2012 Fiscal Year Annual Research Report
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23370101
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| Research Institution | National Institute of Genetics |
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Principal Investigator |
斎藤 成也 国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 教授 (30192587)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
隅山 健太 国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 助教 (00370114)
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| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2014-03-31
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| Keywords | 生物進化 / 人類進化 |
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| Research Abstract |
比較ゲノム解析として、以下のふたつを行なった。（１）哺乳類のなかで、ヒトが属する霊長類と齧歯類のゲノムをそれぞれ２種ずつ比較し、系統特異的に高度に保存されている非コード領域を多数発見した。それらの周辺に位置するタンパク質コード遺伝子は系統ごとに異なっており、またそれらの機能は、肉眼形態を発生により生じるのにかかわる転写因子が多かった。この成果はTakahashi & Saitou (2012; Genome Biology and Evolution)に発表した。（２）ヒトが属する脊椎動物の共通祖先で生じたと考えられている２回のゲノム重複により生じた非コード領域の重複領域がオーソログとして全脊椎動物で保存されており、しかもパラログ間でも保存されているものを大規模ゲノム解析により３０９個を見いだした。その１／３は脳での遺伝子発現調節にかかわっていた。この成果はMatsunami & Saitou (2013; Genome Biology and Evolution)に発表した。
トランスジェニック実験としては、哺乳類特有の遺伝子間領域保存配列として、SINE由来の配列について機能解析を行った。この結果、前脳でのfgf8遺伝子発現制御に関与する因子であることがわかり、詳細な機能解析を行ない、Nakanishi, Kobayashi, Suzuki-Hirano, Nishihara, Sasaki, Hirakawa, Sumiyama, Shimogori, & Okada (2012; PLoS ONE)に発表した。また、有胎盤類の特徴的な機能の一つである胎盤発生に関与するHOXA13遺伝子の制御配列が保存配列としてシーラカンスにも見いだされることを発見し、現在その祖先機能の解析を進めている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
ゲノム配列の比較解析やトランスジェニック実験は順調に進んでいるが、ヒト特異的変化を伴う調節領域データベースの構築とC h I P - s e q データに基づくヒト特異的転写調節領域の抽出は現在取り組んでいるところである。
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| Strategy for Future Research Activity |
最終年度なので、ゲノム配列の比較解析、トランスジェニック実験、ヒト特異的変化を伴う調節領域データベースの構築、C h I P - s e q データに基づくヒト特異的転写調節領域の抽出の４項目すべてについて、研究目的にしたがって完成させる。
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