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2013 Fiscal Year Final Research Report

Creation of the tailor-made system for antibody production by using an autoantigenic complex

Research Project

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Project/Area Number 23657087
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Functional biochemistry
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

UCHIUMI Toshio  新潟大学, 自然科学系, 教授 (50143764)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) ITO Koshuke  新潟大学, 自然科学系, 助教 (20502397)
AOYAGI Yutaka  新潟大学, 医歯学系, 教授 (00142266)
Project Period (FY) 2011 – 2013
Keywordsリボソーム / 抗P自己抗体 / 自己抗原 / P蛋白質 / 自己免疫 / 抗体産出系 / 抗リボソーム抗体 / 国際情報交換、香港
Research Abstract

The aim of this study is to clarify the relationship between the structure and antigenicity of ribosomal autoantigen (P0-P1-P2 complex), and to develop a useful antibody-production system. Epitope analysis of the ribosomal autoantigen identified the 3 amino acids at the C-terminus, which is shared by P0/P1/P2 and responsible for anti-P recognition. It was also found that phosphorylation at Ser residues adjacent to the 3 amino acids enhanced the anti-P binding, suggesting that phosphorylation of the autoantigen is related to the antigenicity. We also found that aP1, the archaeal homologue of human P1/P2, forms a stable tetramer and that immunization of this tetramer resulted in production of antibodies to the conserved C-terminal part. When the C-terminal amino acid sequence was replaced with a sequence of another ribosomal protein, the antibody specific to the introduced sequence was produced. We thus developed a novel method to produce efficiently the antibody for a desired sequence.

  • Research Products

    (24 results)

All 2013 2012 2011 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (16 results) (of which Invited: 4 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Solution structure of human P1-P2 heterodimer provides insights into the role of eukaryotic stalk in recruiting the ribosome-inactivating protein trichosanthin to the ribosome2013

    • Author(s)
      Lee, K.M., Yusa, K., Chu, L.O., Yu, C.W., Oono, M., Miyoshi, T., Ito, K., Shaw, P.C., Wong, K.B., and Uchiumi, T
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res

      Volume: 41 Pages: 8776-8787

    • DOI

      10.1093/nar/gkt636

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray analysis of peptidyl-tRNA hydrolase from Thermus thermophilus HB82013

    • Author(s)
      Matsumoto, A., Shimizu, Y., Takemoto, C., Ueda, T., Uchiumi, T., and Ito K
    • Journal Title

      Acta Crystallogr. Sect F

      Volume: 69 Pages: 332-335

    • DOI

      10.1107/S1744309113003424

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular dissection of the silkworm ribosomal stalk complex : the role of multiple copies of the stalk proteins2013

    • Author(s)
      Baba, K., Tumuraya, K., Tanaka, I., Yao, M., and Uchiumi, T
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res

      Volume: 41 Pages: 3635-3643

    • DOI

      10.1093/nar/gkt044

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for the substrate recognition and catalysis of peptidyl-tRNA hydrolase2012

    • Author(s)
      Ito, K., Murakami, R., Mochizuki, M., Qi, H., Shimizu, Y., Miura, K., Ueda, T., and Uchiumi, T
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res

      Volume: 40 Pages: 10521-10531

    • DOI

      10.1093/nar/gks790

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis of Chimeric Ribosomal Stalk Complexes from Eukaryotic and Bacterial Sources : Structural Features Responsible for Specificity of Translation Factors2012

    • Author(s)
      Mochizuki, M., Kitamyo, M., Miyoshi, T., Ito, K., and Toshio Uchiumi T
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 17 Pages: 273-284

    • DOI

      10.1111/j.1365-2443.2012.01586.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Archaeal ribosomal stalk protein interacts with translation factors in a nucleotide-independent manner via its conserved C terminus2012

    • Author(s)
      Nomura, N., Honda, T., Baba, K., Naganuma, T., Tanzawa, T., Arisaka, F., Noda, M., Uchiyama, S., Tanaka, I., Yao, M., and Uchiumi T
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U S A

      Volume: 109 Pages: 3748-3753

    • DOI

      10.1073/pnas

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 真核生物リボソームストークタンパク質のC 末端領域におけるリン酸化が及ぼす翻訳反応への影響2013

    • Author(s)
      小野塚美穂, 馬場健太朗, 三好智博, 伊東孝祐, 内海利男
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      20131203-06
  • [Presentation] ヒトリボソームP0/P1/P2 ストークタンパク質が共有するC 末端部位と翻訳伸長因子間の相互作用2013

    • Author(s)
      小野塚美穂, 馬場健太朗, 三好智博, 伊東孝祐, 内海利男
    • Organizer
      第8回無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      新潟大学
    • Year and Date
      20131021-22
  • [Presentation] リボトキシン作用に関与するリボソームP1/P2 ダイマーの柔軟な機能構造2013

    • Author(s)
      遊佐和之, 三好智博, Ka-Ming Lee, Lai-On Chu, Conny Wing-Heng Yu, 大野萌, 伊東孝祐, Pang-Chui Shaw, Kam-Bo Wong, 内海利男
    • Organizer
      第8回無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      新潟大学
    • Year and Date
      20131021-22
  • [Presentation] Peptidyl-tRNA hydrolase の基質認識および触媒反応の構造基盤2013

