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2011 Fiscal Year Annual Research Report

消化管癌におけるマイクロRNAおよびエピゲノム異常の解析とその臨床応用

Research Project

Project/Area Number 23390200
Research InstitutionSapporo Medical University

Principal Investigator

篠村 恭久  札幌医科大学, 医学部, 教授 (90162619)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山本 博幸  札幌医科大学, 医学部, 講師 (40332910)
鈴木 拓  札幌医科大学, 医学部, 助教 (20381254)
能正 勝彦  札幌医科大学, 医学部, 助教 (10597339)
Keywords消化管癌 / GIST / マイクロRNA / エピゲノム / miR-196a / HOTAIR
Research Abstract

消化管間質腫瘍(GIST)におけるmicroRNA (miRNA)発現プロファイルを解析し、悪性度および予後予測マーカーとなりうる知見を得ることを目的とした。
新鮮凍結GIST検体(n=64)およびパラフィン切片(n=100)を解析対象とした。miRNAマイクロアレイ(Agilent)を用いて32例のGISTにおけるmiRNA発現プロファイルを解析した。TaqMan RT-PCRによりmiRNA発現を検証した。また、遺伝子発現アレイおよびarray CGH解析を行い、miRNA発現と比較した。
マイクロアレイ解析の結果、GISTは染色体14qのmiRNAクラスターの高発現群と低発現群に大別され、かつこれらのmiRNA発現は14q欠失と逆相関したが、悪性度とは相関しなかった。リスク分類ごとのmiRNA発現パターンを解析した結果、high-risk群において有意に高発現しているmiR-196aを同定した。miR-196aの高発現は転移および予後不良と強く相関した。遺伝子発現アレイの結果、miR-196aが存在するHOXCクラスター遺伝子群およびlncRNAであるHOTAIRが、miR-196aと同時に高発現していることが明らかとなった。HOTAIRの高発現もまた、GISTのhigh-risk群に高頻度であり、転移および予後不良と相関した。
miR-196aはGISTの高悪性度群の予後診断マーカーとなる可能性が示された。miR-196aおよびHOTAIRは、GIST悪性化のメカニズムに関与していることが示唆され、診断および治療の分子標的となりうると考えられた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

GISTにおけるmiRNA発現プロファイルを解析し、miR-196aおよびHOTAIRが、悪性度および予後予測マーカーとなりうるという知見を得ることができた。同様のストラテジーにて、大腸癌および前癌病変である腺腫に関し、多数の症例を対象に、発癌早期に関わるmiRNAおよびエピゲノム異常を解析中である。胃癌に関しても早期胃癌検体を対象に順調に進展している。

Strategy for Future Research Activity

順調に進展しているGIST、大腸癌および腺腫に加え、早期胃癌の解析を推し進め、大腸および胃発癌早期に関わるmiRNAおよびエピゲノム異常を明らかにし、分子マーカーを開発する。

  • Research Products

    (25 results)

All 2012 2011

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (18 results)

  • [Journal Article] Upregulation of miR-196α and HOTAIR drive malignant character in gastrointestinal stromal tumors2012

    • Author(s)
      Niinuma T, et al
    • Journal Title

      Cancer Res

      Volume: 72 Pages: 1126-1136

    • DOI

      10.1158/0008-5472.CAN-11-1803

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Aberrant DNA methylation associated with aggressiveness of gastrointestinal stromal tumour2012

    • Author(s)
      Okamoto Y, et al
    • Journal Title

      Gut

      Volume: 61 Pages: 392-401

    • DOI

      10.1136/gut.2011.241034

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A novel pit pattern identifies the precursor of colorectal cancer derived from sessile serrated adenoma2012

    • Author(s)
      Kimura T, et al
    • Journal Title

      Am J Gastroenterol

      Volume: 107 Pages: 460-469

    • DOI

      10.1038/aig.2011.457

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Epigenetic alteration of DNA in mucosal wash fluid predicts invasiveness of colorectal tumors2011

    • Author(s)
      Kamimae S, et al
    • Journal Title

      Cancer Prev Res

      Volume: 4 Pages: 674-683

    • DOI

      10.1158/1940-6207.CAPR-10-0214

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Epigenetic inactivation of calcium-sensing receptor in colorectal carcinogenesis2011

    • Author(s)
      Hizaki K, et al
    • Journal Title

      Mod Pathol

      Volume: 24 Pages: 876-884

    • DOI

      10.1038/modpathol.2011.10

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Co-expression of laminin ss3 and Y2 chains and epigenetic inactivation of laminin α3 chain in gastric cancer2011

    • Author(s)
      Ii M, et al
    • Journal Title

      Int J Oncol

      Volume: 39 Pages: 593-599

    • DOI

      10.3892/ijo.2011.1048

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide profiling of chromatin signatures reveals epigenetic regulation of MicroRNA genes in colorectal cancer2011

