日本人原発性胆汁性肝硬変の病態形成に関わる遺伝因子同定のための網羅的遺伝子解析

2011 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 23591006
• Research Institution: Department of Clinical Research, National Hospital Organization Nagasaki Medical Center
• Principal Investigator: 中村 稔 独立行政法人国立病院機構(長崎医療センター臨床研究センター), 臨床研究センター, 客員研究員 (40217906)
• Project Period (FY): 2011-04-28 – 2014-03-31
• Keywords: 原発性胆汁性肝硬変 / 全ゲノム関連解析 / 疾患感受性遺伝子 / 予後予測マーカー

Research Abstract

全国から新たに500例以上のPBC症例を集積して、患者の臨床情報、血清の自己抗体　プロフィル（抗ミトコンドリア抗体、抗gp210抗体, 抗セントロメア抗体、抗SS-A抗体、抗sp100抗体）、新たな血清マーカー（Baff, April, cytokeratin など）、遺伝子多型（HLA-DRB1, CTLA-4, MDR3 etc）などの情報を含むPBC患者データベースを構築した。　既に昨年度までの研究で集積しているPBC 700 症例も同様の形式でデータベースを完成し、合計1200名のPBC患者検体を用いて網羅的遺伝子解析を解析した。　現在までに500症例をdiscovery panel、残りの症例を700症例をreplication panel に振り分けて、まず500症例と健常人コントロール500症例のGWASを施行した。discovery panelで有意となった上位40 SNPs を選択し、replication panelの症例を用いてDig-Tag2法にてreplication studyを行った。Replication studyで有意なSNPについては、その候補遺伝子領域に特異的なプライマーを設計し、haplotype block毎にSNPを解析し、最も有意となるSNPを同定した。以上の研究から、新たなPBC疾患感受性遺伝子を2個同定することができた（AJHG in press, 2012）

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

症例登録、遺伝子解析はほぼ予定通りに順調に進んでおり、達成率は90％を越えている。

Strategy for Future Research Activity

同定した新規疾患感受性遺伝子の肝生検組織のmRNAの発現やin vitroの発現実験からSNPの機能解析を行う。　また、日本人PBCの進行や自己抗体産生（抗gp210抗体, 抗セントロメア抗体）に関わる遺伝要因を明らかとするために、新たにPBC700症例のGWASを行い、total 1200症例の層別化解析を行う。　HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1, HLA-DPA1,HLA-DPB1の遺伝子型を全症例においてPCR-SBT法を用いて決定し、HLA遺伝子多型とPBCの発症、進行（非進行、門脈圧亢進症型進行、肝不全型進行）、自己抗体産生（抗ミトコンドリア抗体、抗gp210抗体、抗セントロメア抗体、抗SS-A抗体、抗sp100抗体）との関連を解析する。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

