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2011 Fiscal Year Research-status Report

tRNA擬態複合体分子による普遍遺伝暗号解読機構の解明

Research Project

Project/Area Number 23657071
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

伊藤 耕一  東京大学, 新領域創成科学研究科, 准教授 (10262073)

Project Period (FY) 2011-04-28 – 2013-03-31
Keywordsタンパク質合成 / tRNA分子擬態 / 遺伝暗号 / mRNA品質管理 / Gタンパク質
Research Abstract

【1】tRNA擬態複合体によるmRNA品質管理機構の分子機序解明: (1-A)古細菌由来因子の基盤活性測定系の構築:常温性生育種を中心とした古細菌に由来する、EF1α、aRF1、Pelotaのタンパク質セットの発現系を、ゲノムDNAからPCRクローニング、もしくはコドンコンテキストを最適化した遺伝子全合成により広範囲に構築し、酵母内発現系、過剰生産精製系を確立した。(1-B)tRNA擬態複合体のtRNA対応領域への変異体導入による機能性検証:古細菌因子で明らかにしたtRNA擬態構造を基にし、真核生物因子で変異体を作成しin vivoの活性測定系により機能性を検証を開始した。【2】EF1α上の共通結合インターフェースの分子解明:我々が報告したX線結晶構造からタンパク質因子(eRF1, Pelota)とGTPase側の結合部位に関しては、ともにtRNA結合部位と重複する2カ所の主要結合部位(Site 1, Site 2, 図A)が相乗的に寄与することが示唆される。古細菌から真核生物へのEF1αの分化の過程でSite 1はもっとも保存性が高く結合性も強い。古細菌の結晶構造から詳細に明らかにされたSite 2(Gドメイン密接領域)および、既知のSite1との連携機能性が、aRF1およびPelotaの相同領域でどのようにそれぞれの分子間で特異的に進化したかを検証するために、aRF1およびPelotaで、両ドメイン間のキメラ分子を作成し、それを用いたin vivo機能評価系を構築している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究室の引っ越し作業でのプランクが有ったが、検証作業のためのアッセイベクターコンストラクトの構築や活性評価系の立ち上げに成功した。

Strategy for Future Research Activity

計画予定通り研究を遂行する。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

研究室引っ越しのため、基本的な物品が足らない状況が生じたため、研究進行に必要な機材の購入を検討する。

  • Research Products

    (8 results)

All 2011 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Zhou ZPSingle molecule imaging of the trans-translation entry process via anchoring of the tagged ribosome.2011

    • Author(s)
      Zhou ZP
    • Journal Title

      J Biochem

      Volume: 149 Pages: 609-618

    • DOI

      doi: 10.1093/jb/mvr010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] tRNA mimicry in translation termination and beyond.2011

    • Author(s)
      Nakamura Y
    • Journal Title

      Wiley Interdiscip Rev (WIREs) RNA

      Volume: 2 Pages: 647-668

    • DOI

      doi: 10.1002/wrna.81

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural Basis for Translation Termination by Archaeal RF1 and GTP-bound EF1α Complex2011

    • Author(s)
      Kobayashi K
    • Organizer
      The 16th Annual Meeting of The RNA Society
    • Place of Presentation
      Kyoto, Kyoto International Conference Center
    • Year and Date
      June 12-18, 2011
  • [Presentation] Archaeal elongation factor acts as an omnipotent carrier GTPase in translational elongation, termination and mRNA surveillance2011

    • Author(s)
      Nureki O
    • Organizer
      The 16th Annual Meeting of The RNA Society
    • Place of Presentation
      Kyoto, Kyoto International Conference Center
    • Year and Date
      June 12-18, 2011
  • [Presentation] A Translational Fine-tuning by The Drg2-GTPase/Dfrp2 Complex2011

    • Author(s)
      Ishikawa K
    • Organizer
      The 16th Annual Meeting of The RNA Society
    • Place of Presentation
      Kyoto, Kyoto International Conference Center
    • Year and Date
      June 12-18, 2011
  • [Presentation] Omnipotent Role of Archaeal Elongation Factor 1 Alpha in Translation Elongation, and Termination, and Quality Control of Protein Synthesis2011

    • Author(s)
      Saito K
    • Organizer
      The 16th Annual Meeting of The RNA Society
    • Place of Presentation
      Kyoto, Kyoto International Conference Center
    • Year and Date
      20110612-18
  • [Presentation] Genetic Analyses of Critical Sites for eRF1-eRF3 Interplay in Translation Termination2011

    • Author(s)
      Wada M
    • Place of Presentation
      Kyoto, Kyoto International Conference Center
    • Year and Date
      20110612-18
  • [Remarks] なし。

URL: 

Published: 2013-07-10  

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