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2013 Fiscal Year Final Research Report

The search for novel biomarkers by comprehensive identification of human N-myristoylated proteins

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 23580136
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Applied biochemistry
Research InstitutionYamaguchi University

Principal Investigator

UTSUMI TOSHIHIKO  山口大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (20168727)

Project Period (FY) 2011 – 2013
KeywordsN-ミリストイル化 / バイオマーカー探索 / タンパク質脂質修飾 / 細胞情報伝達 / タンパク質翻訳後修飾
Research Abstract

In order to search for novel human N-myristoylated proteins that can be applied for biomarkers, the susceptibility of human cDNA clones in human cDNA resources to protein N-myristoylation was evaluated by metabolic labeling of proteins expressed using an insect cell-free protein synthesis system. For this analysis, 178 cDNA clones with an N-terminal Met-Gly motif were selected as potential candidates from ~6,300 Kazusa ORFeome project (KOP) human cDNA clones. The susceptibility of these cDNA clones to protein N-myristoylation was evaluated by metabolic labeling experiments both in an insect cell-free protein synthesis system and in transfected mammalian cells. As a result, the products of 35 out of ~6,300 cDNA clones were found to be novel human N-myristoylated proteins. These novel N-myristoylated proteins contain not only physiologically important proteins but also many disease-associated proteins that can be applied for biomarkers.

  • Research Products

    (33 results)

All 2014 2013 2012 2011 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (25 results) (of which Invited: 2 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Cellular localization of CoPK12, a Ca^<2+>/calmodulin-dependent protein kinase in mushroom Coprinopsis cinerea, is regulated by N-myristoylation and limited proteolysis2014

    • Author(s)
      Kaneko K, Tabuchi M, Sueyoshi N, Ishida A, Utsumi T, Kameshita I.
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry

      Volume: (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Protein N-myristoylation plays a critical role in the endoplasmic reticulum morphological change induced by overexpression of protein Lunapark, an integral membrane protein of the endoplasmic reticulum2013

    • Author(s)
      Moriya K, Nagatoshi K, Noriyasu Y, Okamura T, Takamitsu E, Suzuki T, Utsumi T.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 8 Pages: e78235

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Acetyl-L-carnitine suppresses thyloid hormone-induced and spontaneous anuran tadpole tail shortening2013

    • Author(s)
      Hanada H, Kobuchi H, Yamamoto M, Kashiwagi K, Katsu K, Utsumi T, Kashiwagi A, Sasaki J, Inoue M, Utsumi K.
    • Journal Title

      Hereditas

      Volume: 150 Pages: 1-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mitochondrial localization of ABCG2 and its function in 5-aminolevulinic acid-mediated protoporphyrin IX accumulation2012

    • Author(s)
      Kobuchi H, Moriya K, Ogino T, Fujita H, Inoue K, Shuin T, Yasuda T, Utsumi K, Utsumi T.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 7 Pages: e50082

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Protein N-myristoylation is required for cellular morphological changes induced by two formin family proteins, FMNL2 and FMNL32012

    • Author(s)
      Moriya K, Yamamoto T, Takamitsu E, Matsunaga Y, Kimoto M, Fukushige D, Kimoto C, Suzuki T, Utsumi T.
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology and Biochemistry

      Volume: 76 Pages: 1201-1209

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Serum-dependent export of protoporphyrin IX by ATP-binding cassette transporter G2 in T24 cells2011

    • Author(s)
      Ogino T, Kobuchi H, Munemoto K, Fujita H, Yamamoto M, Utsumi T, Inoue K, Shuin T, Sasaki J, Inoue M, Utsumi K.
    • Journal Title

      Molecular and Cellular Biochemistry

      Volume: 358 Pages: 297-307

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Identification of novel human N-myristoylated proteins using cDNA resource and cell-free protein synthesis system2013

    • Author(s)
      Toshihiko Utsumi, Emi Takamitsu, Takashi Suzuki, Koko Moriya
    • Organizer
      第12回ヒトプロテオーム国際会議(HUPO2013)
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2013-09-18
  • [Presentation] Comprehensive identification of human N-myristoylated proteins using cDNA resource and cell-free protein synthesis system2013

