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2012 Fiscal Year Annual Research Report

ダイズの根粒・菌根二重共生系の成立に関与する宿主遺伝子の網羅的解析

Research Project

Project/Area Number 23380042
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

坂本 一憲  千葉大学, 園芸学研究科, 教授 (10225807)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2014-03-31
Keywords遺伝子 / 植物 / 土壌学 / 微生物 / マイクロアレイ
Research Abstract

前年度のマイクロアレイ解析で明らかになった二重共生特異的遺伝子の中から,重要な遺伝子としてType1メタロチオネイン(MT1)遺伝子を選び,その特性を調べた.
(1)MT1遺伝子の発現量の変化
ダイズ品種エンレイをポット栽培し,根から抽出したtotal RNA試料を逆転写しcDNAを合成した.このcDNA試料を10倍づつ5段階に希釈した.MT1遺伝子の塩基配列をダイズ完全長cDNA配列データベースから取得し,プライマー設計ソフトを用いてMT1遺伝子を特異的に増幅するプライマーを設計した.このプライマーを用いて各希釈段階の試料についてリアルタイムPCRを行い,相対的発現量を求めた.その結果,MT1遺伝子は菌根菌を単独で接種した場合が最も高く発現すること,次いで根粒での発現が高いことが判明した.またダイズの生育が進行するにつれて発現が変化することもわかった.
(2)MT1遺伝子の発現部位の解析
本実験ではAgrobacterium rhizogenes 株を用いてMT1遺伝子のプロモーター配列とGUS遺伝子との融合タンパク質を発現するダイズの毛状根形質転換体の作製をおこなった.バーミキュライト培土にエンレイ種子を播種し2週間人工気象器内でポット栽培した.その後エンレイの下胚軸にA. rhizogenes 株を接種し接種部分が培土に埋まるようにして3週間生育させた.その結果,ダイズ根に毛状根を発生させることに成功した.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

予定どおり重要な二重共生特異的遺伝子としてType1メタロチオネイン遺伝子を見い出すことができ,本遺伝子の発現特異性を明らかにすることができた.発現部位の解析についてはAgrobacterium rhizobium株を用いてダイズに毛状根を発生させることができたが,実際の発現部位解析は次年度に持ち越すこととなった.

Strategy for Future Research Activity

まずメタロチオネイン遺伝子の発現ベクターを開発し,ダイズ根における遺伝子発現部位を明らかにする.また初年度のマイクロアレイ解析の結果からオートレギュレーション機構に関与する二重共生特異的遺伝子を明らかにし,その発現の特性と局在性を明らかにする.以上の実験結果を持って3年間の研究のまとめをおこなう.

  • Research Products

    (4 results)

All 2012

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Complete genomic sequence of Bradyrhizobium sp. S23321: insights into symbiosis evolution in soil oligotrophs2012

    • Author(s)
      Okubo, T.
    • Journal Title

      Microbes and Environments

      Volume: 27 Pages: 306-315

    • DOI

      doi:10.1264/jsme2.ME11321

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 屋上緑化薄層基盤軽量土壌の経年変化および栄養塩類の推移2012

    • Author(s)
      黒沼尊紀
    • Journal Title

      日本緑化工学会誌

      Volume: 38 Pages: 51-55

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ダイズの根粒共生系と菌根共生系で発現する宿主遺伝子の網羅的解析(第2報)単独共生と二重共生の比較2012

    • Author(s)
      坂本一憲
    • Organizer
      日本土壌肥料学会
    • Place of Presentation
      鳥取大学(鳥取市)
    • Year and Date
      20120904-20120906
  • [Presentation] 亜鉛添加および共生微生物の感染がダイズのメタロチオネイン遺伝子の発現に及ぼす影響2012

    • Author(s)
      上野満
    • Organizer
      日本土壌肥料学会
    • Place of Presentation
      鳥取大学(鳥取市)
    • Year and Date
      20120904-20120906

URL: 

Published: 2014-07-24  

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