• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2012 Fiscal Year Annual Research Report

多孔体界面におけるタンパク質結晶化

Research Project

Project/Area Number 23657104
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

松村 浩由  大阪大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (30324809)

Keywords多孔体 / 界面 / たんぱく質 / 結晶化
Research Abstract

本研究では、多孔体界面を利用して、タンパク質の構造解析に必要な良質かつ高強度のタンパク質結晶を高確率で作製する技術の開発を目的としている。様々な多孔体素材を使って濃度や塗布量の最適化を行ったところ、アガロースゲルの塗布量2マイクロリットルにおいて良好な結果が得られた。具体的には、エラスターゼの結晶化スクリーニングにおいて、多孔体がない結晶化スクリーニングでは8条件であったものが、多孔体界面での結晶化では13条件に増加した。このことから、多孔体に接触させることによって核発生が誘発されることが確認できた。
また、結晶化プレートの開発に取り組んだ。本技術を適用するためには、平坦に高濃度アガロースゲルを塗布する必要がある。そこで、市販のディスペンサーによる高濃度ゲルの塗布を試みたところ、結晶化プレートを精度高く作成できるシステムを構築できた。
そして、溶液と多孔体の界面付近にレーザーを照射することで、高確率で結晶が得られる現象を見出した。溶液と多孔体の界面付近にレーザーを照射すると、多孔体界面に対して垂直に向かう流れが発生する。それにより、レーザー照射直下にタンパク質が輸送され、局所的に高タンパク質濃度領域が形成され、核発生が促進されると予想している。このレーザー照射によってグルコースイソメラーゼにおいて核発生確率の上昇が見られた。
さらに、申請者らが見出した溶液攪拌法との組み合わせ技術を検討した。蛋白質-蛋白質複合体(GAPDH-CP12)で品質の向上がみられ、構造解析の成果にも繋がった。また、リゾチームを使った実験では、結晶の温度因子の低下が見られたため、通常の溶液攪拌と同様に品質向上に効果がある可能性があると考えられた。

  • Research Products

    (19 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (13 results) (of which Peer Reviewed: 12 results) Presentation (5 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] 転写制御因子Tup1-N末端ドメインのX線結晶構造とその複合体形成メカニズム2013

    • Author(s)
      中村太一、松村浩由、井上豪、日下菜花、田中直子、向由起夫
    • Journal Title

      日本結晶学会誌

      Volume: 55 Pages: 110-115

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of rice Rubisco and implications for activation induced by positive effectors NADPH and 6-phosphogluconate2012

    • Author(s)
      H. Matsumura, E. Mizohata, H. Ishida, A. Kogami, T. Ueno, A. Makino, T. Inoue, A. Yokota, T. Mae, and Y. Kai
    • Journal Title

      J. Mol .Biol.

      Volume: 422 Pages: 75-86

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2012.05.014

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the N-terminal domain of the yeast general corepressor Tup1p and its functional implications2012

    • Author(s)
      H. Matsumura, N. Kusaka, T. Nakamura, N. Tanaka, K. Sagegami, K. Uegaki, T. Inoue, and Y. Mukai
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 287 Pages: 26528-26538

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.369652

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the superfamily 1 helicase from Tomato mosaic virus2012

    • Author(s)
      M. Nishikiori, S. Sugiyama, H. Xiang, M. Niiyama, K. Ishibashi, S. Nakamura, T. Inoue, M. Ishikawa, H. Matsumura, and E. Katoh
    • Journal Title

      J. Virol.

      Volume: 86 Pages: 7565-7576

    • DOI

      10.1128/JVI.00118-12

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Growth of protein crystals in hydrogels prevents osmotic shock2012

    • Author(s)
      S. Sugiyama, M. Maruyama, G. Sazaki, M. Hirose, H. Adachi, K. Takano, S. Murakami, T. Inoue, Y. Mori, and H. Matsumura
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc.

      Volume: 134 Pages: 5786-5789

    • DOI

      10.1021/ja301584y

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Three-dimensional, non-invasive, cross-sectional imaging of protein crystals using ultrahigh resolution optical coherence tomography2012

    • Author(s)
      N. Nishizawa, S. Ishida, M. Hirose, S. Sugiyama, T. Inoue, Y. Mori, K. Itoh, and H. Matsumura
    • Journal Title

      Biomed. Opt. Express

      Volume: 3 Pages: 735-740

    • DOI

      10.1364/BOE.3.000735

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spatially precise, soft microseeding of single protein crystals by femtosecond laser ablation2012

    • Author(s)
      H. Yoshikawa, Y. Hosokawa, R. Murai, G. Sazaki, T. Kitatani, H. Adachi, T. Inoue, H. Matsumura, K. Takano, S. Murakami, Y. Mori, and H. Masuhara
    • Journal Title

      Cryst. Growth Des.

