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2013 Fiscal Year Annual Research Report

振動子ネットワークによる概日リズムの定量的数理モデルの構築とその制御への応用

Research Project

Project/Area Number 23560446
Research InstitutionRitsumeikan University

Principal Investigator

徳田 功  立命館大学, 理工学部, 教授 (00261389)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 本間 さと  北海道大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任教授 (20142713)
福田 弘和  大阪府立大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (90405358)
Keywords同期 / サーカディアンリズム / 視交叉上核 / ネットワークダイナミクス
Research Abstract

約24時間の周期性をもつ概日時計は、バクテリアからヒトまでの幅広い生物に対して高精度の日内リズムを付与している。哺乳類では、視交叉上核(SCN)に時計中枢があり、数万個の神経細胞が集団同期することにより、正確でロバストなリズムを刻むことが知られている。一方、植物の概日リズムは自律分散型で、細胞間結合も比較的弱いとされる。これらの組織がどのような機能に基づいて強靭な時計機能を獲得するのかを探るため、以下の研究を行った。
(1) Cry遺伝子欠損マウス(Cry1-/- Cry2-/-マウス)の行動リズムについては従来より研究が進められ、明暗サイクルには引き込まれるが、恒暗条件では概日リズムが消失することが報告されていた。これに対して、恒明条件で新生児期に飼育を行うと、その後、恒暗条件に暴露しても、概日リズムが見られることを実験により発見した。恒明条件下の飼育では、欠損型でも新生児期にSCNの細胞間結合が発達すると考え、バウト振動体仮説に基づいて、数理モデルを構築したところ、実験で観測された行動リズムを再現できることが示された。
(2) (1)のCry遺伝子欠損マウスのSCNスライス培養データに対して、新生児期からの発達段階で、リズムおよび細胞間同期の様相が変わることを示した前年度の実験結果に対して、数理モデルを構築し、結合の強さおよび結合の位相によって、リズムの強さおよび同期-脱同期の間の遷移が制御されることが分かった。
(3) シロイヌナズナの根においては、時計の全位相がストライプパターン状に現れる性質を利用して、一回の光照射刺激を加えるだけで、位相応答曲線を簡便に求める方法を開発し、数理モデルでその妥当性を検証した。また、シロイヌナズナに波長の異なる光を照射した場合に計測された位相応答曲線をモデル解析することにより、どのような光の組合せで位相の感度を最も上げることができるかを検討した。

  • Research Products

    (18 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (9 results)

  • [Journal Article] Characterization of Circadian Rhythms Through a Bioluminescence Reporter Assay in Lactuca sativa L.2014

    • Author(s)
      T. Higashi, A. Kamitamari, N. Okamura, K. Ukai, K. Okamura, T. Tezuka, H. Fukuda
    • Journal Title

      Environmental Control in Biology

      Volume: 52 Pages: 21-27

    • DOI

      10.2525/ecb.52.21

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Oscillator network modeling of circadian rhythm in the suprachiasmatic nucleus2013

    • Author(s)
      I. Tokuda, H. Fukuda, N. Hayasaka
    • Journal Title

      In Advances in Cognitive Neurodynamics (III), Y.Yamaguchi ed. Springer, Tokyo

      Pages: 191-197

    • DOI

      10.1007/978-94-007-4792-0_26

  • [Journal Article] Oscillator cell networks in the hypothalamic suprachiasmatic nucleus, the mammalian circadian clock2013

    • Author(s)
      S. Honma, D. Ono, K.-I. Honma
    • Journal Title

      In Advances in Cognitive Neurodynamics (III), Y.Yamaguchi ed. Springer, Tokyo

      Pages: 185-190

    • DOI

      10.1007/978-94-007-4792-0_25

  • [Journal Article] Detecting connectivity of small, dense oscillator networks from dynamical measurements based on a phase modeling approach2013

    • Author(s)
      I. T. Tokuda, M. Wickramasinghe, and I. Z. Kiss
    • Journal Title

      Physics Letters A

      Volume: 377 Pages: 1862-1867

    • DOI

      10.1016/j.physleta.2013.05.016

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fast synchronous oscillations of firing rate in cultured rat suprachiasmatic nucleus neurons: Possible role in circadian synchronization in the intact nucleus2013

