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2013 Fiscal Year Final Research Report

Screening of inhibitors for hedgehog signaling pathway by using chemical array

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 23510287
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Chemical biology
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

KONDOH Yasumitsu  独立行政法人理化学研究所, 長田抗生物質研究室, 専任研究員 (80333342)

Project Period (FY) 2011 – 2013
Keywords医薬品探索 / 生理活性 / シグナル伝達 / マイクロアレイ / ケミカルアレイ / ソニックヘッジホッグ / Shh / SPRイメージング
Research Abstract

The purpose of this research was investigation of the inhibitor that binds directly to sonic hedgehog (Shh) and inhibits Shh signaling pathway by chemical array screening. By chemical array screening using ShhN protein, 322 candidates among about 30 thousands of library compounds were identified. The interaction of ShhN and candidates were measured by surface plasmon resonance (SPR) imaging and 9 compounds had strong binding activities to ShhN with Kd of 6–60 nM. It is known that mouse undifferentiated mesenchymal cell C3H10T1/2 differentiates into osteoblast by treatment of ShhN. Among 9 compounds, 5 compounds inhibited the differentiation-inducing activity of ShhN dose-dependently.

  • Research Products

    (29 results)

All 2014 2013 2012

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (20 results)

  • [Journal Article] A small compound targeting TACC3 revealed its spatiotemporally different contributions to the spindle assembly in cancer cells2014

    • Author(s)
      Yao R, Kondoh Y, Natsume Y, Yamanaka H, Inoue M, Toki H, Takagi R, Shimizu T, Yamori T, Osada H, Noda T
    • Journal Title

      Oncogene

      Volume: in press

    • DOI

      10.1038/onc.2013.382

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spectomycin B1 as a novel SUMOylation inhibitor that directly binds to SUMO E22013

    • Author(s)
      Hirohama M, Kumar A, Fukuda I, Matsuoka S, Igarashi Y, Saitoh H, Takagi M, Shin-ya K, Honda K, Kondoh Y, Saito T, Nakao Y, Osada H, Zhang K, Yoshida M, Ito A
    • Journal Title

      ACS Chem. Biol.

      Volume: 8 Pages: 2635-2642

    • DOI

      10.1021/cb400630z

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification and characterization of an inhibitor of trichothecene 3-O-acetyltransferase, TRI101, by the chemical array approach2013

    • Author(s)
      Nakajima Y, Kawamura T, Maeda K, Ichikawa H, Motoyama T, Kondoh Y, Saito T, Kobayashi T, Yoshida M, Osada H, Kimura M
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      Volume: 77 Pages: 1958-1960

    • DOI

      10.1271/bbb.130153

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Affinity-based screening of MDM2/MDMX-p53 interaction inhibitors by chemical array: identification of novel peptidomimetic inhibitors2013

    • Author(s)
      Noguchi T, Oishi S, Honda K, Kondoh Y, Saito T, Kubo T, Kaneda M, Ohno H, Osada H, Fujii N
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 23 Pages: 3802-3805

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2013.04.094

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 新たな抗がん剤探索を加速する新スクリーニング技術2013

    • Author(s)
      長田 裕之、二村 友史、渡辺 信元、近藤 恭光
    • Journal Title

      細胞工学、秀潤社

      Volume: vol.32、No.6 Pages: 655-659

    • URL

      http://gakken-mesh.jp/journal/detail/9784780901436.html

  • [Journal Article] High-throughput screening identifies small molecule inhibitors of molecular chaperones2013

    • Author(s)
      Kondoh Y, Osada H
    • Journal Title

      Curr. Pharm. Design

      Volume: 19 Pages: 473-492

    • DOI

      10.2174/1381612811306030473

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Boronic acid inhibitors of acyl protein thioesterase 1 and 22013

    • Author(s)
      Zimmermann TJ, Burger M, Tashiro E, Kondoh Y, Martinez NE, Gormer K, Rosin-steiner S, Shimizu T, Ozaki S, Mikoshiba K, Watanabe N, Hall D, Vetter IR, Osada H, Hedberg C, Waldmann H
    • Journal Title

      Chem Bio Chem

      Volume: 14 Pages: 115-122

    • DOI

      10.1002/cbic.201200571

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Xanthohumol Impairs Autophagosome Maturation through Direct Inhibition of Valosin-Containing Protein2012

    • Author(s)
      Sasazawa Y, Kanagaki S, Tashiro E, Nogawa T, Muroi M, Kondoh Y, Osada H, Imoto M
    • Journal Title

      ACS Chem. Biol.

      Volume: 7 Pages: 892-900

    • DOI

      10.1021/cb200492h

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the predicted phospholipase LYPLAL1 reveals unexpected functional plasticity in spite of close relationship to acyl protein thioesterases2012

    • Author(s)
      Burger M, Zimmermann TJ, Kondoh Y, Stege P, Watanabe N, Osada H, Waldmann H, & Vetter IR
    • Journal Title

      J. Lipid Res.

      Volume: 53 Pages: 43-50

    • DOI

      10.1194/jlr.M019851

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 化合物アレイによるp38 γおよび p38δMAP キナーゼ特異的阻害 剤の探索2014

    • Author(s)
      近藤恭光、須藤龍彦、本田 香織、林輝雄、長田裕之
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年度大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      20140327-30
  • [Presentation] がん細胞にROS産生を介した細胞死を誘導するα-chloroacetamideの作用機序と効果2014

    • Author(s)
      河村達郎、近藤恭光、室井誠、川谷誠、長田裕之
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年度大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      20140327-30
  • [Presentation] 化合物アレイを用いたトリコジエンシンターゼ阻害剤の探索2014