研究費の大半は、GWASのためのキット、DNAの抽出、遺伝子増幅に必要な試薬の購入にあてる。

Research Products

• [Journal Article] Genetic polymorphisms of CTLA4 and SLC4A2 are differently associated with the pathogenesis of primary biliary cirrhosis in Japanese patients. (2011)
  • Author(s): Aiba Y, Nakamura M, Joshita S, Inamime T, Komori A, Yoshizawa K, Umemura T, Horie H, Migita K, Yatsuhashi H, Nakamuta M, Fukushima N, Saoshiro T, Hayashi S, Kouno et al
  • Journal Title: J Gastroenterol 2011 Volume: 46 Pages: 1203-1212
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A polymorphism in the integrin alfa V subunit gene affects the progression of primary biliary cirrhosis in Japanese patients. (2011)
  • Author(s): Inamine T, Nakamura M, Kawauchi A, Shirakawa Y, Hashiguchi H, Aiba Y, Taketomi A, Shirabe K, Nakamuta M, Hayashi S, Saoshiro T, Komori A, Yatsuhashi H, Kondo S, Omagari K, etal
  • Journal Title: J Gastroenterol Volume: 46 Pages: 676-686
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Positive anti-gp210 antibodies is a risk factor for poor biochemical response to ursodeoxycholic acid treatment in Japanese patients with primary biliary cirrhosis. (2011)
  • Author(s): Nakamura M, Ito M, Yamamoto K, Zeniya M, Ohira H, Hashimoto E, Honda M, Kaneko S, Ueno Y, Kikuchi K, Onji M, Shimoda S, Takikawa H, Tanaka A, Komori A, Yatsuhashi H,et al
  • Journal Title: J Hepatol 2011 Volume: 54,Suppl No1 Pages: S514-515
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Positive anti-gp210 antibodies is a significant risk factor for bile duct loss, hepatitis and poor biochemical response to ursodeoxycholic acid treatment that lead to more severe progression in Japanese patients with primary biliary cirrhosis. (2011)
  • Author(s): Nakamura M, Ito M, Kondo H, Yamamoto K, Ohira H, Zeniya M, Tanaka A, Hashimoto E, Honda M, Kaneko S, Ueno Y, Kikuchi K, Shimoda S, Komori A, Harada K, Sakisaka S, Takikawa H, Onji M, et al
  • Journal Title: Hepatology 2011; 54, Supple 1208A-1209A. Volume: 54, Supple Pages: 1208A-1209A
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Single-nucleotide polymorphism analysis of the organic cation transporter 1 gene for the detection of onset and clinical progression in Japanese patients with primary biliary cirrhosis. (2011)
  • Author(s): Ohishi Y, Kohjima M, Fukushima N, Yoshimoto T, Fukuizumi K, Yada M, Ishibashi H, Nakamura M, Enjoji M, Nakamuta M.
  • Journal Title: Hepatology 2011: 54, Supple 1199A-1200A. Volume: 54, Supple Pages: 1199A-1200A
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 日本人原発性胆汁性肝硬変における免疫関連分子の遺伝子多型の解析 (2011)
  • Author(s): 相葉佳洋,稲嶺達夫,城下智,小森敦正,右田清志,八橋弘,中牟田誠,福嶋伸良,竿代丈夫,林茂樹,渡部幸夫,矢倉道泰,高野弘嗣,室豊吉,太田肇,島田昌明,米田俊貴,山下晴弘,竹崎英一,古賀満明,小松達司,小林正和,杉和洋,高橋正彦,正木尚彦,吉澤要,塚元和弘,石橋大海,中村稔
  • Organizer: 第47回日本肝臓学会総会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 20110602-03
• [Presentation] 日本人原発性胆汁性肝硬変におけるCTLA4,IL12A,IL12RB2,IRF5,染色体17q12-21領域の遺伝子多型の解析 (2011)
  • Author(s): 相葉佳洋、城下 智、吉澤 要、梅村武司、小森敦正、右田清志、八橋 弘、石橋大海、中村 稔
  • Organizer: 第39回日本臨床免疫学会総会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2011.9.15-17
• [Presentation] 日本人原発性胆汁性肝硬変のOCT-1遺伝子の多型解析 (2011)
  • Author(s): 大石裕樹、石川奈緒子、石橋 誠、福嶋伸良、中牟田誠、相葉佳洋、小森敦正、石橋大海、中村 稔
  • Organizer: 第20回西日本臨床胆汁酸研究会
  • Place of Presentation: 大阪
  • Year and Date: 2011.7.23
• [Presentation] 日本人原発性胆汁性肝硬変におけるIL12A,IL12RB2,IRF5,染色体17q12-21領域の遺伝子多型の解析 (2011)
  • Author(s): 相葉佳洋、小森敦正、右田清志、八橋 弘、石橋大海、中村 稔
  • Organizer: 第48回日本消化器免疫学会総会
  • Place of Presentation: 金沢
  • Year and Date: 2011.7.21-22
• [Presentation] 原発性胆汁性肝硬変の自己抗体、病理学的スコア、治療反応性と予後の相関解析. (2011)
  • Author(s): 中村 稔、伊東正博、山本和秀、大平弘正、銭谷幹男、田中 篤、橋本悦子、本多政夫、金子周一、上野義之、菊池健太郎、下田慎治、小森敦正、原田憲一、向坂彰太郎、滝川 一、恩地森一
  • Organizer: 第47回日本肝臓学会総会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2011.6.2-3
• [Presentation] 原発性胆汁性肝硬変(PBC)における病因病態の解析 (2011)
  • Author(s): 下田慎治、中村 稔、石橋大海
  • Organizer: 第15回日本肝臓学会大会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2011.10.20-21
• [Presentation] 原発性胆汁性肝硬変において抗gp210抗体および抗セントロメア抗体は薬物治療効果の予測因子となり得るか (2011)
  • Author(s): 福嶋伸良、中村 稔、福泉 公仁隆、吉本剛志、國府島 庸之、後藤 和人、河邉 顕、水谷 孝弘、小森敦正、原田直彦、中牟田誠、石橋大海、佐田通夫
  • Organizer: 第15回日本肝臓学会大会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2011.10.20-21