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2012 Fiscal Year Annual Research Report

オートファジー特異的E1酵素Atg7の構造的基盤

Research Project

Project/Area Number 23687012
Research InstitutionMicrobial Chemistry Research Foundation

Principal Investigator

野田 展生  公益財団法人微生物化学研究会, 微生物化学研究所, 主席研究員 (40396297)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2014-03-31
Keywordsオートファジー / Atg7 / Atg3 / Atg10 / 構造生物学 / E1酵素 / E2酵素
Research Abstract

E1酵素Atg7は互いに相同性の低い2つのE2酵素Atg3およびAtg10の両方を認識するが,これは他のE1では見られないユニークな特徴である.今回Atg7-Atg10複合体およびAtg7-Atg3複合体の結晶構造を決定した.構造および構造に基づいた変異体解析の結果,Atg3とAtg10は同じ領域を用いてAtg7のほぼ同じ領域に結合すること,細かい相互作用様式は異なることを明らかにした.昨年度に決定したAtg7-Atg8複合体構造と合わせることで,Atg8のAtg7からAtg3への受け渡しはトランスの機構で進むことが構造からも示された.またAtg12のAtg7からAtg10への受け渡しについても構造および機能解析の両面からトランスで進むことが示された.またin vitroでの変異体解析の結果,Atg7はAtg8とAtg12を非選択的にAtg3およびAtg10へと受け渡すことが示された.これは従来の定説に反するものであり,今後のAtg7の機能研究に一石を投じるものである.
Atg12はAtg10に渡された後,Atg5と結合体を形成する.NMRおよび変異体解析の結果,Atg10はAtg5を直接認識することでE3非依存的に結合反応を担うことが示された.
Atg12-Atg5結合体はAtg3と相互作用することでAtg8とPEの結合反応を促進する.Atg12-Atg5結合体の結晶構造を決定し,Atg12はAtg3の結合モジュールとして機能することを明らかにし,Atg8結合系のE3様酵素としての機能の一端を明らかにした.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

Atg7-Atg3複合体およびAtg7-Atg10複合体の構造決定に成功し,構造情報に基づいた変異体解析の結果,予想外な転移反応のあいまい性を発見するなど,大幅な進展が見られた.

Strategy for Future Research Activity

Atg7によるAtg3, Atg8およびAtg10の認識機構が明らかとなったため,最後に残されたAtg12の認識機構を明らかにする.またこれまでの構造情報を総動員して機能解析を進め,Atg8がAtg3へ,Atg12がAtg10へと受け渡される分子機能解明を進める.

  • Research Products

    (8 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Structure of the Atg12-Atg5 conjugate reveals a platform for stimulating Atg8-PE conjugation.2013

    • Author(s)
      Noda, N. N., Fujioka, Y., Hanada, T., Ohsumi, Y. and Inagaki, F.
    • Journal Title

      EMBO Reports

      Volume: 14 Pages: 206-211

    • DOI

      10.1038/embor.2012.208.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Atg7とそのAtg8結合型の立体構造2012

    • Author(s)
      野田展生
    • Journal Title

      日本結晶学会誌

      Volume: 54 Pages: 166-171

    • DOI

      10.5940/jcrsj.54.166

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural insights into Atg10-mediated formation of the autophagy-essential Atg12-Atg5 conjugate.2012

    • Author(s)
      Yamaguchi, M., Noda, N. N., Yamamoto, H., Shima, T., Kumeta, H., Kobashigawa, Y., Akada, R., Ohsumi, Y. and Inagaki, F.
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 20 Pages: 1244-1254

    • DOI

      10.1016/j.str.2012.04.018.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Non-canonical recognition and Ubl-loading of distinct E2s by autophagy-essential Atg7.2012

    • Author(s)
      Yamaguchi, M., Matoba, K., Sawada, R., Fujioka, Y., Nakatogawa, H., Yamamoto, H., Kobashigawa, Y., Hoshida, H., Akada, R., Ohsumi, Y., Noda, N. N. and Inagaki, F.
    • Journal Title

      Nature Structural & Molecular Biology

      Volume: 19 Pages: 1250-1256

    • DOI

      10.1038/nsmb.2451.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structure and function of the autophagy-essential E1, Atg7.

    • Author(s)
      Noda, N. N., Ohsumi, Y., inagaki, F.
    • Organizer
      6th International Symposium on Autophagy: Molecular Mechanism, Cellular and Physiological Functions and Diseases
    • Place of Presentation
      Bankoku Shinryokan, Okinawa, Japan
    • Invited
  • [Presentation] オートファジーに必須なAtg結合系の構造基盤

    • Author(s)
      野田展生,大隅良典,稲垣冬彦
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡)
    • Invited
  • [Presentation] 植物Atg7-Atg3複合体構造:Atg8結合系におけるE1-E2酵素反応の洞察

    • Author(s)
      的場一晃,藤岡優子,中戸川万智子,中戸川仁,稲垣冬彦,大隅良典,野田展生
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡)
  • [Presentation] 構造に基づいた解析により明らかとなったAtg18のAtg2及びイノシトールリン脂質との異なる結合領域

    • Author(s)
      渡邊康紀,小林孝史,山本林,星田尚司,赤田倫冶,稲垣冬彦,大隅良典,野田展生
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡)

URL: 

Published: 2014-07-24  

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