2013 Fiscal Year Annual Research Report
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23591319
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| Research Institution | Wakayama Medical University |
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Principal Investigator |
古田 浩人 和歌山県立医科大学, 医学部, 准教授 (90238684)
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| Keywords | ＭＯＤＹ / 糖尿病 |
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| Research Abstract |
Maturity-onset diabetes of the young (MODY)は、糖尿病が常染色体優性遺伝形式で若年から発症している家系に与えられる臨床診断名である。MODYの原因遺伝子のいくつかはすでに明らかとなってはいるが、日本人MODYの主要な原因遺伝子はいまだ不明である。今回、ヒトのゲノムからエキソン領域のみを濃縮しその配列を解析するエキソーム解析により未知のMODY遺伝子の解明を試みた。
直接シークエンス法による遺伝子変異解析、multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA)法による構造異常解析の両者により既知MODY遺伝子に変異を認めない家系のうち1家系において、whole exome sequence解析を行った。具体的には、SureSelect Human All Exon kit（アジレント社）を用いヒトゲノムからターゲットである全エキソン領域を濃縮後、HiSeq2000システムを用いpaired end法によりシークエンスを行った。得られたデータのaveraged depth on targetは約50回、＞8X coverageは約80％であり、約45万個のSNV/InDelが検出された。同定されたSNV/InDelのうち、原因となる遺伝子変異である可能性が高い、ミスセンス変異、ノンセンス変異、スプライスサイト変異、挿入・欠失変異の総数は9179個であった。そのうち、①NCBIのデータベース（dbSNP140）や日本人の遺伝子変異データベース（The Human Genetic Variation Database)に登録がないかMAF <0.2%の稀な変異である、②家系内で糖尿病と連鎖している、③SIFTおよびPolyPhen-2を用いたin silicoでの機能障害予測解析で変異が機能に影響を与えると判定されるなどの条件を満たす変異は４個（４遺伝子）であった。現在、最終的な原因遺伝子確定のために他のMODY家系においてこれらの遺伝子の検証中である。
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[Journal Article] Familial young-onset diabetes, pre-diabetes and cardiovascular disease are associated with genetic variants of DACH1 in Chinese.2014
Author(s)
Ma RC, Lee HM, Lam VK, Tam CH, Ho JS, Zhao HL, Guan J, Kong AP, Lau E, Zhang G, Luk A, Wang Y, Tsui SK, Chan TF, Hu C, Jia WP, Park KS, Lee HK, Furuta H, Nanjo K, Tai ES, Ng DP, Tang NL, Woo J, Leung PC, Xue H, Wong J, Leung PS, Lau TC, Tong PC, Xu G, Ng MC, So WY, Chan JC
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Journal Title
PLoS One
Volume: 9
Pages: e84770
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Clinical and functional characterization of the Pro1198Leu ABCC8 gene mutation associated with permanent neonatal diabetes mellitus.2013
Author(s)
Takagi T, Furuta H, Miyawaki M, Nagashima K, Shimada T, Doi A, Matsuno S, Tanaka D, Nishi M, Sasaki H, Inagaki N, Yoshikawa N, Nanjo K, Akamizu T.
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Journal Title
J Diabetes Invest
Volume: 4
Pages: 269-273
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Genetic associations of type 2 diabetes with islet amyloid polypeptide processing and degrading pathways in asian populations.2013
Author(s)
Lam VK, Ma RC, Lee HM, Hu C, Park KS, Furuta H, Wang Y, Tam CH, Sim X, Ng DP, Liu J, Wong TY, Tai ES, Morris AP; DIAGRAM Consortium, Tang NL, Woo J, Leung PC, Kong AP, Ozaki R, Jia WP, Lee HK, Nanjo K, Xu G, Ng MC, So WY, Chan JC
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Journal Title
PLoS One
Volume: 8
Pages: e62378
DOI
Peer Reviewed
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