2011 Fiscal Year Research-status Report
水を得た魚が森を得た猿の色覚進化の謎を解く：重複オプシン遺伝子発現分化機構の解明
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23657164
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
河村 正二 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (40282727)
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| Project Period (FY) |
2011-04-28 – 2013-03-31
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| Keywords | 遺伝子重複 / オプシン / 発現分化 / 発現制御 / 小型魚類 |
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| Research Abstract |
ゼブラフィッシュRH2タイプオプシンの４つのサブタイプ遺伝子を含むPACクローンを鋳型にして、1つの遺伝子をGFP、別の1つの遺伝子をRFPレポーター遺伝子で置換した上でRH2-LCRを移設した。それら２つの遺伝子の組合せの異なる一連のコンストラクトを作成した。また、RH2-LCR－直上域－GFPコンストラクトの直下に別の遺伝子の直上域とRFPを連結させた、２つの遺伝子組合せの異なる一連のコンストラクトを作成した。これらをゼブラフィッシュ胚に導入した。 メダカのRH2タイプオプシンの３つのサブタイプ遺伝子を含むBACクローンに対する遺伝子の蛍光レポーター置換、RH2-LCRの欠失、RH2-LCRの移設、RH2-LCR－プロモーター－蛍光レポーター連結コンストラクトの作成を行なった。メダカSWS2タイプに関しては、SWS2タイプオプシン遺伝子と蛍光マーカーを置換した改変BACクローンの作成と遺伝子の直上領域にGFPを連結させたコンストラクトの作成を行なった。 グッピーLWSオプシン遺伝子群の発現様式をin situ hybridizationと定量PCRで調べた。それらのオプシン視物質の再構成に向けてベクターの構築と細胞系の検討を行なったを。トリニダッドトバゴ由来の集団サンプルについてLWS-2遺伝子の塩基配列決定を行なった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
遺伝子導入実験が予定より遅れているが、当初の予定より多くのDNAコンストラクトを作成した。視物質再構成のために培養細胞系のよりより構築にむけて検討を重ねた。グッピーは当初より多くの個体について配列決定を行なった。
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| Strategy for Future Research Activity |
視物質再構成を開始する。グッピーの集団データを集団遺伝学的方法により解析する。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
ゼブラフィッシュとメダカのLWS、SWS2、RH2について重複遺伝子の制御領域の探索を継続する。次世代のゲノムに導入遺伝子を伝えるトランスジェニックラインにおいて蛍光マーカーの網膜での発現様式を、胚期から成魚まで時間を追って観察する。短いDNAコンストラクトの導入においては、多コピーがゲノムに挿入されるとRH2-LCRと遺伝子間の距離と相対位置が確定できなくなるため、転移酵素遺伝子Tol2のmRNAを共導入することで単一コピーでの組込みを行なう。グッピーLWSの吸収波長を明らかにし、集団遺伝学解析から集団多様性に関係する自然選択を検証する。
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[Journal Article] A population genetic study on the relationship between medaka fish and the spread of wet-rice cultivation across the Japanese archipelago2012
Author(s)
Katsumura, T., Oda, S., Tsukamoto, K., Sekiya, Y., Yamashita, T., Aso, M., Hata, M., Nonaka, M., Mano, S., Ishida, H., Mitani, H., Kawamura, S. and Oota, H.
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Journal Title
Anthropological Science
Volume: 120
Pages: 81-89
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Comparison of gene organization and expression of blue-sensitive (SWS2) opsins among medaka fish species2011
Author(s)
Aso, M., Takishima, N., Matsumoto, Y., Oda, S., Mitani, H. and Kawamura, S.
Organizer
17th Japanese Medaka and Zebrafish Meeting
Place of Presentation
Toray Human Resource Development Center, Mishima
Year and Date
September 8-9, 2011
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[Presentation] Allelic variations of cytochrome P450 genes in wild medaka populations: curious similarities to humans' polymorphisms and their functions2011
Author(s)
Katsumura, T., Oda, S., Mitani, H., Kawamura, S. and Oota, H.
Organizer
Isogenic Medaka Workshop
Place of Presentation
European Bioinformatics Institute (EBI), Hinxton, UK
Year and Date
September 26-27, 2011
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[Presentation] Comparison of gene organization and expression of blue-sensitive (SWS2) opsins among medaka fish species2011
Author(s)
Aso, M., Takishima, N., Matsumoto, Y., Oda, S., Mitani, H. and Kawamura, S.
Organizer
Annual Conference of Soceity for Molecular Biology and Evolution 2011 (SMBE 2011)
Place of Presentation
Kyoto University (Clock Tower Centennial Hall and Shiran Kaikan) and Miyako Messe, Kyoto
Year and Date
July 26-30, 2011
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[Presentation] Allelic variations of cytochrome P450 genes in wild medaka populations: a parallelism to human alleles2011
Author(s)
Katsumura, T., Oda, S., Mitani, H., Kawamura, S. and Oota, H.
Organizer
Annual Conference of Soceity for Molecular Biology and Evolution 2011 (SMBE 2011)
Place of Presentation
Kyoto University (Clock Tower Centennial Hall and Shiran Kaikan) and Miyako Messe, Kyoto
Year and Date
July 26-30, 2011
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[Presentation] Spectral characterization of guppy visual opsins2011
Author(s)
Kasagi, S., Tezuka, A., Kawata, M. and Kawamura, S.
Organizer
Annual Conference of Soceity for Molecular Biology and Evolution 2011 (SMBE 2011)
Place of Presentation
Kyoto University (Clock Tower Centennial Hall and Shiran Kaikan) and Miyako Messe, Kyoto
Year and Date
July 26-30, 2011
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