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2013 Fiscal Year Annual Research Report

ビタミンD受容体のポケット構造を制御するリガンドの戦略的創製

Research Project

Project/Area Number 23590135
Research InstitutionShowa Pharmaceutical University

Principal Investigator

山本 恵子  昭和薬科大学, 薬学部, 教授 (90147017)

KeywordsビタミンD / 受容体 / アゴニスト / アンタゴニスト / パーシャルアゴニスト / 結晶構造 / 遺伝子転写 / 核内受容体
Research Abstract

ビタミンD受容体のリガンド結合ポケットにおける3つの構造可変部位に着目し、それらの構造を制御するリガンドを創製することで、選択的作用をもつリガンド開発をめざした。3つの可変部位のうち、ブチル基を収容することが知られていたキャビティーAの構造を制御する化合物は多数合成できた。それらは、ビタミンD受容体のアゴニスト、パーシャルアゴニストからアンタゴニストまで幅広い活性を示した。すなわち、多彩な活性化合物を創製できた。ビタミンD受容体リガンド結合領域との共結晶化を試みた結果、いくつかの複合体の良好な結晶が得られた。それらを用いてX線回折実験を行ったところ、高い分解能の回折データを得た。計算・精密化の結果、電子密度マップよりパーシャルアゴニストの一つにおいて興味深い結果を得た。すなわち、この化合物は、単結晶中に、側鎖のブチル基がブチルポケットに収容されるアゴニスト型(30%)と、水酸基を持つオリジナル側鎖がブチルポケットに収容されるアンタゴニスト型(70%)の2つの配座で存在することが明らかになった。結晶構造の結果から、この化合物がパーシャルアゴニストとしてふるまった理由は、2つの配座が混在することによる活性化の和によるものと考えられた。本研究は、核内受容体/リガンド複合体中の単結晶中にアゴニスト結合コンフォマーとアンタゴニスト結合コンフォマーの両方を補足した初めての例であり、パーシャルアゴニズム発現機構の分子基盤となると考えられる。本成果は、Journal of Medicinal Chemistry (DOI: 10.1021/jm500392t)に受理された。

  • Research Products

    (7 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] A mixed population of antagonist and agonist binding conformers in a single crystal explains partial agonism against vitamin D receptor: Active vitamin D analogues with 22R-alkyl group.2014

    • Author(s)
      Anami Y, Itoh T, Egawa D, Yoshimoto N, Yamamoto K.
    • Journal Title

      J. Med. Chem.

      Volume: 57 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1021/jm500392t

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ビタミンDと関連タンパク質(CYP,DBP,VDR)の構造生命科学2013

    • Author(s)
      山本恵子
    • Journal Title

      ビタミン

      Volume: 87 Pages: 669-677

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ビタミンD受容体の活性コンフォメーション形成を阻止するスーパーアンタゴニストの創製研究

    • Author(s)
      加藤 晃、吉本 暢子、伊藤 俊将、山本 恵子
    • Organizer
      第24回日本レチノイド研究会学術集会
    • Place of Presentation
      星薬科大学(東京都、品川区)
  • [Presentation] 22R-アルキルビタミンD誘導体/受容体複合体のX線結晶構造解析

    • Author(s)
      穴見 康昭、吉本 暢子、伊藤 俊将、山本 恵子
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第8回年会
    • Place of Presentation
      東京医科歯科大学(東京都、文京区)
  • [Presentation] Synthesis and Characterization of Active Vitamin D Analogues with 22R-alkyl Group

    • Author(s)
      Yasuaki Anami, Nobuko Yoshimoto, Toshimasa Itoh, Keiko Yamamoto
    • Organizer
      14th Tetrahedron Symposium
    • Place of Presentation
      Hilton Vienna (Vienna, Austria)
  • [Presentation] 結晶構造に基づくビタミンD受容体パーシャルアゴニスト作用の分子基盤研究

    • Author(s)
      穴見 康昭、伊藤 俊将、山本 恵子
    • Organizer
      日本薬学会第134年会
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本県、熊本市)
  • [Presentation] ビタミンDと関連タンパク質(CYP, VDR, DBP)の構造生命科学

    • Author(s)
      山本恵子
    • Organizer
      日本ビタミン学会第65回大会
    • Place of Presentation
      一橋講堂(東京都、千代田区)
    • Invited

URL: 

Published: 2015-05-28  

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