    • Author(s)
      Toshihiko Utsumi
    • Organizer
      第12回ヒトプロテオーム国際会議(HUPO2013)
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2013-09-18
    • Invited
  • [Presentation] 昆虫培養細胞由来無細胞蛋白質合成システムを用いた膜蛋白質の合成2013

    • Author(s)
      江連徹, 七谷圭, 佐藤陽子, 相澤圭師, 相馬聡, 内海俊彦, 安藤英治, 魚住信之
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2013-09-11
  • [Presentation] 小胞体膜タンパク質Lunapark に生ずるN-ミリストイル化の解析2013

    • Author(s)
      守屋康子, 永利圭, 乗安義実, 高光恵美, 岡村剛, 内海俊彦
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2013-09-11
  • [Presentation] 昆虫培養細胞由来無細胞タンパク質合成系とクリックケミストリーを用いた新規N-ミリストイル化タンパク質の同定2013

    • Author(s)
      高光恵美, 守屋康子, 林田真梨子, 内海俊彦
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2013-09-11
  • [Presentation] タンパク質配列データベースSwiss-Prot に基づくヒトN-ミリストイル化タンパク質の網羅的探索の試み2013

    • Author(s)
      大塚基顕, 白井崇之, 南風原樹, 林田真梨子, 高光恵美, 守屋康子, 内海俊彦
    • Organizer
      第54回日本生化学会中国・四国支部例会
    • Place of Presentation
      徳島大学(徳島市)
    • Year and Date
      2013-05-31
  • [Presentation] ヒトcDNAリソースと無細胞タンパク質合成系を用いたN-ミリストイル化された膜タンパク質の探索2013

    • Author(s)
      内海俊彦, 守屋康子, 乗安義実, 福永和貴, 飯尾雄介, 高光恵美
    • Organizer
      日本農芸化学会2013 年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学(仙台市)
    • Year and Date
      2013-03-24
  • [Presentation] N-ミリストイル化と限定分解は担子菌キノコCa^<2+>/CaM 依存性プロテインキナーゼCoPK12 の細胞内局在を制御する2012

    • Author(s)
      金子啓祐, 田淵光昭, 末吉紀行, 内海俊彦, 亀下勇
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡市)
    • Year and Date
      2012-12-16
  • [Presentation] 5-アミノレブリン酸によるプロトポルフィリンIV 蓄積におけるABCG2 のミトコンドリア局在と機能2012

    • Author(s)
      小渕浩嗣, 守屋康子, 荻野哲也, 藤田洋史, 井上啓史, 執印太郎, 安田立二, 内海耕慥, 内海俊彦
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡市)
    • Year and Date
      2012-12-15
  • [Presentation] 小胞体膜に局在するN-ミリストイル化された膜貫通タンパク質Lunapark2012

    • Author(s)
      守屋康子, 乗安義実, 福永和貴, 高光恵美, 鈴木崇, 内海俊彦
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡市)
    • Year and Date
      2012-12-14
  • [Presentation] ヒトcDNAリソースと無細胞タンパク質合成系を用いた新規ヒトN-ミリストイル化タンパク質の同定2012

    • Author(s)
      飯尾雄介, 岡村剛, 福重大地, 高光恵美, 守屋康子, 内海俊彦
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡市)
    • Year and Date
      2012-12-14
  • [Presentation] ヒト細胞由来無細胞タンパク質合成系を用いたタンパク質脂質修飾の解析2012

    • Author(s)
      福重大地, 高光恵美, 守屋康子, 内海俊彦
    • Organizer
      日本農芸化学会中四国支部大会
    • Place of Presentation
      山口大学(宇部市)
    • Year and Date
      2012-09-21
  • [Presentation] 無細胞タンパク質合成系を用いたN-ミリストイル化された膜貫通タンパク質の同定2012

    • Author(s)
      福永和貴, 飯尾雄介, 乗安義実, 高光恵美, 守屋康子, 内海俊彦
    • Organizer
      日本農芸化学会中四国支部大会
    • Place of Presentation
      山口大学(宇部市)
    • Year and Date
      2012-09-21
  • [Presentation] ABCG2 のミトコンドリア局在とプロトポルフィリンIX 蓄積の制御2012

    • Author(s)
      小渕浩嗣, 内海俊彦, 荻野哲也, 安田立二, 内海耕慥
    • Organizer
      第53回日本生化学会中国・四国支部例会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山市)
    • Year and Date
      2012-05-18
  • [Presentation] cDNA リソースと無細胞タンパク質合成系を用いた新規N-ミリストイル化タンパク質の同定2012

