2013 Fiscal Year Annual Research Report
陸域地下圏のメタンフラックスに関与する未知アーキア系統群の発見と新生物機能の解明
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23681044
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| Research Institution | National Institute of Advanced Industrial Science and Technology |
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Principal Investigator |
玉木 秀幸 独立行政法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 主任研究員 (00421842)
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| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2014-03-31
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| Keywords | 未知アーキア / 陸域地下圏 / 16S rRNA遺伝子 / 環境ゲノム / 次世代シークエンス / 分離培養 / 生物地球化学 / ゲノム |
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| Research Abstract |
本研究は、陸域地下圏環境に棲息する未知・未培養アーキア群とその周辺微生物の実態を明らかにし、メタンフラックス等の重要な生物地球化学プロセスに果たす未知微生物群の役割の解明を目指している。本年度は、まず昨年度に引き続き次世代シークエンス解析技術を用いて、陸域地下圏環境における未知アーキア系統群の探索を実施した。その結果、氷河堆積物や地下湧熱水環境において未知アーキア系統群を発見する事に成功した。特に、氷河堆積物環境からはこれまでにほとんど認知されていない門、綱あるいは目レベルの未知未培養アーキア系統群を特定した。また、地下湧熱水環境からも門あるいは綱、目レベルの未培養アーキア系統群を見出した。また油ガス田環境では、門レベルの未知バクテリアとともにメタン生成菌に比較的近縁の新規アーキアが存在していることが判明した。そこで、以上の陸域地下圏環境試料を用いてシングルセルソーティングを行うとともにゲノム増幅を試みたところ、一部の未知微生物についてシングルセルゲノムの獲得に至った。また同時に、これらの未知微生物の培養化を試みており、いくつかの未知アーキアについては集積培養化に至った。また新しい機能を有したメタン生成アーキアを純粋分離し、そのゲノムを解読するとともにトランスクリプトーム解析を実施し、分離したメタン生成アーキアが非常にユニークな代謝機能をもつ事を明らかにした。このように、これまでほとんど明らかにされていなかった陸域地下圏環境の未知アーキアとその周辺微生物の実態に一歩迫る成果を挙げた。
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| Current Status of Research Progress |
Reason
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Halomonas sulfidaeris-dominated Communities Inhabit 1.8km-deep Saline Sandstone Reservoirs2014
Author(s)
Dong Y, Kumar CG, Chia N, Kim PJ, Miller PA, Price ND, Cann I, Flynn T, Sanford R, Krapac IG, Locke RA, Hong P, Tamaki H, Liu WT, Hernandez AG, Wright CL, Mikel MA, Walker JL, Sivaguru M, Fried G, Yannarell AC, Mackie R, Fouke BW
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Journal Title
Environmental Microbiology
Volume: -
Pages: -
Peer Reviewed
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[Journal Article] Methyloceanibacter caenitepidi gen. nov., sp. nov., a novel facultatively methylotrophic bacterium isolated from marine sediments near the hydrothermal vent area2013
Author(s)
Takeuchi M, Katayama T, Yamagishi T, Hanada S, Tamaki H, Kamagata Y, Ohshima K, Hattori M, Marumo K, Nedachi M, Maeda H, Suwa Y, Sakata S
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Journal Title
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
Volume: 64
Pages: 1359-1364
Peer Reviewed
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