    • Author(s)
      Suzuki H, et al
    • Journal Title

      Cancer Res

      Volume: 71 Pages: 5646-5658

    • DOI

      10.1158/0008-5472.CAN-11-1076

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 大腸癌のLINE-1メチル化レベルと悪性度の関係-LINE-1 extreme hypomethy lator phenotype (LEHP)は新たなphenotypeとなるか?-2012

    • Author(s)
      能正勝彦, 他
    • Organizer
      第8回日本消化管学会総会学術集会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2012-02-11
  • [Presentation] GISTの悪性度マーカーおよび治療標的としてのnon-coding RNA2012

    • Author(s)
      新沼猛, 他
    • Organizer
      第8回日本消化管学会総会学術集会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2012-02-11
  • [Presentation] 胃癌におけるエピジェネティックな遺伝子異常の網羅的解析2012

    • Author(s)
      高丸博之, 他
    • Organizer
      第8回日本消化管学会総会学術集会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2012-02-10
  • [Presentation] エピゲノム的アプローチからみた未分化型胃がん発生の分子機構2012

    • Author(s)
      鈴木亮, 他
    • Organizer
      第8回日本消化管学会総会学術集会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2012-02-10
  • [Presentation] 大腸癌の前癌病変におけるジェネティック・エピジェネティックな異常と臨床応用2012

    • Author(s)
      山本英一郎, 他
    • Organizer
      第8回日本消化管学会総会学術集会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2012-02-10
  • [Presentation] 大腸癌におけるmicroRNA遺伝子のエピジェネティックな制御の網羅的解析2011

    • Author(s)
      鈴木拓, 他
    • Organizer
      第22回日本消化器癌発生学会総会
    • Place of Presentation
      佐賀
    • Year and Date
      2011-11-25
  • [Presentation] 胃癌におけるエピジェネティックな遺伝子異常の網羅的解析2011

    • Author(s)
      高丸博之, 他
    • Organizer
      第22回日本消化器癌発生学会総会
    • Place of Presentation
      佐賀
    • Year and Date
      2011-11-25
  • [Presentation] 大腸癌におけるIGF2 DMRのメチル化レベルの低下と臨床病理学・分子生物学的因子との関係2011

    • Author(s)
      能正勝彦, 他
    • Organizer
      第19回日本消化器関連学会週間
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2011-10-22
  • [Presentation] 消化管間質腫瘍におけるmicroRNA発現プロファイル解析2011

    • Author(s)
      新沼猛, 他
    • Organizer
      第19回日本消化器関連学会週間
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2011-10-20
  • [Presentation] DNAメチル化異常の網羅的な解析による新規胃癌関連遺伝子の検索2011

    • Author(s)
      高丸博之, 他
    • Organizer
      第19回日本消化器関連学会週間
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2011-10-20
  • [Presentation] 大腸発癌におけるSerrated pathwayの重要性とfield cancerization2011

    • Author(s)
      能正勝彦, 他
    • Organizer
      第61回日本体質医学会総会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2011-10-09
  • [Presentation] LINE-1 extreme hypomethylator phenotypeは生物学的悪性度が高く、新しい大腸癌のphenotypeになりうる2011

    • Author(s)
      能正勝彦, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] マイクロサテライト不安定性陽性ヒト癌におけるマイクロRNA生合成経路に関わる新たな遺伝子異常:同定と臨床応用2011

    • Author(s)
      山本博幸, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] 胃癌におけるエピジェネティックな遺伝子異常の網羅的解析2011

    • Author(s)
      高丸博之, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2011-10-03
  • [Presentation] 大腸癌のエピゲノム解析による癌関連miRNA遺伝子の同定2011

    • Author(s)
      鈴木拓, 他
    • Organizer
      第31回日本分子腫瘍マーカー研究会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2011-10-02
  • [Presentation] Epigenetic silencing of calcium-sensing receptor (CASR) plays an important role in human colorectal carcinogenesis2011

    • Author(s)
      須河恭敬, 他
    • Organizer
      第9回日本臨床腫瘍学会学術集会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011-07-23
  • [Presentation] 大腸癌の新規バイオマーカーとしてのIGF2 DMRのメチル化レベルの可能性2011

    • Author(s)
      能正勝彦, 他
    • Organizer
      第15回日本がん分子標的治療学会学術集会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2011-06-24
  • [Presentation] 大腸癌のinsulin-like growth factor 2 (IGF2) DMRのメチル化レベルとそれを標的とした個別化治療の可能性2011

    • Author(s)
      能正勝彦, 他
    • Organizer
      第20回日本癌病態治療研究会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2011-06-17

URL: 

Published: 2013-06-26  

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