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2014 Fiscal Year Annual Research Report

トランス翻訳の分子機構と生理機能

Research Project

Project/Area Number 23380045
Research InstitutionHirosaki University

Principal Investigator

武藤 あきら  弘前大学, 農学生命科学部, 研究員 (80034635)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 姫野 俵太  弘前大学, 農学生命科学部, 教授 (80208785)
Project Period (FY) 2011-04-01 – 2015-03-31
KeywordstmRNA / tRNA / mRNA / トランス翻訳 / リボソーム / 大腸菌 / 枯草菌
Outline of Annual Research Achievements

本研究は細菌におけるtmRNAによるトランス翻訳機構の (1)分子機構の詳細と、(2)新しい生理機能の解明を目的としている。(1) トランス翻訳の分子機構の解明を、主にtmRNA、SmpBとリボソームとの相互作用の面から、ヒドロキシラジカル反応等を用いて解析を行い一定の成果を出してきた。トランス翻訳は タンパク質合成が停滞したリボソームを解放する働きを持つが、本年度はそれと同様の働きを持つことが示唆されているArfAに関してもtmRNA-SmpBの場合と同様の解析を行った。すなわち、各反応のステップを精製した成分を用いてin-vitro系で再現し、各ステップでのArfAのリボソーム上での相互作用位置を ヒドロキシラジカル反応等で決定した。その結果ArfAはmRNAのない30SリボソームのA-site側のmRNA-channelにRF2の結合後に結合することを明らかにした。また同様の働きを持つYaeJについても解析中である。(2)我々が単離した枯草菌のtmRNA依存性温度感受性株(セリルtRNA合成酵素遺伝子(SerS)の変異でtmRNA存在下でのみ増殖が阻害 される)は、その新奇の表現系を従来のトランス翻訳の働きでは説明することが難しい。昨年度はこの変異株から回復株(高温での増 殖が回復する)を多数単離し、それらの変異を(1)tmRNA遺伝子、(2)SerS遺伝子、および(3)それ以外の部位の変異に分類した。本年 度は、それらのうち(3)のintergenic suppressor変異に焦点をしぼり、transformationの手法を用いてその変異部位(遺伝子)の特定 を行った。まだ最終結果は出ていない。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (8 results)

All 2015 2014

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Structural insights into the assembly of the 30S ribosomal subunit in vivo: functional role of S5 and location of the 17S rRNA precursor sequence.2014

    • Author(s)
      Yang, Z., Guo, Q., Goto, S., Chen, Y., Li, N., Yan, K., Zhang, Y., Muto, A., Deng, H., Himeno, H., Lei, J. & Gao, N.:
    • Journal Title

      Protein Cell,

      Volume: 5 Pages: 394-407

    • DOI

      0.1007/s13238-014-0044-1

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] tmRNA-mediated trans-translation as the major ribosome rescue system in a bacterial cell.2014

    • Author(s)
      Himeno, H., Kurita, D. & Muto, A.
    • Journal Title

      Frontiers Genet.

      Volume: 5 Pages: 66-74

    • DOI

      10.3389/fgene.2014.00066

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Rejection of tmRNA• SmpB after GTP hydrolysis by EF-Tu on ribosomes stalled on intact mRNA.2014

    • Author(s)
      Kurita, D., Miller, M., Muto, A., Buskirk, A. & Himeno, H.
    • Journal Title

      RNA

      Volume: 20 Pages: 1706-1714

    • DOI

      10.1261/rna.045773.114. Epub 2014 Sep 22.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] ArfA recognizes the lack of mRNA in the mRNA channel after RF2 binding for ribosome rescue.2014

    • Author(s)
      Kurita, D., Chadani, Y., Muto, A., Abo, T. & Himeno, H.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.

      Volume: 42 Pages: 13339-13352

    • DOI

      10.1093/nar/gku1069. Epub 2014 Oct 29

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Ribosome rescue systems in bacteria. Biochimie2014

    • Author(s)
      Himeno, H., Nameki, N., Kurita, D., Muto, A. & Abo T.
    • Journal Title

      Biochimie

      Volume: pii: S0300-9084(14) Pages: 00355-1.

    • DOI

      10.1016/j.biochi.2014.11.014. [Epub ahead of print] )

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] ArfAとRF2による翻訳停滞リボソームの解消機構の解明2015

    • Author(s)
      栗田大輔、武藤昱、阿保達彦、姫野俵太
    • Organizer
      第3回リボソームミーティング
    • Place of Presentation
      宮崎市
    • Year and Date
      2015-03-17 – 2015-03-18
  • [Presentation] 大腸菌における翻訳不完全性がもたらす塩耐性獲得機構の解明2014

    • Author(s)
      伊藤汐音、樽澤武房、後藤史門、武藤あきら、姫野俵太
    • Organizer
      第11回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      盛岡市
    • Year and Date
      2014-06-05 – 2014-06-06
  • [Presentation] 大腸菌30S サブユニットの生合成後期に関与する一連の因子について2014

    • Author(s)
      後藤史門、武藤昱、姫野俵太
    • Organizer
      第11回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      盛岡市
    • Year and Date
      2014-06-05 – 2014-06-06

URL: 

Published: 2016-06-10  

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