野生種を利用したイネ科作物における種子脱粒性制御機構の解明に向けて

2013 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 23580473
• Research Institution: Kobe University
• Principal Investigator: 石川 亮 神戸大学, (連合)農学研究科(研究院), 助教 (70467687)
• Keywords: イネ / 脱粒性

Research Abstract

本年度は昨年に新規に同定したQTL領域を持つ系統が有意に脱粒強度を変化させるかについて、再評価を行った。さらに遺伝子単離に向けた高密度連鎖解析を行った。この際、QTL解析に用いたF2由来のF3植物では遺伝的背景が均一でないことが予測されることから、これまでに作出した栽培種（日本晴）に野生種のO. rufipogonを２回戻し交雑させた144のBC1 F1系統（野生種の遺伝的背景）、ならびにその後代の中から目的の遺伝子座をヘテロで持つ系統を選抜し、BC2F2集団を展開した。同定したQTL領域の遺伝子型は、解析に用いた分子マーカーを用いて判別し、脱粒強度測定からその効果を確認することができた。さらに、この領域をヘテロで持つ植物の自殖種子由来の約5000個体からなる集団を用いて、新規遺伝子近傍の高密度連鎖解析を行い、原因となる遺伝子の候補領域を約160kbの領域に限定した。次年度以降にこれら集団を用いて、原因遺伝子単離に向けた研究を行う。

Research Products

• [Journal Article] Effect of quantitative trait loci for seed shattering on abscission layer formation in Asian wild rice Oryza rufipogon (2014)
  • Author(s): T.M. Htun, C. Inoue, O. Chhourn, T. Ishii, R. Ishikawa
  • Journal Title: Breeding Science Volume: in press Pages: in press
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Identification of a quantitative trait locus involved in abscission layer formation for seed shattering in Asian wild rice, Oryza rufipogon (2014)
  • Author(s): Than Myint Htun, Chizuru Inoue, Orn Chhourn, Takashige Ishii, and Ryo Ishikawa
  • Organizer: 日本育種学会第125回講演会
  • Place of Presentation: 東北大学
  • Year and Date: 20140321-22
• [Presentation] 野生イネ(Oryza rufipogon)の遺伝的背景における種子脱粒性遺伝子座間の相互作用 (2014)
  • Author(s): 井上 千鶴 ; Than Myint Htun ; 石井 尊生 ; 石川 亮
  • Organizer: 日本育種学会第125回講演会
  • Place of Presentation: 東北大学
  • Year and Date: 20140321-20140322
• [Presentation] 野生イネ(Oryza rufipogon)の遺伝的背景における栽培化関連形質の評価 (2014)
  • Author(s): 西村 彬則 ; 岩崎 友哉 ; 山本 知佳 ; 石川 亮 ; 石井 尊生
  • Organizer: 日本育種学会第125回講演会
  • Place of Presentation: 東北大学
  • Year and Date: 20140321-20140322
• [Presentation] A closed panicle trait regulated by OsLG1 in domesticated rice, Oryza sativa L. (2013)
  • Author(s): Ishikawa R., Miura K., Yoshida K., Numaguchi K., Htun T.M., Thanh P.T., Matsumoto T., Yamasaki M., Terauchi R., Ashikari M., Ishii T.
  • Organizer: 7th International Conference of Rice Genetics
  • Place of Presentation: Dusit Thai Hotel Manila, Philippine
  • Year and Date: 20131105-20131107
• [Presentation] Evaluation of genetic diversity among rice varieties in Cambodia (2013)
  • Author(s): Chhourn O., Ishikawa R., Sophany S., Makara O., Ishii T.
  • Organizer: 7th International Conference of Rice Genetics
  • Place of Presentation: Dusit Thai Hotel Manila, Philippine
  • Year and Date: 20131105-20131107
• [Presentation] Closed panicles in rice domestication (2013)
  • Author(s): Ishii T., Numaguchi K., Miura K., Yoshida K., Thanh P.T., Htun T.M., Yamasaki M., Matsumoto T., Terauchi R., Ishikawa R., Ashikari M.
  • Organizer: 7th International Conference of Rice Genetics
  • Place of Presentation: Dusit Thai Hotel Manila, Philippine
  • Year and Date: 20131105-20131107
  • Invited
• [Presentation] Wild QTLs analysis for agronomic traits using recombinant inbred lines between Oryza rufipogon and O. sativa (2013)
  • Author(s): Pham Thien Thanh, Phuong Dang Thai Phan, 石川 亮, 石井 尊生
  • Organizer: 日本育種学会第124回講演会
  • Place of Presentation: 鹿児島大学
  • Year and Date: 20131012-20131013
• [Presentation] 穂が閉じることによって野生イネはどう変化したか？ (2013)
  • Author(s): 沼口 孝司, Htun Than Myint, Thanh Pham Thien, 石川 亮, 石井 尊生
  • Organizer: 日本育種学会第124回講演会
  • Place of Presentation: 鹿児島大学
  • Year and Date: 20131012-20131013