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2013 Fiscal Year Annual Research Report

生体分子系に対する軟エックス線分光理論計算

Research Project

Project/Area Number 23540476
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

高橋 修  広島大学, サステナブル・ディベロップメント実践研究センター, 特任講師 (60253051)

Keywords放射線、X線、粒子線 / 生体分子 / 内殻励起 / 化学物理
Research Abstract

近年の放射光利用技術の進歩およびX線自由電子レーザのような新しい光源の利用により、軟X線領域における分光学が急速に進展した。本研究では私が今まで培ってきた研究ノウハウを生体分子系に応用する。生体分子系に特徴的な物性の1つであるX線自然円二色性分光法(XNCD)と、近年新しい光源であるX線自由電子レーザを使った研究のうち特に注目されている内殻二重イオン化状態(DCH)の計算手法を構築する。
まずXNCD法について述べる。昨年度開発した新規コードに基づき、アラニン、セリンに対し単分子およびクラスタモデルを用いて理論計算を行った。最大4分子のモデルクラスタを用い、アラニンについては実験スペクトルをよく再現したが、セリンについては強度の絶対値の減少は再現できたものの符号の反転は再現できなかった。さらなる大規模計算の必要性を感じている。
内殻二重イオン化状態の計算はこれまでの計算結果をまとめるべく、論文を執筆中である。

  • Research Products

    (20 results)

All 2014 2013

All Journal Article (12 results) (of which Peer Reviewed: 12 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Formation and decay of core-orbital vacancies in the water molecules2013

    • Author(s)
      M. Mucke, O. Takahashi (他5名)
    • Journal Title

      Chem. Phys. Lett

      Volume: 558 Pages: 82-87

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2012.11.094

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Site-specific ion desorption from condensed F3SiCD2CH2Si(CH3)3 induced by Si-2p core-level ionizations studied with photoelectron photoion coincidence (PEPICO) spectroscopy, Auger photoelectron coincidence spectroscopy (APECS) and Auger electron photoion coincidence (AEPICO) spectroscopy2013

    • Author(s)
      Kazuhiko Mase, Eiichi Kobayashi, Akira Nambu, Takuhiro Kakiuchi, Osamu Takahashi, Kiyohiko Tabayashi, Joji Ohshita, Shogo Hashimoto, Masatoshi Tanaka, Shin-ichi Nagaoka
    • Journal Title

      Surf. Sci.

      Volume: 607 Pages: 174-180

    • DOI

      doi: 10.1016/j.susc.2012.09.003

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cascade Auger decays following Si KL23L23 Auger transitions in SiF42013

    • Author(s)
      I.H. Suzuki, Y. Kono, A. Ikeda, M. Oi, T. Ouchi, K. Ueda, Y. Tamenori, O. Takahashi and S. Nagaoka
    • Journal Title

      J. Chem. Phys.

      Volume: 138 Pages: 024302-7

    • DOI

      doi: 10.1063/1.4773344

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Substituent R-effects on the core-electron excitation spectra of hydrogen bonded carboxylic-acid (R-COOH) clusters: Comparison between acetic-acid and formic-acid clusters2013

    • Author(s)
      K. Tabayashi, O. Takahashi, H. Namatame, and M. Taniguchi
    • Journal Title

      Chem. Phys. Lett.

      Volume: 557 Pages: 1

    • DOI

      doi: 10.1016/j.cplett.2012.10.043

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Important role of the CH/pi hydrogen bond in the enhancement of CD amplitude of 1,3-diene steroids2013

    • Author(s)
      Osamu Takahashi, Yuji Kohno, Kazuyoshi Ueda, and Motohiro Nishio
    • Journal Title

      New J. Chem.

      Volume: 37 Pages: 843-849

    • DOI

      doi: 10.1039/C2NJ40955K

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A vaiety of characteristic behavior of resonant KL23L23 Auger decays following Si K-shell photoexcitation of SiCl42013

    • Author(s)
      I. H. Suzuki, Y. Kono, K. Sakai, M. Kimura, K. Ueda, Y. Tamenori, O. Takahashi, and S. Nagaoka
    • Journal Title

      J. Phys. B: At. Mol. Opt. Phys.

      Volume: 46 Pages: 075101-9

    • DOI

      doi: 10.1088/0953-4075/46/7/075101

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Influence of the CH/pi hydrogen bond on the enhancement of circular dichroism (CD) amplitude of 5,7-diene steroids: ergosterol, lumisterol, pirocarciferol, isopirocarciferol and structurally related cyclohexadienes2013

    • Author(s)
      Osamu Takahashi, Yuji Kohno and Motohiro Nishio
    • Journal Title

      New J. Chem.

      Volume: 37 Pages: 2082-2086

    • DOI

      doi: 10.1039/c3nj41148f

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Unique Water-Water Coordination Tailored by a Metal Surface2013

    • Author(s)
      T. Schiros, K. Andersson, J. B. MacNaughton, J. Gladh, A. Matsuda, H. Ostrom, O. Takahashi, L.G.M. Pettersson, A. Nilsson, and H. Ogasawara
    • Journal Title

      J. Chem. Phys.

      Volume: 138 Pages: 234708-7

    • DOI

      doi: 10.1063/1.4809680

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamics of hollow atom formation in intense s-ray pulses mapped by partial covariance2013

    • Author(s)
      L. J. Fransinski, P. Linusson, P. v.d. Muelen, P. Salen, R. D. Thomas, M. Larsson, L. Foucar, J. Ullrich, K. Motomura, S. Mondal, K. Ueda, T. Osipiv, L. Fang, B. Murphy, N. Berrah, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Schorb, M. Messerschmidt, J. M. Glownia, J. Cryan, R. Coffee, O. Takahashi, S. Wada (他10名)
    • Journal Title

      Phys. Rev. Lett.

