イネにおける栽培化関連遺伝子の検証―野生種の遺伝的背景で形質変化は起こるのか

2013 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 23580006
• Research Institution: Kobe University
• Principal Investigator: 石井 尊生 神戸大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (20260648)
• Keywords: イネ / 栽培化

Research Abstract

本研究では、イネの栽培化に関連した形質にどのような遺伝子が関与したのかを検証することを目的としている。そこで、栽培化関連形質遺伝子座における野生種および栽培種の対立遺伝子の作用を、栽培種と野生種の遺伝的背景を持つ以下の4つの戻し交雑自殖集団、Npb-W（供与親Oryza sativa Japonica Nipponbare、反復親O. rufipogon W630）、IR-W（供与親O. sativa Indica IR36、反復親O. rufipogon W630）、W-Npb（供与親O. rufipogon W630、反復親O. sativa Nipponbare）、W-IR（供与親O. rufipogon W630、反復親O. sativa IR36）を材料として調査した。
最終年の平成25年度は、IR-W集団とW-IR集団を用いて、9つの栽培化関連形質（株の開帳性、穂の開帳性、種子色、芒の色、葉鞘の色、稈長、穂長、種穂までの日数、種子脱粒性）について調査を行い、ゲノム全体をほぼカバーする約180のマイクロサテライトマーカー座の遺伝子型のデータを用いて、QTL解析を行った。そして、前年度までに行った，Npb-W集団とW-Npb集団を用いた解析結果と比較することにより、野生種と栽培種の異なった遺伝的背景での栽培化関連遺伝子座の対立遺伝子の効果や、栽培種の日本型とインド型の2つの遺伝的背景における野生イネの遺伝子の効果を調べ、イネの栽培化の実態について総合的に考察した。

Research Products

• [Journal Article] OsLG1 regulates a closed panicle trait in domesticated rice (2013)
  • Author(s): Ishii T, Numaguchi K, Miura K, Yoshida K, Thanh PT, Htun TM, Yamasaki M, Komeda N, Matsumoto T, Terauchi R, Ishikawa R, Ashikari M
  • Journal Title: Nature Genetics Volume: 45 Pages: 462-465
  • DOI: 10.1038/ng.2567
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 穂が閉じることによって野生イネはどう変化したか？
  • Author(s): 沼口 孝司、Htun Than Myint、Thanh Pham Thien、石川 亮、石井 尊生
  • Organizer: 日本育種学会第124回講演会
  • Place of Presentation: 鹿児島大学
• [Presentation] Closed panicles in rice domestication
  • Author(s): Ishii T, Numaguchi K, Miura K, Yoshida K, Thanh PT, Htun TM, Yamasaki M, Matsumoto T, Terauchi R, Ishikawa R, Ashikari M
  • Organizer: International Rice Genetics Symposium
  • Place of Presentation: Manila, Philippines
• [Presentation] A closed panicle trait regulated by OsLG1 in domesticated rice, Oryza sativa L.
  • Author(s): Ryo Ishikawa, Kotaro Miura, Kentaro Yoshida, Koji Numaguchi, Than Myint Htun, Pham Thien Thanh, Takashi Matsumoto, Masanori Yamasaki, Ryohei Terauchi, Motoyuki Ashikari, Takashige Ishii
  • Organizer: International Rice Genetics Symposium
  • Place of Presentation: Manila, Philippines
• [Presentation] 野生イネ(Oryza rufipogon)の遺伝的背景における種子脱粒性遺伝子座間の相互作用
  • Author(s): 井上 千鶴、Than Myint Htun、石井 尊生、石川 亮
  • Organizer: 日本育種学会第125回講演会
  • Place of Presentation: 東北大学
• [Presentation] 野生イネ(Oryza rufipogon)の遺伝的背景における栽培化関連形質の評価
  • Author(s): 西村 彬則、岩崎 友哉、山本 知佳、石川 亮、石井 尊生
  • Organizer: 日本育種学会第125回講演会
  • Place of Presentation: 東北大学
• [Presentation] Identification of a quantitative trait locus involved in abscission layer formation for seed shattering in Asian wild rice, Oryza rufipogon
  • Author(s): Than Myint Htun, Chizuru Inoue, Orn Chhourn, Takashige Ishii, Ryo Ishikawa
  • Organizer: 日本育種学会第125回講演会
  • Place of Presentation: 東北大学