      Volume: 12 Pages: 4334-4339

    • DOI

      10.1021/cg300018t

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of a forced solution flow on the step advancement on {110} faces of tetragonal lysozyme crystals: direct visualization of individual steps under a forced solution flow2012

    • Author(s)
      M. Maruyama, H. Kawahara, G. Sazaki, S. Maki, Y. Takahashi, H. Y. Yoshikawa, S. Sugiyama, H. Adachi, K. Takano, H. Matsumura, T. Inoue, S. Murakami, and Y. Mori
    • Journal Title

      Cryst. Growth Des.

      Volume: 12 Pages: 2856–2863

    • DOI

      10.1021/cg300025b

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The in silico screening and X-ray structure analysis of the inhibitor complex of Plasmodium falciparum orotidine 5’-monophosphate decarboxylase2012

    • Author(s)
      Y. Takashima, E. Mizohata, S. R. Krungkrai, Y. Fukunishi, T. Kinoshita, T. Sakata, H. Matsumura, J. Krungkrai, T. Horii, and T. Inoue
    • Journal Title

      J. Biochem.

      Volume: 152 Pages: 133-138

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Human hematopoietic prostaglandin D synthase inhibitor complex structures2012

    • Author(s)
      Y. Kado, Y. Okano, N. Okazaki, K. Aritake, N. Uodome, H. Matsumura, Y. Urade, and *T. Inoue
    • Journal Title

      J. Biochem.

      Volume: 151 Pages: 447-455

    • DOI

      10.1093/jb/mvs024

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 固体ハイドロゲル中でのタンパク質結晶化2012

    • Author(s)
      杉山成、松村浩由、廣瀬未果、佐崎元、安達宏昭、高野和文、村上聡、丸山美帆子、井上豪、森勇介
    • Journal Title

      日本結晶学会誌

      Volume: 54 Pages: 300-303

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 一枚の写真 超高分解能光断層計測を活用し,タンパク質結晶の3次元・非破壊断層イメージングに成功2012

    • Author(s)
      西澤典彦、石田周太郎、松村浩由、廣瀬未果、杉山成、森勇介、井上豪、伊東一良
    • Journal Title

      O plus E

      Volume: 34 Pages: 575-576

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 天然変性タンパク質による光合成調節の新規分子メカニズム

    • Author(s)
      松村浩由、田茂井政宏、重岡成
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 50(11) Pages: 786-788

  • [Presentation] 超高分解能光断層計測によるタンパク質結晶の無侵襲観察技術2013

    • Author(s)
      松村浩由、石田周太郎、廣瀬未果、杉山成、井上豪、森勇介、伊東一良、西澤典彦
    • Organizer
      日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20130324-20130328
  • [Presentation] カルビン回路酵素RuBisCOとGAPDHの活性調節機構の解明2013

    • Author(s)
      松村浩由、溝端栄一、木津奈都子、石田宏幸、田茂井政宏、前忠彦、横田明穂、甲斐泰、和田野晃、牧野周、重岡成、井上豪
    • Organizer
      日本植物生理学会大会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      20130321-20130323
  • [Presentation] 超高分解能OCTによるタンパク質結晶の三次元イメージング2012

    • Author(s)
      西澤典彦, 石田周太郎,廣瀬未果, 杉山成, 井上豪, 森勇介, 伊東一良, 松村浩由
    • Organizer
      日本結晶学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20121025-20121026
  • [Presentation] Non-invasive, three-dimensional, cross-sectional imaging of protein crystals grown in gel2012

    • Author(s)
      Norihiko Nishizawa, Shutaro Ishida, Mika Hirose, Shigeru Sugiyama, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori,Kazuyoshi Itoh, Hiroyoshi Matsumura
    • Organizer
      日本蛋白質科学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20120620-22
  • [Presentation] ウイルススーパーファミリー1ヘリカーゼ様ドメインの結晶構造解析2012

    • Author(s)
      錦織雅樹、杉山成、相宏宇、新山真由美、石橋和大、石川雅之、松村浩由、加藤悦子
    • Organizer
      日本蛋白質科学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20120620-20120622
  • [Patent(Industrial Property Rights)] METHOD FOR OBSERVING PROTEIN CRYSTAL2012

    • Inventor(s)
      西澤典彦、松村浩由、他9名
    • Industrial Property Rights Holder
      西澤典彦、松村浩由、他9名
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2011/071332
    • Filing Date
      2012-11-22
    • Overseas

URL: 

Published: 2014-07-24  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi