2012 Fiscal Year Research-status Report
１次リンパ組織の微小環境特異的エピジェネティック制御の解明
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23616003
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| Research Institution | Hiroshima University |
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Principal Investigator |
菅野 雅元 広島大学, 医歯薬保健学研究院(医), 教授 (40161393)
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| Keywords | 胸腺 / エピジェネティックス / ポリコーム / noncoding RNA / 蛋白質複合体 / T細胞分化 |
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| Research Abstract |
研究計画の項目は、
（１）ポリコーム蛋白質複合体の精製、
（２）PcG遺伝子群の組織特異的KO(conditional Knock-Out)マウスの作成、
（３）non-codingRNAの検索、
この中で（２）（３）は順調に研究計画が推移している。しかし（１）に関しては、当初考えていたよりもポリコーム蛋白質複合体が、よりheterogeneityに飛んでいる事が分かって来た。当初は、PRC1のアイソフォームとしてPRC1mel, PRC1bmiの単離精製を目標として研究を行っていた。しかし、その後の検討により、mel-18,やbmi-1等が属するPCGFファミリー(PCGF1からPCGF6: mel-18=PCGF2, bmi1=PCGF4)がそれぞれ異なるPRC1蛋白質複合体を構築する事、さらにPCGF2とPCGF4が共通のコアユニット(CBXs,PHCs, SCMs)を共有し、PCGF3とPCGF5が共通のコアユニット(AUTS2, FBRS, FBRSL1, CKIIs)を共有する事、PCGF1、およびPCGF6は、また全く異なるコアユニットと複合体を構築する事、などが分かって来た。さらにmel-18(PCGF2)を含む複合体PRC1においても、CBXsを含む複合体と、その代わりにRYBPを含む複合体との間に動的平行関係が存在する事が判明して来た。この様な、当初予想していた異常に複雑な蛋白質複合体のheterogeneityが明らかとなった。この様な状況下で、リンパ球分化段階ごとに、どの複合体がドミナントであるかを同定しようとしている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
上記の様に（２）（３）はほぼ予定どおりに目標を達成できているが、（１）の状況が複雑になった。現在、リンパ球の各分化段階ごとに、PRC1複合体のどのフォームがドミナントであるかを同定しようとしている。さらにその機能解析法として、PcGの発現ベクター（またはshRNA発現ベクター：レトロウイルス、またはレンチウイルス）を用いて、FTOCではなくRTOCを用いて細胞分化解析、single cell程度のごく少数の細胞による蛋白質解析技術の導入・共同研究を検討している。
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| Strategy for Future Research Activity |
研究項目（１）の最大の技術的ネックは、「いかに少ない細胞数から蛋白質複合体のサブユニット組成のプロテオーム解析が出来るか？」である。プロテオーム研究会のメンバーに助言、共同研究をお願いしてこの壁を突破したい。上記のような胸腺培養法などの新しい技術導入のため、２０１２年に研究室の助教を、G.Anderson教授（Birmingham大学、英国）、G.Hollander教授（Basel, スイス／Oxford大 英国）に短期留学させた結果、胸腺に関する新しい技術を導入できたので、研究課題（２）（３）は現状のまま続行する予定。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
H24年度の未使用額が少し発生しているが、H25年度分とあわせ、最終年度であるので、ほとんど消耗品、および論文投稿関係費用に当てる予定である。消耗品は、大部分が、蛋白質複合体解析のための抗体等の費用になると思われる。
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Research Products
(5 results)
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[Journal Article] Ink4a and Arf are crucial factors in the determination of the cell of origin and the therapeutic sensitivity of Myc-induced mouse lymphoid tumor2012
Author(s)
Sugihara E, Shimizu T, Kojima K, Onishi N, Kai K, Ishizawa J, Nagata K, Hashimoto N, Honda H,Kanno M , Miwa M, Okada S, Andreeff M, Saya H
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Journal Title
Oncogene
Volume: 7;31(23)
Pages: 2849-2861
DOI
Peer Reviewed
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