleosome Dynamics Facilitate Chromatin Accessibility in Living Mammalian Cells.2012

    • Author(s)
      Saera Hihara
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 2 Pages: 1645-1656

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2012.11.008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chromosomes without a 30-nm chromatin fiber.2012

    • Author(s)
      Yasumasa Joti,
    • Journal Title

      Nucleus

      Volume: 3(5) Pages: 404-4

    • DOI

      10.4161/nucl.21222

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] How is a long strand of DNA organized in the cells?2012

    • Author(s)
      Kazuhiro Maeshima
    • Organizer
      Lorentz Center Workshop “Genome Mechanics at the Nuclear Scale”
    • Place of Presentation
      Leiden, Netherlands
    • Year and Date
      20121210-20121214
    • Invited
  • [Presentation] Human genome organization and dynamics.2012

    • Author(s)
      Kazuhiro Maeshima
    • Organizer
      Paradigm Innovation in Biology
    • Place of Presentation
      Academia Sinica ,Taipei,Taiwan
    • Year and Date
      20121016-20121019
    • Invited
  • [Presentation] Human genome organization and dynamics2012

    • Author(s)
      Kazuhiro Maeshima
    • Organizer
      第50 回日本生物物理学会年会 シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20120922-20120924
    • Invited
  • [Presentation] 分裂期染色体におけるDNAの収納2012

    • Author(s)
      前島一博
    • Organizer
      日本人類遺伝学会 第19回臨床細胞遺伝学セミナー
    • Place of Presentation
      東京慈恵会医科大学
    • Year and Date
      20120825-20120825
    • Invited

URL: 

Published: 2014-07-24  

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