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2013 Fiscal Year Annual Research Report

アンチセンスプローブを用いた生きた細胞のmRNAイメージング

Research Project

Project/Area Number 23570207
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

岡部 弘基  東京大学, 薬学研究科(研究院), 助教 (20455398)

KeywordsmRNA / イメージング / アンチセンスプローブ / 生細胞
Research Abstract

本研究では、線形アンチセンスプローブを用いた生細胞内mRNAイメージング法を確立して、細胞質におけるmRNAを介したダイナミックな翻訳活性調節や分解といった細胞機能に重要な現象の解析を行うことを目指している。
まず、生細胞内における線形アンチセンスプローブの細胞内におけるハイブリダイゼーションの特性を分析し、mRNAとの結合、解離の反応速度定数(konやkoff)や解離定数(Kd)を算出した。さらに、その特性を活かして、細胞がストレスを受けた際に直接内在性mRNAを蛍光イメージングすることにより、速やかにストレス顆粒(SG)へ局在化する過程の観察に成功した。また、任意のmRNAを標的としたプローブ開発を目指し、GAPDH mRNAを標的とした候補プローブを設計した。プローブ結合を定量的に評価するため、プローブが内在性mRNAとの結合により見かけ分子量が著しく増大して拡散が遅くなることに着目して、アンチセンスプローブの状態を高感度蛍光顕微鏡を用いた細胞内拡散の定量的解析法により詳細に解析した。このうち10種類以上のプローブが内在性mRNAと結合している結果を得た。
さらに、mRNAとの親和性の高いプローブを用いて、COS7細胞の内在性GAPDH mRNAのイメージング、および蛍光相関分光法(FCS)を用いた発現量の定量的解析を行った。最後に、本法をsiRNAにより選択的mRNA分解を誘導した際のmRNA発現量の実時間追跡へと応用し、RNA分解の実時間解析に成功した。

  • Research Products

    (10 results)

All 2014 2013 Other

All Presentation (8 results) (of which Invited: 2 results) Book (2 results)

  • [Presentation] Real-time monitoring of mRNA decay in living cells2014

    • Author(s)
      岡部弘基、原田慶恵、船津高志
    • Organizer
      Biophysical Society 58th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      San Fransisco, CA(米国)
    • Year and Date
      20140215-20140219
  • [Presentation] Super-resolution fluorescence imaging reveals nanoscale organization of stress granule2014

    • Author(s)
      菅原皓、岡部弘基、坂本明彦、船津高志
    • Organizer
      Biophysical Society 58th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      San Fransisco, CA(米国)
    • Year and Date
      20140215-20140219
  • [Presentation] 超解像イメージングにより明らかとなったストレス顆粒内mRNAの詳細分布2013

    • Author(s)
      菅原皓、岡部弘基、坂本明彦、船津高志
    • Organizer
      日本生物物理学会第51回年会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都市)
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] 生細胞内におけるmicroRNAのイメージング2013

    • Author(s)
      石河敏成、岡部弘基、船津高志
    • Organizer
      日本生物物理学会第51回年会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都市)
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] Real-Time Monitoring of mRNA Decay in Living Cells2013

    • Author(s)
      岡部弘基
    • Organizer
      International Symposium on Nanomedicine Molecular Science 2013 (NMMS2013)
    • Place of Presentation
      東京大学山上会館(文京区)
    • Year and Date
      20131008-20131010
    • Invited
  • [Presentation] 生細胞内におけるmicroRNAのイメージング2013

    • Author(s)
      石河敏成、岡部弘基、船津高志
    • Organizer
      日本バイオイメージング学会第22回学術集会
    • Place of Presentation
      東京大学薬学部講堂(文京区)
    • Year and Date
      20130915-20130916
  • [Presentation] Imaging of temperature in a living cell using a fluorescent polymeric thermometer and fluorescence lifetime imaging microscopy2013

    • Author(s)
      岡部弘基,内山聖一,稲田のりこ,原田慶恵,船津高志
    • Organizer
      19th International Workshop on "Single Molecule Spectroscopy and Ultrasensitive Analysis in the Life Sciences"
    • Place of Presentation
      Berlin, Germany
    • Year and Date
      20130904-06
  • [Presentation] 生細胞内の温度イメージング

    • Author(s)
      岡部弘基
    • Organizer
      第17回酸素ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      弘前大学医学部(弘前市)
    • Invited
  • [Book] 実験医学2013

    • Author(s)
      岡部弘基
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      羊土社
  • [Book] バイオイメージング2013

    • Author(s)
      岡部弘基
    • Total Pages
      8
    • Publisher
      日本バイオイメージング学会

URL: 

Published: 2015-05-28  

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