オキサゾロン連続クラスター損傷に関する突然変異および修復反応の解析

2014 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 23510069
• Research Institution: Tokushima Bunri University
• Principal Investigator: 喜納 克仁 徳島文理大学, 薬学部, 准教授 (70360534)
• Project Period (FY): 2011-04-28 – 2015-03-31
• Keywords: 連続クラスター損傷 / グアニン酸化損傷

Outline of Annual Research Achievements

本課題の研究目的は、「グアニン連続配列を酸化することで、オキサゾロン(Oz)連続クラスター損傷を作成する。このOz連続クラスター損傷を用いて、DNAポリメラーゼによる塩基取り込み解析と伸長効率の解析などを行う。」ことである。一昨年度は、その前の年度で検討した方法を変更し、グアニンを含む6merと13mer、11merと相補鎖30merを混合した状態でライゲーションを行い、目的の30merを合成することに成功した。昨年度は、目的の実験を行うため、量を増やすことを検討した。しかしながら不幸なことに、原料を合成するためのDNA合成機が故障し、研究を遂行することができなかった。３月末にようやく修理され、本年度に延長申請することで、引き続き研究を遂行し、本年度、研究に必要なオリゴマー量を確保することに成功した。
その上で、DNAポリメラーゼαやβ、クレノーフラグメントで解析を行い、さらに乗り越え修復と関連するDNAポリメラーゼζ、η、REV1で解析を行った。

Research Products

• [Journal Article] Transcriptional Regulation of Tal2 Gene by All-trans Retinoic Acid (atRA) in P19 Cells. (2015)
  • Author(s): Kobayashi, T., Suzuki, M., Morikawa, M., Kino, K., Tanuma, S., Miyazawa, H.*
  • Journal Title: Biol. Pharm. Bull. Volume: 38 Pages: 248-256
  • DOI: http://doi.org/10.1248/bpb.b14-00617
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Calculating distortions of short DNA duplexes with base pairing between an oxidatively damaged guanine and a guanine. (2014)
  • Author(s): Suzuki M., Kino K.*, Morikawa M., Kobayashi T., Miyazawa H.
  • Journal Title: Molecules Volume: 19 Pages: 11030-11044
  • DOI: 10.3390/molecules190811030
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Formation of a flavin-linked peptide. (2014)
  • Author(s): Morikawa M., Kino K.*, Senda T., Suzuki M., Kobayashi T., Miyazawa H.
  • Journal Title: Molecules Volume: 19 Pages: 9552-9561
  • DOI: 10.3390/molecules19079552
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Direct analysis of guanine oxidation products in double-stranded DNA and proposed guanine oxidation pathways in single-stranded, double-stranded or quadruplex DNA. (2014)
  • Author(s): Morikawa M., Kino K.*, Oyoshi T., Suzuki M., Kobayashi T., Miyazawa H.
  • Journal Title: Biomolecules Volume: 4 Pages: 140-159
  • DOI: 10.3390/biom4010140
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] N'-[2-(7,8-Dimethyl-2,4-dioxo-3,4-dihydrobenzo[g]pteridin-10(2H)-yl) ethylidene]-4-nitrobenzohydrazide. (2014)
  • Author(s): Morikawa M., Kino K.*, Asada E., Katagiri K., Mori-Yasumoto K., Suzuki M., Kobayashi T., Miyazawa H.
  • Journal Title: Molbank Volume: 2014 Pages: M836
  • DOI: 10.3390/M836
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Tal2 expression is induced by all-trans retinoic acid in P19 cells prior to acquisition of neural fate. (2014)
  • Author(s): Kobayashi T., Komori R., Ishida K., Kino K., Tanuma S.-I., Miyazawa H.*
  • Journal Title: Scientific Reports Volume: 4 Pages: 4935
  • DOI: 10.1038/srep04935
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Analysis of nucleobases incorporated opposite an oxidative guanine damage by human REV1 (2014)
  • Author(s): Suzuki M., Kawada T., Morikawa M., Kobayashi T., Miyazawa H., Kino K.*
  • Journal Title: Photomed. Photobiol. Volume: 36 Pages: 39-40
• [Journal Article] Effects of stability of base pairs containing an oxazolone on DNA elongation. (2014)
  • Author(s): Suzuki, M., Ohtsuki, K., Kino, K.* , Kobayashi, T., Morikawa, M., Kobayashi, T., Miyazawa, H.
  • Journal Title: J Nucleic Acids. Volume: 2014 Pages: 178350
  • DOI: 10.1155/2014/178350
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Presentation] P19 細胞神経分化誘導初期に観察されるTal2 遺伝子 の転写機構 (2015)
  • Author(s): 小林隆信, 森川雅行, 鈴木雅代, 喜納克仁, 宮澤宏
  • Organizer: 日本薬学会 135年会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2015-03-25 – 2015-03-27
• [Presentation] REV1とDNAポリメラーゼζによるグアニン酸化損傷に対する損傷乗り越えDNA合成 (2014)
  • Author(s): 鈴木雅代、川田大周、森川雅行、小林隆信、宮澤宏、喜納克仁
  • Organizer: 第43回日本環境変異学会
  • Place of Presentation: 一橋大学
  • Year and Date: 2014-12-04 – 2014-12-05
• [Presentation] REV1とDNA polymeraseζのグアニン酸化損傷に対する塩基の取り込み解析 (2014)
  • Author(s): 鈴木雅代、川田大周、喜納克仁、森川雅行、小林隆信、宮澤宏
  • Organizer: 日本分子生物学会 第37回年会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] グアニン酸化損傷に対するDNAポリメラーゼκの損傷乗り越え反応 (2014)
  • Author(s): 川田大周、鈴木雅代、喜納克仁、森川雅行、小林隆信、宮澤宏
  • Organizer: 第53回日本薬学会 中四国支部学術大会
  • Place of Presentation: 広島
  • Year and Date: 2014-11-08 – 2014-11-09
• [Presentation] atRAによるTal2遺伝子の転写調節 (2014)
  • Author(s): 小林隆信、喜納克仁、森川雅行、鈴木雅代、宮澤宏
  • Organizer: 第53回日本薬学会 中四国支部学術大会
  • Place of Presentation: 広島
  • Year and Date: 2014-11-08 – 2014-11-09
• [Presentation] REV1を用いたグアニン酸化損傷に対する塩基取り込み解析 (2014)
  • Author(s): 鈴木雅代、川田大周、森川雅行、小林隆信、宮澤宏、喜納克仁
  • Organizer: 第36回日本光医学・光生物学会
  • Place of Presentation: 大阪大学
  • Year and Date: 2014-07-25 – 2014-07-26
• [Remarks] 徳島文理大学 香川薬学部 薬科学科 分子生物学講座
  • URL: http://kp.bunri-u.ac.jp/kph04/index.html