    • Author(s)
      飯尾雄介, 福永和貴, 福重大地, 高光恵美, 守屋康子, 内海俊彦
    • Organizer
      第53回日本生化学会中国・四国支部例会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山市)
    • Year and Date
      2012-05-18
  • [Presentation] 無細胞タンパク質合成系を用いた脂質修飾タンパク質の網羅的探索法の確立とその応用2012

    • Author(s)
      内海俊彦
    • Organizer
      2012 年度日本農芸化学会大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都市)
    • Year and Date
      2012-03-25
    • Invited
  • [Presentation] 無細胞タンパク質合成系とクリックケミストリーを用いた新規N-ミリストイル化タンパク質の同定2012

    • Author(s)
      高光恵美, 乗安義実, 岡村剛, 福重大地, 守屋康子, 内海俊彦
    • Organizer
      2012 年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都市)
    • Year and Date
      2012-03-23
  • [Presentation] AIF 関連タンパク質AMID 及びAIFL に生ずる脂質修飾と特異的細胞内局在2011

    • Author(s)
      松永由佳梨, 高光恵美, 守屋康子, 岡村剛, 乗安義実, 田淵光昭, 内海俊彦
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館(京都市)
    • Year and Date
      2011-09-24
  • [Presentation] Formin ファミリータンパク質FMNL2 及びFMNL3 に生ずるN-ミリストイル化の役割2011

    • Author(s)
      守屋康子, 山本卓生, 高光恵美, 福重大地, 鈴木崇, 安藤英治, 内海俊彦
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館(京都市)
    • Year and Date
      2011-09-24
  • [Presentation] がん細胞のポルフィリン蓄積におけるABCG2 の役割2011

    • Author(s)
      小渕浩嗣, 内海俊彦, 内海耕慥, 安田立二
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館(京都市)
    • Year and Date
      2011-09-22
  • [Presentation] 無細胞タンパク質合成系を用いたプレニル化タンパク質の網羅的同定法の確立2011

    • Author(s)
      岡村剛, 高光恵美, 守屋康子, 内海俊彦
    • Organizer
      日本農芸化学会西日本・中四国支部合同大会
    • Place of Presentation
      宮崎大学(宮崎市)
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] Formin ファミリータンパク質FMNL3 による細胞形態変化誘導におけるN-ミリストイル化の役割2011

    • Author(s)
      福重大地, 乗安義実, 山本卓生, 高光恵美, 守屋康子, 内海俊彦
    • Organizer
      日本農芸化学会西日本・中四国支部合同大会
    • Place of Presentation
      宮崎大学(宮崎市)
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] 細胞骨格制御タンパク質 FMNL2 及び FMNL3 に生ずるN-ミリストイル化の役割2011

    • Author(s)
      守屋康子, 山本卓生, 高光恵美, 鈴木崇, 安藤英治, 内海俊彦
    • Organizer
      第52回日本生化学会中国・四国支部例会
    • Place of Presentation
      広島大学(広島市)
    • Year and Date
      2011-05-14
  • [Presentation] N-ミリストイル化された膜貫通タンパク質の探索2011

    • Author(s)
      乗安義実, 岡村剛, 福重大地, 高光恵美, 守屋康子, 内海俊彦
    • Organizer
      第52回日本生化学会中国・四国支部例会
    • Place of Presentation
      広島大学(広島市)
    • Year and Date
      2011-05-14
  • [Presentation] がん細胞のプロトポルフィリンIX 蓄積におけるABCG2の役割2011

    • Author(s)
      小渕浩嗣, 宗友一晃, 藤田洋史, 守屋康子, 荻野哲也, 内海俊彦, 井上啓史, 佐々木順造, 安田立二, 内海耕慥
    • Organizer
      第52回日本生化学会中国・四国支部例会
    • Place of Presentation
      広島大学(広島市)
    • Year and Date
      2011-05-14
  • [Book] プロテオミクス辞典2013

    • Author(s)
      内海俊彦(分担)
    • Total Pages
      135
    • Publisher
      講談社
  • [Remarks] 内海俊彦

    • URL

      http://www.agr.yamaguchi-u.ac.jp/member/utsumi/index.html

URL: 

Published: 2015-07-16  

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