    • Author(s)
      前田一行、中嶋佑一、河村達郎、近藤恭光、斎藤臣雄、本山高幸、長田裕之、金丸京子、小林哲夫、木村真
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年度大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      20140327-30
  • [Presentation] 新規TACC3阻害剤を用いた紡錘体制御機構解析とがん治療への応用2013

    • Author(s)
      八尾良司、矢守隆夫、近藤恭光、長田裕之、野田哲生
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      20131203-06
  • [Presentation] 脱ユビキチン化酵素USP36の核小体局在を阻害する化合物の同定と解析2013

    • Author(s)
      齋藤尚吾、川口紘平、本田香織、近藤恭光、斎藤臣雄、長田裕之、駒田雅之
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      20131203-06
  • [Presentation] LAP結合TGF-β活性化反応阻害物質の探索と活性評価2013

    • Author(s)
      山本由佳、坂田幸大郎、原詳子、本田香織、結城瑞恵、近藤恭光、平野秀典、武藤裕、白水美香子、斎藤臣雄、長田裕之、小嶋聡一
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      20131203-06
  • [Presentation] 理化学研究所天然化合物バンク・NPDepoが提供する創薬研究支援2013

    • Author(s)
      斎藤臣雄、近藤恭光、長田裕之
    • Organizer
      第5回食品薬学シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都大学薬学部記念講堂(京都府京都市)
    • Year and Date
      20131101-02
  • [Presentation] オートファジーを制御する新規化合物の探索2013

    • Author(s)
      田中敦史、近藤恭光、清水史郎、斎藤臣雄、長田裕之、野田健司、吉森保
    • Organizer
      第65回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      ウインクあいち(愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      20130619-21
  • [Presentation] Chemical array screening for specific inhibitor of amino-acid substitution variant2013

    • Author(s)
      Kondoh Y, Sudo T, Honda K, Hayashi T, Osada H
    • Organizer
      RIKEN-MAXPLANCK JOINTRESEARCH CENTER 2nd Symposium
    • Place of Presentation
      RIKEN (Wako, Saitama)
    • Year and Date
      20130416-17
  • [Presentation] Identification of a novel inhibitor of glutathione S-transferase P1-12013

    • Author(s)
      Kawamura T, Kondoh Y, Muroi M, Kawatani M, Osada H
    • Organizer
      RIKEN-MAXPLANCK JOINTRESEARCH CENTER 2nd Symposium
    • Place of Presentation
      RIKEN (Wako, Saitama)
    • Year and Date
      20130416-17
  • [Presentation] Application of the chemical array approach in the quest for inhibitors of the mitotic kinesin HSET2013

    • Author(s)
      Tran TTN, Scholermann B, Kondoh Y, Lopez-Alberca MP, Watanabe N, Ziegler S, Osada H, Waldmann H
    • Organizer
      RIKEN-MAXPLANCK JOINTRESEARCH CENTER 2nd Symposium
    • Place of Presentation
      RIKEN (Wako, Saitama)
    • Year and Date
      20130416-17
  • [Presentation] 化合物アレイによるヘッジホッグ伝達経路の阻害剤の探索2013

    • Author(s)
      近藤恭光、河村達郎、本田香織、関根朋美、長田裕之
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      20130324-28
  • [Presentation] 植物ホルモン・アブシジン酸の新規アゴニスト・アンタゴニスト探索2013

    • Author(s)
      伊藤卓也、近藤恭光、梅澤泰史、清水猛、篠崎一雄、長田裕之
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      20130324-28
  • [Presentation] がん細胞にアポトーシスを誘導するアセトアミド誘導体の活性評価と作用機序解析2013

    • Author(s)
      河村達郎、近藤恭光、本田香織、関根朋美、室井誠、近藤久恵、川谷誠、長田裕之
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      20130324-28
  • [Presentation] PyrrocidineAによるミトコンドリアを介したアポトーシス誘導機構2013

    • Author(s)
      上杉祥太、室井誠、近藤恭光、塩野義人、長田裕之、木村賢一
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      20130324-28
  • [Presentation] 化合物アレイによるアミノ酸置換変異体特異的阻害剤の探索手法の開発2012

    • Author(s)
      近藤恭光、須藤龍彦、本田香織、林輝雄、長田裕之
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、マリンメッセ福岡(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      20121211-14
  • [Presentation] p38のゲートキーパーの多様性を標的とした特異的阻害剤探索2012

    • Author(s)
      須藤龍彦、近藤恭光、長田裕之
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、マリンメッセ福岡(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      20121211-14
  • [Presentation] オートファジーを制御する低分子化合物の探索2012

    • Author(s)
      三好良幣、田端桂介、近藤恭光、清水史郎、斎藤臣雄、長田裕之、吉森保
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、マリンメッセ福岡(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      20121211-14
  • [Presentation] p38γおよびp38δ特異的阻害剤探索のための化合物アレイの改良2012

    • Author(s)
      近藤恭光、須藤龍彦、本田香織、内田素子、林輝雄、長田裕之
    • Organizer
      日本農芸化学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都府京都市)
    • Year and Date
      20120322-26
  • [Presentation] 細胞周期G2/M期に作用する小分子化合物の構造活性相関研究2012

    • Author(s)
      高木隆吉、清水猛、川谷誠、青野晴美、近藤恭光、本田香織、柴隆一、長田裕之
    • Organizer
      日本農芸化学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都府京都市)
    • Year and Date
      20120322-26

URL: 

Published: 2015-07-16  

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