2012 Fiscal Year Annual Research Report
ハイスループット遺伝子解読システムを用いたタイ国における病原ウイルスの網羅的探索
| Project/Area Number |
23406033
|
|---|
| Section | 海外学術 |
|---|
| Research Institution | Kyoto Prefectural University of Medicine |
|---|
Principal Investigator |
中屋 隆明 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (80271633)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大道寺 智 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (80432433)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2014-03-31
|
| Keywords | メタゲノム / タイ王国 / 感染症 / ハイスループットシーケンサー / ウイルス |
|---|
| Research Abstract |
本研究は、従来に比べて圧倒的な性能をもつ最先端遺伝子解読システムを、ウイルス感染症研究に導入することにより、新規病原ウイルス（ゲノム）の検出を目指すとともに、感染症の病態およびそのダイナミズムをこれまでとは異なる次元で捉えようとするものである。
タイ国保健省医科学局（DMSc）と共同研究体制を構築し、人獣共通感染症を含む様々な新興・再興ウイルスの発生が報告されている“東南アジア”を研究対象地域とする。同国における原因不明な各種重症感染症患者の臨床検体について、病原ウイルスを網羅的に探索するメタゲノミック診断を行い、新規病原ウイルスの発見を目指す。
平成23年度は原因不明肺炎36検体のメタゲノム解析を行い、36検体中15検体において、ウイルスゲノム断片を検出した。平成24年度はタイ国DMScよりNuanjun Wichukchinda博士を招いて、解析結果について議論し、投稿論文（共著）として発表することを確認し、現在論文の作成に取り掛かっている。また、検出されたウイルス遺伝子のゲノム解析、特にその中のライノウイルスの全ゲノム配列を解読する計画である。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
タイ国における呼吸器検体のウイルスメタゲノム解析を行い、予想以上の成果を上げることができた。さらにこの成果を投稿論文として発表することをタイ国の共同研究者と確認することができた。
|
| Strategy for Future Research Activity |
投稿論文の発表に向けて準備を進める。併せて新しいハイスループット遺伝子解析装置（IonPGM）を導入したことにより、再度臨床検体を解析し、より精度の高いメタゲノム解析ができると考えている。
|
-
[Journal Article] Human Monoclonal Antibodies Broadly Neutralizing against Influenza B Virus.2013
Author(s)
Yasugi M, Kubota-Koketsu R, Yamashita A, Kawashita N, Du A, Sasaki T, Nishimura M, Misaki R, Kuhara M, Boonsathorn N, Fujiyama K, Okuno Y, Nakaya T, Ikuta K.
-
Journal Title
PLoS Pathogen
Volume: 9
Pages: e1003150
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-
-
-
