2013 Fiscal Year Final Research Report
Metabolic mechanism of host extracellular matrices, glycosaminoglycans, in streptococci
| Project/Area Number |
23580112
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Research Field |
Applied microbiology
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
HASHIMOTO Wataru 京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (30273519)
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| Project Period (FY) |
2011 – 2013
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| Keywords | 連鎖球菌 / 宿主細胞外マトリックス / グリコサミノグリカン / 代謝機構 / イソメラーゼ / 還元酵素 / X線結晶構造解析 / 不飽和グルクロニルヒドロラーゼ |
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| Research Abstract |
Pathogenic streptococci degrade host extracellular matrices, glycosaminoglycans, to unsaturated uronic acid and amino sugar by polysaccharide lyase and unsaturated glucuronyl hydrolase (UGL). Unsaturated uronic acid was found metabolized to 2-keto-3-deoxy-D-gluconic acid through subsequent reaction of Gbs1892 isomerase and Gbs1891 reductase. These enzymes were encoded in the UGL genetic cluster, suggesting that repression of this cluster contributes to establishment of a novel therapy for strectococcal infectious diseases.
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[Remarks] ①2013年10月19、20日、「京都大学宇治キャンパス公開」にて、一般市民向けに研究内容を紹介するパンフレットとポスターの作成に協力した。(アウトリーチ活動)
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[Remarks] ②2012年10月20、21日、「京都大学宇治キャンパス公開」にて、一般市民向けに研究内容を紹介するパンフレットとポスターの作成に協力した。(アウトリーチ活動)
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[Remarks] ③2011年10月22、23日、「京都大学宇治キャンパス公開」にて、一般市民向けに研究内容を紹介するパンフレットとポスターの作成に協力した。(アウトリーチ活動)
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[Remarks] ①Yusuke Nakamichi, Ai Kaneko, Kanate Temtrirath, Ryuichi Takase, Yukie Maruyama, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto. Structural determinants in bacterial unsaturated glucuronyl hydrolase for degradation of heparin disaccharides. SPring-8 User Experiment Report, 2013B1260 (2013).(研究成果データベース)
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[Remarks] ②Yukie Maruyama, Yusuke Nakamichi, Ai Kaneko, Ryuichi Takase, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto. Crystal structure of heparan sulfate lyase HepC from Pedobacter heparinus. SPring-8 User Experiment Report, 2013A1106 (2013).(研究成果データベース)
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[Remarks] ③Yusuke Nakamichi, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata. Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase specific for heparin. PDB ID, 3WIW, 2013年9月26日.(研究成果データベース)
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[Remarks] ④Yukie Maruyama, Yusuke Nakamichi, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto. Crystal structure of heparan sulfate lyase HepC from Pedobacter heparinus. PDB ID, 4MMH, 2013年9月9日.(研究成果データベース)
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[Remarks] ⑤Yukie Maruyama, Yusuke Nakamichi, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto. Crystal structure of heparan sulfate lyase HepC mutant from Pedobacter heparinus. PDB ID, 4MMI, 2013年9月9日.(研究成果データベース)
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[Remarks] ⑥Yusuke Nakamichi, Yukie Maruyama, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata. Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase mutant D115N from Streptcoccus agalactiae. PDB ID, 3VXD, 2012年9月11日.(研究成果データベース)
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[Remarks] ⑦Wataru Hashimoto, Yukie Maruyama, Ryuichi Takase, Yusuke Nakamichi, Bunzo Mikami, and Kousaku Murata. Crystal structure of streptococcalα-keto acid reductase involved in metabolism of glycosaminoglycans. SPring-8 User Experiment Report, 2011B2055 (2011).(研究成果データベース)
