2011 Fiscal Year Research-status Report
メタゲノム解析に基づく根管内細菌叢菌種の全貌解明と根尖性歯周炎の臨床診断への応用
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23592791
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| Research Institution | Tohoku University |
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Principal Investigator |
佐藤 拓一 東北大学, 歯学研究科(研究院), 講師 (10303132)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
真柳 弦 東北大学, 歯学研究科(研究院), 助教 (10451600)
八巻 惠子 東北大学, 歯学研究科(研究院), 助教 (90182419)
河村 好章 愛知学院大学, 薬学部, 教授 (80262757)
松山 順子 新潟大学, 医歯学系, 助教 (30293236)
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| Project Period (FY) |
2011-04-28 – 2014-03-31
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| Keywords | 歯学 / 口腔細菌 / バイオフィルム / メタゲノム / 根尖性歯周炎 |
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| Research Abstract |
根先病巣の形成や歯内疾患の治癒遅延には根管内の感染細菌が関与していると考えられている。本年度は、感染根管内細菌叢についてpyrosequencing法を用いて網羅的に検出・検討した。東北大学病院を受診した3名（59～71歳）から、インフォームドコンセントを得て、感染根管象牙質を15号および45号のK-file（GC社製）を用いて採取した。16S rRNA遺伝子を標的とし、454 Genome Sequencer FLX system（Roche）によってpyrosequencingを行った。得られたシークエンス・データをBLAST search解析（97%以上の相同性）によって菌種の同定を行った。各試料から平均46,510 ± 7,090（37,207～55,117）readsのシークエンスが得られ、genusレベルで、平均75±5（70～82）菌属、speciesレベルで平均343±74（270～461）菌種が同定された。15号による試料では、Actinomyces（29.6%），Olsenella （12.6%）, Streptococcus（11.5%）, Pyramidobacter（8.8%），Prevotella（6.3%）が優勢菌属であった。また、45号での優勢菌属は、 Streptococcus（36.6%），Actinomyces（10.3%），Prevotella（9.6%），Eubacterium（5.0%）であった。Pyrosequencing法によるメタゲノム解析によって感染根管内細菌叢の詳細・多様性が明らかになり、また本解析法の精密性および迅速性から歯内治療などの歯科臨床に応用可能と考えられた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
予定通り、メタゲノム解析（実験）を行えたことから。
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| Strategy for Future Research Activity |
今年度と同様な、メタゲノム解析（実験の継続）に加えて、新規な迅速細菌計数システムの基礎実験を行う予定である。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
メタゲノム解析を継続し、加えて、新規な迅速細菌計数システムの基礎実験に費やす予定である。
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[Journal Article] Rapid quantification of bacteria in infected root canals using fluorescence filter - A pilot study on its clinical application to the evaluation of the outcomes of endodontic treatment-.2012
Author(s)
Sato T, Yamaki K, Ishida N, Shoji M, Sato E, Abiko Y, Hashimoto K, Takeuchi Y, Matsuyama J, Shimauchi H, Takahashi N
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Journal Title
Int J Dent
Volume: Volume 2012
Pages: 172935-172935
DOI
Peer Reviewed
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