2011 Fiscal Year Research-status Report
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23591319
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| Research Institution | Wakayama Medical University |
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Principal Investigator |
古田 浩人 和歌山県立医科大学, 医学部, 講師 (90238684)
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| Project Period (FY) |
2011-04-28 – 2014-03-31
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| Keywords | 糖尿病 / MODY |
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| Research Abstract |
Maturity-onset diabetes of the young (MODY)は、糖尿病が常染色体優性遺伝形式で若年から発症している家系に与えられる臨床診断名である。MODYの原因遺伝子のいくつかはすでに明らかとなってはいるが、日本人MODY家系の主要な原因遺伝子はいまだ不明である。ヒトのゲノムからエキソン領域のみを濃縮しその配列を解析するエキソーム解析が、単一遺伝子病の原因遺伝子解析の新たな手法として用いられるようになってきている。 本研究では、同法を利用して未知のMODY遺伝子を明らかにしたいと考えている。 平成23年度は、サンガー法による遺伝子変異解析、multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA)法による構造異常解析の両者により既知MODY遺伝子に変異を認めない家系のうち1家系において、whole exome sequence解析を行った。具体的には、SureSelect Human All Exon kitを用いヒトゲノムからターゲットである全エキソン領域を濃縮後、HiSeq2000システムを用いpaired end法によりシークエンスを行った。得られたデータのaveraged depth on targetは約50回、＞8X coverageは約80％であり、約45万個のSNV/InDelが検出された。同定されたSNV/InDel のうち、原因となる遺伝子変異である可能性が高い、ミスセンス変異、ノンセンス変異、スプライスサイト変異、挿入・欠失変異の総数は9179個であり、そのうち、NCBIのデータベース（dbSNP135）に登録のないものは871個であった。現在、変異が遺伝子機能におよぼす影響をin silicoで解析すると共に家系解析で糖尿病との連鎖を検討している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の計画通り、whole exome sequence解析にてMODYの原因となる可能性のある遺伝子変異が複数個検出されており、おおむね順調に進展していると考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
エキソーム解析に関しては、他の家系において同様の解析を行う。さらに、H23年度のエキソーム解析にて検出された遺伝子変異に関しては、家系内で糖尿病と連鎖しているか否かをサンガー法による遺伝子変異解析により検討するとともに、臨床的特徴が似通っている他のMODY家系で同じ遺伝子に変異が認められるかを検証する。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
エキソーム解析およびサンガー法による遺伝子変異解析を中心に使用する予定である。
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[Journal Article] Komori T, Doi A, Nosaka T, Furuta H, Akamizu T, Kitamura T, Senba E, Morikawa Y: Regulation of AMP-activated protein kinase signaling by AFF4, a member of the AF4 (ALL1-fused gene from chromosome 4) family of transcription factors, in hypothalamic neurons.2012
Author(s)
Komori T, Doi A, Nosaka T, Furuta H, Akamizu T, Kitamura T, Senba E, Morikawa Y
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Journal Title
J Biol Chem
Volume: in press
Pages: in press
Peer Reviewed
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[Journal Article] Pro 198 Leu missense polymorphism of the glutathione peroxidase 1 gene might be a common genetic predisposition of distal symmetric polyneuropathy and macrovascular disease in Japanese type 2 diabetic patient.2011
Author(s)
Matsuno S, Sasaki H, Yamazaki H, Yamaoka H, Ogawa K,,Nakatani M, Hamanishi T, Doi A, Nakano Y, Wakasaki H, Furuta H, Nishi M, Akamizu T, Nanjo K
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Journal Title
J Diabetes Invest
Volume: in press
Pages: in press
Peer Reviewed
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