拡張型心筋症を伴う常染色体優性遺伝性ネマリンミオパチーの新規原因遺伝子同定

2013 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 23591233
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 市川 弥生子 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (90341081)
• Keywords: 網羅的ゲノム解析 / 次世代シークエンサー / ネマリンミオパチー / 拡張型心筋症

Research Abstract

拡張型心筋症を伴う常染色体優性遺伝性ネマリンミオパチーの一家系について解析を行った。発症者2名、非発症者2名、発端者の親(Married in)について当科で開発したSNP HiTLink(Fukuda et al., BMC Bioinformatics. 2009)を用いて連鎖解析を行い、約800kbの候補領域を定めた。
発症者2名(発端者およびその親)、発端者の親(Married in)について、次世代シークエンサーを用いた網羅的ゲノム解析を行った。発端者については、全ゲノム解析も行った。その結果、既知のデータベース(dbSNP)に認めない一塩基置換変異および小挿入/欠失変異は11708個で、候補領域内にある変異は67個であった。このうち、Married inの親のexome解析で検出された30個の変異を除き、発症者2名で共通している変異は16個あった。この16個の変異について、サンガー法を用いて家系内での変異を確認するとともに、日本人1200人ゲノムプロジェクトによるHuman Genetic Variation Browser、当院における正常対照および症例コントロールのインハウスデータベースにて検索した。その結果、これらのデータベースに存在せず、家系内で発症者にのみ共通している変異は2個に絞り込まれた。
現在、この2個の候補変異については、変異を培養細胞に導入し、機能解析を行い、病的変異の可能性について検討を行っている。

Research Products

• [Journal Article] Rapid detection of expanded short tandem repeats in personal genomics using hybrid sequencing (2014)
  • Author(s): Doi K, Monjo T, Hoang PH, Yoshimura J, Yurino H, Mitsui J, Ishiura H, Takahashi Y, Ichikawa Y, Goto J, Tsuji S, Morishita S
  • Journal Title: Bioinformatics Volume: 30 Pages: 815-22
• [Journal Article] An open trial of long-term testosterone suppression in spinal and bulbar muscular atrophy (2013)
  • Author(s): Yamamoto T, Yokota K, Amao R, Maeno T, Haga N, Taguri M, Ohtsu H, Ichikawa Y, Goto J, Tsuji S
  • Journal Title: Muscle Nerve Volume: 47 Pages: 816-22
• [Journal Article] Mutations in COQ2 in familial and sporadic multiple-system atrophy (2013)
  • Author(s): Multiple-System Atrophy Research Collaboration
  • Journal Title: N Engl J Med Volume: 369 Pages: 233-44
• [Journal Article] Exome analysis reveals a Japanese family with spinocerebellar ataxia, autosomal recessive 1 (2013)
  • Author(s): Ichikawa Y, Ishiura H, Mitsui J, Takahashi Y, Kobayashi S, Takuma H, Kanazawa I, Doi K, Yoshimura J, Morishita S, Goto J, Tsuji S
  • Journal Title: J Neurol Sci Volume: 331 Pages: 158-60
• [Journal Article] ERBB4 Mutations that Disrupt the Neuregulin-ErbB4 Pathway Cause Amyotrophic Lateral Sclerosis Type 19 (2013)
  • Author(s): Takahashi Y, Fukuda Y, Yoshimura J, Toyoda A, Kurppa K, Moritoyo H, Belzil VV, Dion PA, Higasa K, Doi K, Ishiura H, Mitsui J, Date H, Ahsan B, Matsukawa T, Ichikawa Y, Moritoyo T, Ikoma M, Hashimoto T, Kimura F, Murayama S, Onodera O, Nishizawa M, Yoshida M, Atsuta N, Sobue G; JaCALS, Fifita JA, Williams KL, Blair IP, Nicholson GA, Gonzalez-Perez P, Brown RH Jr, Nomoto M, Elenius K, Rouleau GA, Fujiyama A, Morishita S, Goto J, Tsuji S
  • Journal Title: Am J Hum Genet Volume: 93 Pages: 900-5
• [Presentation] 神経内科領域における遺伝子診断の現況と課題. (2013)
  • Author(s): 市川弥生子, 西垣昌和, 今井 靖, 平田恭信, 辻 省次, 後藤 順
  • Organizer: 第54回日本神経学会学術大会
  • Place of Presentation: 東京（東京国際フォーラム）
  • Year and Date: 20130529-20130601
• [Presentation] 神経・筋疾患における遺伝子検査の有用性
  • Author(s): 市川弥生子, 石浦浩之, 三井 純, 松川敬志, 田中真生, 高橋祐二, 後藤 順, 辻 省次
  • Organizer: 第20回日本遺伝子診療学会大会
  • Place of Presentation: 東京(アクトシティ浜松コングレスセンター)