2011 Fiscal Year Research-status Report
ショットガンプロテオミクスを用いた癌の診断・治療標的候補分子の網羅的解析
| Project/Area Number |
23650612
|
|---|
| Research Institution | Tokyo Medical and Dental University |
|---|
Principal Investigator |
吉田 清嗣 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (70345312)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2011-04-28 – 2013-03-31
|
| Keywords | プロテオーム / 癌 / 腫瘍マーカー |
|---|
| Research Abstract |
本研究は2DICAL法という無標識サンプル間比較解析が可能な定量性プロテオミクス解析システムを構築し、癌臨床検体の網羅的解析を行うことを目的としている。この目的達成のため、平成２３年度は様々な癌細胞株を用いて、2DICAL法による質量分析測定を行い、併せてその定量比較解析限界を検討した。これらの予備実験をふまえて、適切な条件のもと臨床検体の網羅的発現解析を順次進めていく予定である。加えて我々が焦点を当てて研究を進めているDYRK2やp53などについて、2DICAL法を用いて会合分子の単離やリン酸化部位の同定も試みた。興味深いことに、DYRK2の基質分子候補が多数同定されており、そのいくつかについて現在精力的に機能解析を進めている。いずれにしても、DYRK2という、これまでどんな働きを担っているのかほとんどわかっていなかったリン酸化酵素が、本研究を通してその機能が徐々にではあるが明らかになりつつあると考えている。また我々は近年、細胞周期に関わる分子が分裂期において特異的にリン酸化修飾されることを見出し、2DICAL法の解析システムを応用してこのリン酸化部位の同定を試みた。その結果、新たなリン酸化部位を一カ所同定することに成功した。以上より、2DICAL法はリン酸化修飾の同定にも極めて有効なシステムであることが判明した。今後は、他の翻訳後修飾、例えばアセチル化やユビキチン化などの同定にも応用できるかについても、検討を進めていく予定である。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
癌細胞株を用いた2DICAL法による質量分析測定を行い、その定量比較解析限界を検討しすることができたため、予備実験は順調に進展していると考えている。
|
| Strategy for Future Research Activity |
癌細胞株を用いた2DICAL法による質量分析測定による予備実験をふまえて、臨床検体を用いたさらなる発現解析を進めるとともに、腫瘍マーカーの可能性に繋がる分子の同定を目指したい。
|
| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
本年度に引き続き、本研究の遂行に必要な消耗品を購入する予定である。
|
Research Products
(4 results)
