2011 Fiscal Year Research-status Report
ゲノム構造異常とエピゲノム異常の包括的解析に基づく新規骨髄腫治療法の開発
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23591399
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| Research Institution | Sapporo Medical University |
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Principal Investigator |
石田 禎夫 札幌医科大学, 医学部, 准教授 (20305220)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
池田 博 札幌医科大学, 医学部, 研究員 (60570132)
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| Project Period (FY) |
2011-04-28 – 2014-03-31
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| Keywords | 多発性骨髄腫 / 長鎖散在反復配列 / メチル化 |
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| Research Abstract |
多発性骨髄腫における染色体異常は極めて多様であり、その解析は、骨髄腫の発生・進展機序の解明に有用である。本研究は、アレイCGH法を用いたゲノム構造解析と、次世代シークエンサーを用いた全ゲノム領域のDNA異常メチル化解析とを組み合わせ、ゲノム・エピゲノム異常を包括的に解析し、発がん・病態進展に関連する標的遺伝子を探索することを目的とする。１）多発性骨髄腫の臨床検体の収集：当科で保有する臨床検体から核酸を抽出する。すなわち、各症例における骨髄穿刺液の単核球成分をFicollを用いて分離し、magnetic activated cell sorting (MACS) 法で抗CD138 magnetic beadsを用いて骨髄腫細胞を選択し、核酸抽出を行った。さらに検体収集と臨床情報の解析を進めている。２）ゲノム構造の解析微細なゲノム構造異常のハイスループット解析を可能としたアレイCGH法と、ヒトゲノムの約42%を占め可動遺伝因子の一種であるレトロトランスポゾンのDNA低メチル化に着目し、多発性骨髄腫における染色体不安定性とレトロトランスポゾンのDNAメチル化との関連を検討している。レトロトランスポゾンは，ゲノム上に繰り返し現れる同一の配列である反復配列に分類されており、長鎖散在反復配列（long interspersed nuclear element：LINE）と短鎖散在反復配列（short interspersed nuclear element：SINE）を有するものがある。アレイ比較ゲノムハイブリダイゼーション法（Array Comparative Genomic Hybridization：aCGH）を用いて染色体異常を分析し、メチル化との関連を検討している。その結果、正常形質細胞と比べて、MGUS、多発性骨髄腫へと進展するにつれてLINE-1の低メチル化を認めている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
これまでに正常形質細胞と比べて、MGUS、多発性骨髄腫へと進展するにつれてLINE-1の低メチル化が存在することが判明した。現在染色体異常とメチル化の関連と、予後について検討中である。
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| Strategy for Future Research Activity |
これまでの研究でMGUS、多発性骨髄腫へと進展するにつれてLINE-1の低メチル化が存在することが判明した。今後、染色体異常とメチル化の関連と、LINE-1の低メチル化と予後について検討する予定である。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
DNAアレイ、プライマー、RNA抽出キット、DNA抽出キット、Real-time PCR、抗体（WB、FACS、MACS、IHC、ELISA）、プラスチック器具、細胞培養液・FCS、アザシチジン、デシタビン等の購入に使用する予定。
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Research Products
(8 results)
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[Journal Article] Interferon-α/β and anti-fibroblast growth factor receptor 1 monoclonal antibody suppress hepatic cancer cells in vitro and in vivo.2011
Author(s)
Sasaki S, Ishida T, Toyota M, Ota A, Suzuki H, Takaoka A, Yasui H, Yamamoto H, Takagi H, Maeda M, Seito T,Tsujisaki M, Shinomura Y, Imai K.
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Journal Title
PLoS One
Volume: 6
Pages: 1-9
Peer Reviewed
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[Journal Article] Efficacy of Long-Term Treatment with Low-Dose Thalidomide for Patients with Relapsed/Refractory Multiple Myeloma.2011
Author(s)
Shimizu K, Murakami H, Sawamura M, Hattori Y, Okamoto S, Miwa A,Sugiura I, Shimazaki C,Taniwaki M,Ishida T, KosugiH,Yuge M,Iida S, Ishida T,Sunami K,Asaoku H,Sakai A,Abe M,Takagi T.
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Journal Title
International Journal of Clinical Medicine
Volume: 2
Pages: 570-575
Peer Reviewed
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[Journal Article] In vitro and in vivo antitumor effects of recombinant bispecific antibodies based on humanized anti-EGFR antibody.2011
Author(s)
Watanabe Y, Asano R, Arai K, Shimomura I, Ogata H, Kawaguchi H, Hayashi H, Ohtsuka H, Yoshida H, Katayose Y, Egawa S, Nakanishi T, Umetsu M, Ishida T, Imai K, Kudo T, Unno M, Kumagai I.
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Journal Title
Oncol Rep.
Volume: 26
Pages: 949-955
Peer Reviewed
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[Presentation] Methylome analysis using next-generation sequencing in multiple myeloma2011
Author(s)
Hiroshi Yasui, Masanori Nojima, Yuka Aoki,Shintaro Takatsuka, Reo Maruyama, Hiromu Suzuki, Toshiaki Hayashi, Hideki Asaoku, Kohzoh Imai,Minoru Toyota, Tadao Ishida, Yasuhisa Shinomura
Organizer
日本血液学会
Place of Presentation
名古屋
Year and Date
2011 – 1016
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[Presentation] GENOMIC SCREENING FOR GENES SILENCED BY DNA METHYLATION TO EXPLORE EPIGENETIC BIOMARKERS FOR PREDICTION OF SENSITIVITY TO DEXAMETHASONE IN MULTIPLE MYELOMA2011
Author(s)
ISHIDA T, YASUI H, NOJIMA M, AOKI Y, ITAGAKI M, MARUYAMA R, IKEDA H, SUZUKI H, SAKAI H, HAYASHI T, ASAOKU H, IMAI K, TOYOTA M, SHINOMURA Y
Organizer
IMW
Place of Presentation
Paris
Year and Date
2011 – 0503
