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2011 Fiscal Year Research-status Report

レンチノロールを基にした分子間相互作用阻害剤の合理的デザイン

Research Project

Project/Area Number 23510277
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

佐藤 慎一  京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 助教 (70534478)

Project Period (FY) 2011-04-28 – 2014-03-31
KeywordsX線結晶構造解析 / ケミカルバイオロジー
Research Abstract

本年度は、X線結晶構造解析により、生理活性小分子化合物レンチノロールとアフィニティー精製により同定した3種類の標的タンパク質(S100A11、S100A13、S100A16)との複合体の構造決定を目指してきた。タンパク質結晶作製のための必要量の標的タンパク質を調製し、レンチノロール-標的タンパク質複合体の共結晶作製条件をスクリーニングした。しかしながら、結晶化条件のスクリーニング過程で共結晶作製には不都合な沈殿が生じてしまうことが明らかとなった。その理由として、共結晶作製中に標的タンパク質表面より遊離したレンチノロールが析出してしまうことが予想された。この問題を解決するために、現在、予めタンパク質結晶を作製後、レンチノロールをドープすることによる共結晶作製を試みている。3種類の標的タンパク質はすべてX線結晶構造が明らかとなっており、結晶化条件が分かっていることから、容易にタンパク質結晶が得られると考えられる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

初年度では、研究目的に利用している生理活性化合物のレンチノロールの水溶液溶解性が低いため、通常のタンパク質結晶化条件で析出してしまうなど、レンチノロール-標的タンパク質複合体の共結晶作製に支障が出たが、タンパク質結晶を作製後、レンチノロールをドープすることによる共結晶作製を始動しており、初年度の研究進展に影響が出た問題の解決のための実験方針・手法が確立できている。

Strategy for Future Research Activity

タンパク質結晶を作製後、レンチノロールをドープすることにより共結晶作製を試みている。3種類すべての標的タンパク質(S100A11, S100A13, S100A16)はX線結晶構造が明らかとなっており、その結晶化条件が分かっていることから、タンパク質結晶が容易に得られると考えられる。また、本研究はタンパク質結晶構造解析の権威であるアメリカ・ヒューストンのQuiocho教授ラボと共同で研究を進めており、連携を取りながら効率的に研究を推進する。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

タンパク質作製および精製に使用する試薬・器具類、タンパク質の結晶化に必要な試薬・器具類、およびレンチノロールの追加合成のために必要な試薬・器具類など、消耗品購入に利用する。

  • Research Products

    (3 results)

All 2011 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] RNAを検出する蛍光プローブの開発2011

    • Author(s)
      村田亜沙子*, 佐藤慎一*, 川添嘉徳, 上杉志成
    • Journal Title

      Chem. Commun.

      Volume: 47 Pages: 4712-4714

    • DOI

      10.1039/C1CC10393H

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 海洋天然物オーリライドの作用機序解明2011

    • Author(s)
      佐藤慎一、村田亜沙子、折原翼、白川貴詩、末永聖武、木越英夫、上杉志成
    • Journal Title

      Chem. Biol.

      Volume: 18 Pages: 131-139

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2010.10.017

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 海洋天然物オーリライドの標的タンパク質決定

    • Author(s)
      佐藤慎一、村田亜沙子、折原翼、白川貴詩、末永聖武、木越英夫、上杉志成
    • Organizer
      第53 回天然有機化合物討論会
    • Place of Presentation
      大阪国際交流センター(大阪府)
    • Year and Date
      平成23年9月27日

URL: 

Published: 2013-07-10  

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