    • Author(s)
      N. I. Kononenko, S. Honma, and K. Honma
    • Journal Title

      Neurosci Res

      Volume: 75 Pages: 218-227

    • DOI

      10.1016/j.neures.2013.01.003

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Differential responses of circadian Per2 rhythms in cultured slices of discrete brain areas from rats showing internal desynchronisation by methamphetamine2013

    • Author(s)
      A. Natsubori, K. Honma, and S. Honma
    • Journal Title

      Eur. J. Neurosci

      Volume: 38 Pages: 2566-2571

    • DOI

      10.1111/ejn.12034

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Daily exposure to a running wheel entrains circadian rhythms in mice in parallel with development of an increase in spontaneous movement prior to running-wheel access2013

    • Author(s)
      Y. Yamanaka, S. Honma, and K. Honma
    • Journal Title

      Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol

      Volume: 305 Pages: R1367-R1375

    • DOI

      10.1152/ajpregu.00389.2013

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Organ specific development characterizes circadian clock gene Per2 expression in rats2013

    • Author(s)
      S. Nishide, K. Hashimoto, T. Nishio, K. Honma, and S. Honma
    • Journal Title

      Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol

      Volume: 306 Pages: R67-R74

    • DOI

      10.1152/ajpregu.00063.2013

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Postnatal constant light compensates Cryptochrome1 and 2 double deficiency for disruption of circadian behavioral rhythms in mice under constant dark2013

    • Author(s)
      D. Ono, S. Honma, and K. Honma
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 8 Pages: e80615

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0080615

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Effect of adaptive coupling of a network of inferior olive neurons on cerebellar learning

    • Author(s)
      Isao Tokuda, Huu Hoang, Nicolas Schweighofer, Mitsuo Kawato
    • Organizer
      36th annual meeting of the Japan Neuroscience Society
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府)
  • [Presentation] Statistical estimation of gap-junctional and inhibitory conductance in inferior olive neurons from the spike trains by network model simulation

    • Author(s)
      Huu Hoang, Miho Onizuka, Mitsuo Kawato, Isao Tokuda, Nicolas Schweighofer, Yuuichi Katori, Kazuyuki Aihara, Eric Lang, Keisuke Toyama
    • Organizer
      36th annual meeting of the Japan Neuroscience Society
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府)
  • [Presentation] A role for Salt-inducible kinase 3 (SIK3) in the circadian rhythm regulation: phosphorylation-dependent degradation of the clock protein

    • Author(s)
      Naoto Hayasaka, Isao Tokuda, Hiroshi Takemori
    • Organizer
      36th annual meeting of the Japan Neuroscience Society
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府)
  • [Presentation] Single cell analysis and oscillator network modeling of Cry1 and Cry2 double deficient mice

    • Author(s)
      Isao Tokuda, Hanspeter Herzel, Daisuke Ono, Sato Honma, Ken-Ichi Honma
    • Organizer
      XIII Congress of the European Biological Rhythms Society
    • Place of Presentation
      Munich, Germany
  • [Presentation] A role of salt-inducible kinase 3 in the central circadian pacemaker in mammals: phosphorylation-dependent degradation of the clock protein

    • Author(s)
      Naoto Hayasaka, Isao Tokuda, Hiroshi Takemori
    • Organizer
      XIII Congress of the European Biological Rhythms Society
    • Place of Presentation
      Munich, Germany
  • [Presentation] SCNスライスデータにおける領域分割とその細胞間結合への影響に関する研究

    • Author(s)
      豊田慎五、徳田功、福田弘和、早坂直人
    • Organizer
      第20回日本時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪府)
  • [Presentation] 波長の異なる光パルスを用いた植物概日リズムの位相応答曲線の計測と推定 に関する研究

    • Author(s)
      大原隆之、徳田功、岡村信弥、福田弘和
    • Organizer
      第20回日本時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪府)
  • [Presentation] 根の概日時計におけるストライプパターンを用いた位相応答関数の算出

    • Author(s)
      鵜飼和也、上山昌三、福田弘和
    • Organizer
      第20回日本時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪府)
  • [Presentation] Analysis Of Phase Response Of Arabidopsis To Light Pulses With Different Wavelength

    • Author(s)
      Takayuki Ohara, Isao Tokuda, Shinya Okamura, Hirokazu Fukuda
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山大学(富山県)

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Published: 2015-05-28  

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