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2013 Fiscal Year Final Research Report

Characterization of large-scale genome-reduced fission yeast strains

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 23651206
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Applied genomics
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

TAKEGAWA Kaoru  九州大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (50197282)

Project Period (FY) 2011 – 2013
Keywords分裂酵母 / 遺伝子削除 / 物質生産 / 代謝機能
Research Abstract

The gene number of Schizosaccharomyces pombe belong to smallest class in free-living eukaryotes. We further reduced S. pombe gene number by genome reduction to examine a minimal gene set required for growth in laboratory condition. The genome-reduced strain has four deletion regions. As results of the genome reductions, 224 genes of total approximately 5100 genes were reduced. The quadruple-deletion strain that has total deletion size of 657.3 kb, showed some decreasing effects of the uptake of glucose and a part of amino acids in comparison with the parental strain. In the quadruple-deletion strain, cellular ATP concentration was increased 2.7-fold and the production level of an enhanced green fluorescent protein (EGFP) was improved to 1.7-fold.

  • Research Products

    (10 results)

All 2013 2012 2011

All Journal Article (2 results) Presentation (7 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Characterization of genome-reduced fission yeast strains2013

    • Author(s)
      Sasaki M, Kumagai H, Takegawa K, and Tohda H
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res

      Volume: 41(10) Pages: 5382-5399

  • [Journal Article] 染色体工学技術を利用した分裂酵母の有用物質生産システムの構築2011

    • Author(s)
      竹川 薫, 佐々木真弓, 東田英毅
    • Journal Title

      生物工学会誌

      Volume: 89 Pages: 521-523

  • [Presentation] 分裂酵母のゲノム中に複数存在するトランスポゾン様遺伝子配列を利用した異種タンパク質生産系の構築2013

    • Author(s)
      藤木真優, アリムジャン・イディリス, 竹川 薫
    • Organizer
      第31回Yeast Workshop
    • Place of Presentation
      鹿児島大学
    • Year and Date
      20131101-02
  • [Presentation] 分裂酵母ゲノムに存在するトランスポゾン様遺伝子配列を利用した異種タンパク質生産系の構築2013

    • Author(s)
      藤木真優, アリムジャン・イディリス, 竹川 薫
    • Organizer
      日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部および日本ビタミン学会近畿・中国四国・九州沖縄地区合同大会
    • Place of Presentation
      県立広島大学
    • Year and Date
      20130905-06
  • [Presentation] 分裂酵母の非必須遺伝子を大規模に削除した株の創製と諸性質の解析2013

    • Author(s)
      藤木真優, 佐々木真弓, 竹川 薫
    • Organizer
      日本生化学会九州支部例会
    • Place of Presentation
      佐賀大学
    • Year and Date
      20130518-19
  • [Presentation] 非必須遺伝子を大規模に削除した分裂酵母株の創製と物質生産への利用2013

    • Author(s)
      藤木真優, 佐々木真弓, 竹川 薫
    • Organizer
      第50回化学関連支部合同九州大会
    • Place of Presentation
      北九州市
    • Year and Date
      2013-07-06
  • [Presentation] 分裂酵母の非必須遺伝子を大規模に削除した株の諸性質の解析2012

    • Author(s)
      藤木真優・佐々木真弓・竹川 薫
    • Organizer
      第30回YEAST WORKSHOP
    • Place of Presentation
      (翠山荘) 山口市
    • Year and Date
      20121116-17
  • [Presentation] 分裂酵母の大規模遺伝子削除株の諸性質の解析2012

    • Author(s)
      藤木真優・佐々木真弓・竹川 薫
    • Organizer
      平成 24年度日本農芸化学会西日本支部及び日本栄養・食糧学会九州・沖縄支部合同大会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Year and Date
      20120928-29
  • [Presentation] 分裂酵母の染色体改変技術を利用した異種タンパク質生産法の開発2012

    • Author(s)
      竹川 薫
    • Organizer
      日本農芸化学会 2012年度大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120322-25
  • [Book] 第3章 4項 オミックス情報を用いた分裂酵母の改変, 微生物を活用した新世代の有用物質生産技術2012

    • Author(s)
      竹川 薫, 松沢智彦, 東田英毅
    • Total Pages
      70-77
    • Publisher
      シーエムシー出版

URL: 

Published: 2015-06-25  

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