2013 Fiscal Year Annual Research Report
トラフグ口白症病原体の正体をつきとめる －ゲノムからのアプローチ－
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23580261
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| Research Institution | Fukui Prefectural University |
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Principal Investigator |
宮台 俊明 福井県立大学, 海洋生物資源学部, 教授 (20157663)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
末武 弘章 福井県立大学, 海洋生物資源学部, 准教授 (00334326)
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| Keywords | ウイルス / トラフグ / 口白症 / 魚病 / ゲノム解析 |
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| Research Abstract |
ゲノムの解析が進展しないため、分類がなされていないトラフグの口白症ウイルスのゲノムをクローニングし、どのウイルスに属するかをを確定することを本研究の目的とした。本ウイルスはフラビウイルスの形体および物理化学的性状に類似していたため、フラビウイルスおよびその近縁のトガウイルスのユニバーサルプライマーを用いてRT-PCRを行った。しかし、用いた20組のプライマーによって特異的に増幅する配列は得られなかった。
そこで、網羅的に未知のウイルスゲノムをクローニングする方法として、Rapid determination system for Viral RNA (RDV)を試みた。これは、核酸の両端の塩基配列が数塩基一致していればPCR増幅できるようなプライマーの組み合わせを作製してゲノムの増幅を行うものである。すでに、本法を用いた研究者はいくつものウイルスゲノムのクローン化に成功している。実験を遂行した結果、約1000塩基のRNA断片を3クローン得ることに成功した。この配列は口白症に感染した脳と脊髄に高発現し、病態の進行に伴い発現量が増加することから、口白症ウイルスゲノムあるいは少なくとも口白症関連RNAである。
全ゲノムを解読するためには、次世代シーケンサーによる網羅的解析が必要である。
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[Presentation] N-acetyl-d-glucosamine-binding immunoglobulin m of fugu (takifugu rubripes) inhibits the growth of fish pathogenic bacteria: a novel function of teleost antibody.2013
Author(s)
Shigeyuki Tsutsui, Toru Ariji, Akira Sato, Takaya Yoshida, Nozomi Yamamura, Tomoyuki Odaka, Kyosuke Araki, Hiroaki Suetake, Toshiaki Miyadai, Osamu Nakamura
Organizer
First International Conference of Fish and Shellfish Immunology
Place of Presentation
Vigo, Spain.
Year and Date
20130625-20130628