      Volume: 111 Pages: 073002-5

    • DOI

      doi: 10.1103/PhysRevLett.111.073002

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Using Covariance Mapping to Investigate the Dynamics of Multi-Photon Ionization Processes of Ne Atoms Exposed to X-FEL Pulses2013

    • Author(s)
      V. Zhaunerchyk, L. J. Fransinski, M. Siano, J. H. D. Eland, P. Linusson, R. D. Thomas, M. Larsson, L. Foucar, J. Ullrich, K. Motomura, S. Mondal, K. Ueda, T. Osipiv, L. Fang, B. F. Murphy, N. Berrah, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Schorb, M. Messerschmidt, J. M. Glownia, J. P. Cryan, R. Coffee, O. Takahashi (他10名)
    • Journal Title

      J. Phys. B: At. Mol. Opt. Phys.

      Volume: 46 Pages: 164034-8

    • DOI

      doi:10.1088/0953-4075/46/16/164034

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] elective Probing of OH-OD stretch vibrations in liquid water using resonant inelastic soft-X-ray scattering2013

    • Author(s)
      Yoshihisa Harada, Takashi Tokushima, Yuka Horikawa, Osamu Takahashi, Hideharu Niwa, Masaki Kobayashi, Masaharu Oshima, Yasunori Senba, Haruhiko Ohashi, Kjartan Thor Wikfeldt, Anders Nilsson, Lars G. M. Petterson, and Shik Shin
    • Journal Title

      Phys. Rev. Lett.

      Volume: 111 Pages: 193001-5

    • DOI

      doi: 10.1103/PhysRevLett.111.193001

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Site-dependent Si KL23L23 resonant Auger electron spectra following inner-shell excitation of Cl3SiSi(CH3)32013

    • Author(s)
      Isao Suzuki, Hikari Endo, Kanae Nagai, Osamu Takahashi, Yusuke Tamenori, and Shin-ichi Nagaoka
    • Journal Title

      J. Chem. Phys.

      Volume: 139 Pages: 174314-7

    • DOI

      doi: 10.1063/1.4827860

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Theoretical studies on core-level spectroscopy: Dynamical effects2014

    • Author(s)
      O. Takahashi
    • Organizer
      Helmholtz-Zentrum Berlin
    • Place of Presentation
      Helmholtz-Zentrum Berlin, Berlin
    • Year and Date
      20140306-20140306
    • Invited
  • [Presentation] 軟X線分光に関する理論計算2013

    • Author(s)
      高橋 修
    • Organizer
      文部科学省平成25年度科学研究費補助金「新学術領域研究」宇宙における分子進化:星間雲から原子惑星系へ 平成25年度研究集会
    • Place of Presentation
      札幌,低温科学研究所
    • Year and Date
      20131127-20131128
    • Invited
  • [Presentation] 金属原子を含む軟X線吸収分光スペクトルの理論計算2013

    • Author(s)
      高橋 修
    • Organizer
      2013年日本化学会中国四国支部大会
    • Place of Presentation
      広島大学西条キャンパス
    • Year and Date
      20131115-20131116
    • Invited
  • [Presentation] 核の運動を含んだオージェ電子分光スペクトルの理論計算2013

    • Author(s)
      高橋 修,高木沙弥, 国武尚登, 山崎勝義
    • Organizer
      日本コンピュータ化学会2013秋季年会
    • Place of Presentation
      九州大学 伊都キャンパス
    • Year and Date
      20131018-20131019
  • [Presentation] 液体エタノールのX線発光分光に対する理論計算2013

    • Author(s)
      高橋 修, Lars Pettersson
    • Organizer
      第7回分子科学討論会2013
    • Place of Presentation
      京都 京都テルサ
    • Year and Date
      20130924-20130927
  • [Presentation] Auger decay spectra calculations for some small molecules2013

    • Author(s)
      Osamu Takahashi, Saya Takaki, Naotake Kunitake, Katsuyoshi Yamasaki
    • Organizer
      XXVIII International Conference on Photonic, Electronic and Atomic Collision
    • Place of Presentation
      Lanzhou, China
    • Year and Date
      20130724-20130730
  • [Presentation] 液体アルコールのX線発光分光に対する理論計算2013

    • Author(s)
      高橋 修、Lars G. M. Pettersson
    • Organizer
      日本コンピュータ化学会2013春季年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス
    • Year and Date
      20130530-20130531
  • [Presentation] Auger decay spectra calculations for some small molecules2013

    • Author(s)
      O. Takahashi, S. Takaki, N. Kunitake, K. Yamasaki
    • Organizer
      5th JCS International Symposium on Theoretical Chemistry
    • Place of Presentation
      Nara, Japan
    • Year and Date
      2013-12-03
    • Invited

URL: 

Published: 2015-05-28  

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