2014 Fiscal Year Annual Research Report
Project/Area Number |
23380030
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Research Institution | Iwate University |
Principal Investigator |
佐原 健 岩手大学, 農学部, 教授 (30241368)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鈴木 剛 大阪教育大学, 教育学部, 教授 (10314444)
安河内 祐二 独立行政法人農業生物資源研究所, その他部局等, 研究員 (50355723)
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Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2015-03-31
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Keywords | BAC-FISH / 遺伝子マッピング / ヒゲナガカワトビケラ / ゲノム比較 |
Outline of Annual Research Achievements |
盛岡周辺の河川において採集した毛翅目昆虫のヒゲナガカワトビケラ蛹個体からHMW-DNAプラグを作製した。制限酵素処理とそのパルスフィールド電気泳動(PFGE)結果からBACライブラリー作製が可能である純度を持つと判断された。PFGEゲルより2種類のHMW-DNAを切り出し、エレクトロポレーションにての形質転換を行った。3種類の方法で作製されたBACクローンは合計で、42,468形質転換コロニーが得られ、それぞれ32クローンのインサートサイズを求めた。インサートがないか極めて短いと判断された4クローンを除き、92クローンの平均インサートサイズは65.2Kbであった。最終的に32,256のシングルコロニーを385ウエルプレート84枚にストックし、ヒゲナガカワトビケラライブラリーが完成した。 ヒゲナガワカトビケラcDNAライブラリーの配列情報から260個のカイコ単一遺伝子のヒゲナガカワトビケラオルソログを特定し、STSプライマーを用いたPCRによって57BACを選抜した。これらBACを用いて、Z染色体と12常染色体を同定し、さらに、毛翅目昆虫で初となるカリオタイプに成功した。ヒゲナガカワトビケラBAC-FISHマッピングデータとカイコゲノム情報に基づき、両者の染色体対応関係を明らかにした。 ヒゲナガカワトビケラ卵原細胞と精原細胞の分裂中期における染色体数は、それぞれ2n=25とn=26とカウントされた。上記のZ染色体を同定できるBACを用いたFISHより、雌減数分裂における性染色体はユニバレントを形成しており、本種の性染色体構成が雌ではZ、雄ではZZであると判明した。これは雌雄における染色体数の差異と一致する結果である。
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Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Plant omics data center: an integrated web repository for interspecies gene expression networks with NLP-based curation.2015
Author(s)
Ohyanagi H, Takano T, Terashima S, Kobayashi M, Kanno M, Morimoto K, Matsumura H, Sasaki Y. Aya K, Suwabe K, Suzuki G, Watanabe M, Matsuoka M, Yokoyama K, Yano K.
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Journal Title
Plant and Cell Physiology
Volume: 56
Pages: e9
DOI
Peer Reviewed
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