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2015 Fiscal Year Annual Research Report

セレン含有タンパク質生合成に関わるセレン特異的化学変換機構の解明

Research Project

Project/Area Number 23380060
Research InstitutionRitsumeikan University

Principal Investigator

三原 久明  立命館大学, 生命科学部, 教授 (30324693)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2016-03-31
Keywordsセレン / 蛋白質 / 酵素 / 必須微量元素 / セレン蛋白質
Outline of Annual Research Achievements

Pseudomonas sp. F2a株のゲノムを抽出し、次世代シーケンサー(Illumina)により全ゲノムを解読した。得られたゲノム情報を基にバイオインフォマティックス解析を行った結果、F2a株はゲノム上に6種類のWCxxCモチーフを持つTrxホモログ (Trx171、286、303、2244、2288、2399) が存在することを見出した。次に、F2a株のゲノムDNAを鋳型にして、PCRにより各遺伝子を増幅し、pColdIに連結することで、各trxの高発現プラスミドを作製した。本プラスミドによりE. coli BL21(DE3)を形質転換し、Hisタグ融合タンパク質として各Trxタンパク質を高発現させ、精製タンパク質として各々のTrx活性を調べた。一方で、E. coliのtrxA 欠損株を用いた補完実験により、6種類のTrxホモログがセレンタンパク質生合成に与える影響をin vivoで調べた。発色試薬であるベンジルビオロゲンが、E. coliにおける唯一のセレンタンパク質であるギ酸脱水素酵素依存的に還元されることで菌体が紫色を呈する。この特性を利用し、セレンタンパク質合成能を可視的に評価した。その結果、Trx2244とTrx2399を導入した株ではE. coliのtrxA 欠損株を補完できた。また、Trx171を導入した株では長時間の反応により補完が認められ、他の3種のTrxでは補完できなかった。この結果より、F2a株の持つ6種類Trxホモログの内3種類がE. coliのTrxAと同様にセレンタンパク質合成に関与することが強く示唆された。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (16 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Thapar University(India)

    • Country Name
      India
    • Counterpart Institution
      Thapar University
  • [Journal Article] Purification and properties of 4-methyl-5-hydroxyethylthiazole kinase from Escherichia coli2016

    • Author(s)
      Tani, Y., Kimura, K., and Mihara, H.
    • Journal Title

      Biosci Biotechnol Biochem

      Volume: 80 Pages: 514-517

    • DOI

      10.1080/09168451.2015.1104239

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Heterologous expression of L-lysine alpha-oxidase from Scomber japonicus in Pichia pastoris and functional characterization of the recombinant enzyme2015

    • Author(s)
      Tani, Y., Omatsu, K., Saito, S., Miyake, R., Kawabata, H., Ueda, M., and Mihara, H.
    • Journal Title

      J Biochem

      Volume: 157 Pages: 201-210

    • DOI

      10.1093/jb/mvu064

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional expression of L-lysine alpha-oxidase from Scomber japonicus in Escherichia coli for one-pot synthesis of L-pipecolic acid from DL-lysine2015

    • Author(s)
      Tani, Y., Miyake, R., Yukami, R., Dekishima, Y., China, H., Saito, S., Kawabata, H., and Mihara, H.
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol

      Volume: 99 Pages: 5045-5054

    • DOI

      10.1007/s00253-014-6308-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Purification and Properties of Glycine Oxidase from Pseudomonas putida KT24402015

    • Author(s)
      Equar, M. Y., Tani, Y., and Mihara, H.
    • Journal Title

      J Nutr Sci Vitaminol

      Volume: 61 Pages: 506-510

    • DOI

      10.3177/jnsv.61.506

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Bacillus sp. NTP-1株由来マンガンカタラーゼ様タンパク質の機能解析2016

    • Author(s)
      梅村晃弘, 戸部隆太, 田島寛隆, 三原久明
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-29
  • [Presentation] Pseudomonas putida由来D-リジントランスポーターの基質結合タンパク質の解析2016

    • Author(s)
      山内美咲, 青木志帆, 近藤和貴, 佐藤大起, 戸部隆太, 三原久明
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-29
  • [Presentation] Properties of aspartate aminotransferase from the thermophilic alkaliphilic bacterium Thermobacillus composti2016

    • Author(s)
      Kido, A., Tobe, R., and Mihara, H.
    • Organizer
      Institute for Chemical Research International Symposium 2016
    • Place of Presentation
      京都大学(京都府宇治市)
    • Year and Date
      2016-03-07
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Characterization of a novel putative porin of the metal-reducing bacterium Geobacter sulfurreducens2016

    • Author(s)
      Jahan, M. I., Tobe, R., and Mihara, H.
    • Organizer
      Institute for Chemical Research International Symposium 2016
    • Place of Presentation
      京都大学(京都府宇治市)
    • Year and Date
      2016-03-07
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] システインデスルフラーゼを用いたCdSナノ粒子の酵素的合成2016

    • Author(s)
      綾田真人, 戸部隆太, 田島寛隆, 三原久明
    • Organizer
      日本農芸化学会関西支部第493回講演会
    • Place of Presentation
      京都大学楽友会館(京都府京都市)
    • Year and Date
      2016-02-06
  • [Presentation] Geobacter sulfurreducens におけるマルチヘムセレンタンパク質の機能解析2015

    • Author(s)
      松嵜佑樹, 杉山慧, 嶌本奈々, 戸部隆太, 谷泰史, 三原久明
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸国際展示場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-03
  • [Presentation] 細菌におけるセレノリン酸合成酵素へのセレン基質供給系の解析2015

    • Author(s)
      清水敦貴, 波北悟, 戸部隆太, 田村隆, 三原久明
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸国際展示場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-02
  • [Presentation] Characterization of a novel putative porin of the metal-reducing bacterium Geobacter sulfurreducens2015

    • Author(s)
      Mihara, H.
    • Organizer
      The 5th International Selenium Seminar (ISS2015)
    • Place of Presentation
      Yaroslavl (Russia)
    • Year and Date
      2015-09-23
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] インドセレン蓄積地帯の土壌より単離したCellulomonas sp. D3aの亜セレン酸還元特性2015

    • Author(s)
      田島寛隆, 山際恭平, 大内田竜大, 山本紘資, 名田イサナ, 谷泰史, 斎藤茂樹, 峯元高志, Prakash, N. T., 三原久明
    • Organizer
      第26回日本微量元素学会学術集会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2015-07-04
  • [Presentation] 細菌におけるセレン・テルルの代謝2015

    • Author(s)
      三原久明
    • Organizer
      第42回日本毒性学会学術年会
    • Place of Presentation
      ホテル日航金沢(石川県金沢市)
    • Year and Date
      2015-07-01
    • Invited
  • [Remarks] 研究者データベース

    • URL

      http://research-db.ritsumei.ac.jp/Profiles/64/0006361/profile.html

URL: 

Published: 2017-01-06  

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