    • Author(s)
      伊東孝祐, 村上僚, 望月正弘, 斉浩, 清水義宏, 三浦謹一郎, 上田卓也, 内海利男
    • Organizer
      第15回日本RNA 学会年会
    • Place of Presentation
      愛媛県県民文化会館ひめぎんホール, 松山
    • Year and Date
      20130724-26
  • [Presentation] 好熱性古細菌翻訳因子によるin vitro 翻訳系の確立2013

    • Author(s)
      鈴木隆寛, 本田貴嘉, 村上僚, 佐藤駿平, 三好智博, 伊東孝祐, 内海 利男
    • Organizer
      日本Archaea 研究会第26回講演会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      20130719-20
  • [Presentation] The ribosome has multiple "arm-like" structures to catch translation factors2013

    • Author(s)
      Uchiumi, T., Baba, K., Onozuka, M., Honda, T., Nomura, N., and Yao, M
    • Organizer
      International Conference on Nucleic Acid Enzymes and Enzymes in Human Diseases
    • Place of Presentation
      The Chinese University of Hong Kong, Hong Kong
    • Year and Date
      20130616-21
    • Invited
  • [Presentation] 超好熱性アーキアの反応系を用いて見えてきたリボソームの翻訳因子リクルート機構2013

    • Author(s)
      内海利男, 鈴木隆寛, 本田貴嘉, 馬場健太朗, 田中勲, 姚閔
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス
    • Year and Date
      20130325-27
    • Invited
  • [Presentation] ハイブリッドリボソームを用いた古細菌翻訳因子によるin vitro ペプチド鎖伸長反応系の構築2012

    • Author(s)
      鈴木隆寛, 本田貴嘉, 村上僚, 佐藤駿平, 三好智博, 伊東孝祐, 内海利男
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場, マリンメッセ福岡
    • Year and Date
      20121211-14
  • [Presentation] 動物リボソームstalk タンパク質のhinge 領域はリボトキシンの効率的作用に不可欠である2012

    • Author(s)
      遊佐和之, 大野萌, 三好智博, 伊東孝祐, 内海利男
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場, マリンメッセ福岡
    • Year and Date
      20121211-14
  • [Presentation] ヒトリボソームP0/P1/P2ストークタンパク質が共有するC 末端部位の翻訳伸長因子aEF-1α/eEF-2 との相互作用2012

    • Author(s)
      小野塚美穂, 馬場健太朗, 三好智博, 伊東孝祐, 内海利男
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場, マリンメッセ福岡
    • Year and Date
      20121211-14
  • [Presentation] 古細菌リボソームストークタンパク質aP1 ダイマーは二種類の翻訳因子aEF-1α/aEF-2 を同時に結合する2012

    • Author(s)
      本田貴嘉, 間瀬透, 伊東孝祐, 内海利男
    • Organizer
      第14回日本RNA 学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学百周年記念会館川内萩ホール
    • Year and Date
      20120718-20
  • [Presentation] 古細菌リボソームストークタンパク質aP1 と翻訳伸長因子aEF-1α 間の相互作用とaEF-1β による調節2012

    • Author(s)
      鈴木隆寛, 本田貴嘉, 佐藤駿平, 内海利男
    • Organizer
      第14回日本RNA 学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学百周年記念会館川内萩ホール
    • Year and Date
      20120718-20
  • [Presentation] リボソームには複数の"腕"がある2012

    • Author(s)
      内海利男, 野村直子, 本田貴嘉, 馬場健太朗, 長沼孝雄, 田中勲, 姚閔
    • Organizer
      第1回RIBOSOME MEETING
    • Place of Presentation
      広島大学生物生産学部
    • Year and Date
      20120315-16
    • Invited
  • [Presentation] 真核リボソームstalk に存在する2対のヘテロ二量体の翻訳伸長反応における機能の非等価性2011

    • Author(s)
      馬場健太朗, 姚閔, 田中勲, 内海利男
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      20111213-16
  • [Presentation] 動物リボソームstalk ヘテロ二量体の分子集合モードの解析2011

    • Author(s)
      馬場健太朗, 姚閔, 田中勲, 内海利男
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ホテル阪急エキスポパーク・大阪
    • Year and Date
      20110607-09
  • [Presentation] リボソームstalk 複合体による翻訳因子とリボトキシンリクルート機構

    • Author(s)
      内海利男
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会ワークショップ : セントラルドグマの基盤をなす古典的non-coding RNA の新展開
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      00001203-04
    • Invited
  • [Book] 自己免疫標的部位の解析から見えてきたリボソームの動的機能構造. 生化学85, 10号特集「リボソーム機能の調節と疾患」2013

    • Author(s)
      内海利男, 馬場健太朗, 小野塚美穂
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.sc.niigata-u.ac.jp/biologyindex/uchiumi-ito/

URL: 

Published: 2015-06-25  

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