2012 Fiscal Year Annual Research Report
次世代質量分析と網羅的遺伝子発現解析による消化器癌の新規バイオマーカーの研究
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23390320
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| Research Institution | University of Toyama |
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Principal Investigator |
嶋田 裕 富山大学, 大学院医学薬学研究部(医学), 准教授 (30216072)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
塚田 一博 富山大学, 大学院医学薬学研究部(医学), 教授 (90171967)
奥村 知之 富山大学, 大学院医学薬学研究部(医学), 助教 (10533523)
有馬 美和子 埼玉県立がんセンター, 臨床腫瘍研究所, 副部長 (00312950)
安部 哲也 愛知県がんセンター, 研究所, 医長 (90378092)
門馬 久美子 東京都立駒込病院, 内視鏡科, 部長 (70509471)
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| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2014-03-31
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| Keywords | バイオマーカー / 早期発見 / 食道癌 / miRNA / 質量分析 |
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| Research Abstract |
まず、検体採取法について検討し、アプロチニン含有スピッツによる解析ではヒト以外の動物腫のタンパク質やmiRNAが混在することが判明したことから、EDTA含有スピッツでの採取を採用した。
研究は多施設共同研究とし、内視鏡にて完全切除が期待される食道早期癌で同時性他臓器との重複癌は除外する患者を対照とした。なお内視鏡切除が可能であれば食道内多発、前がん病変の有無および患者の全身状態は問わないこととした。当院を含めて4施設で倫理委員会の承認が得られ研究を開始しており現在まで3施設での24例の登録が終了し、サンプルの京大への搬送が終了している。本年度までの臨床情報は既に我々の施設で集計がなされており、昨年度の患者さんの経過追跡も完了している。
次世代質量分析器が期待していた網羅的解析には不向きであるが、糖鎖抗原の解析に優れていることが判明したことから、質量分析の対象としては我々が見いだしたFGFRLの蛋白での解析を目指して、糖鎖抗原について解析を行っている。またFGFRLについては抗体作製を行い、食道癌細胞株での増殖抑制効果のある抗体が数種類得られている。網羅的組織アレイの検討では消化管全般にわたって発現しており有力なターゲットと考えている。検出用にELIZAレベルでの検討も目指している。
一方、血中miRNA解析ではマイクロアレイ解析とPCR解析の解離があり、まだ解析方法を絞り込めていない。なお、Multiple RT-PCRについては、我々が見いだしたmir210を含めた解析を検討している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
多施設共同研究で本学と他の2施設で検体採取が始まっているがまだ開始されていない施設が1施設存在する。食道癌におけるターゲット蛋白候補がまだ絞り込めていない。血中miRNAの検出にはマイクロアレイでの再現性に問題がありmulti RT-PCRを平行して検討している。次世代質量分析器は「最先端研究」での食道関係の解析を止められてしまったために難渋している。バイオマーカーの候補タンパク質としてFGFRL1の抗体を作成し、細胞株に対して抑制効果のある抗体を数種作成できた
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| Strategy for Future Research Activity |
次年度には4施設で検体採取を可能としたい。必要があれば共同研究施設を追加する。miRNAの解析法を出来るだけ早く決定し解析を開始する予定であるが。貴重なサンプルであり、見切り発車により無駄にしないように、慎重に検討をすすめる。
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Research Products
(8 results)
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[Journal Article] Critical role for the receptor tyrosine kinase EPHB4 in esophageal cancers2012
Author(s)
Hasina R, Mollberg N, Kawada I, Mutreja K, Kanade G, Y ala S, Surati M, Liu R, Li X, Zhou Y, Ferguson BD, Nallasura V, Cohen KS, Hyjek E, Mueller J, Kanteti R, El Hashani E, Kane D, Shimada Y, Lingen MW, Husain AN, Posner MC, Waxman I, Villaflor VM, Ferguson MK, V articovski L, V okes EE, Gill P, Salgia R
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Journal Title
Cancer Res
Volume: 73
Pages: 184-194
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[Presentation] Identification of microRNAs which regulate stem cell property in esophageal squamous cell carcinoma2012
Author(s)
Okumura T , Shimada Y, Sekine S, Moriyama M, Omura T , Kamiyama K, Hori R, Watanabe T , Hojo S, Matsui K, Y oshioka I, Sawada S, Y oshida T , Nagata T , Tsukada K
Organizer
The 2012 ISDE congress
Place of Presentation
Venice (Italy)
Year and Date
2012-10-16
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