• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2012 Fiscal Year Annual Research Report

生命の初期進化を模擬した実験モデルの構築

Research Project

Project/Area Number 23687034
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

市橋 伯一  大阪大学, 情報科学研究科, 招へい教員 (20448096)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2014-03-31
Keywords進化 / 生命の起源
Research Abstract

本研究では人工自己複製反応を実験的に進化させることにより、自己複製反応系は進化して生命の特徴である高効率性や複雑性を獲得することができるのかを実験的に問い、その進化過程を詳細に解析することにより、進化プロセスがどのように進行するのかを理解することを目的としている。昨年度は、RNA複製反応を約100世代にわたり継代し、今年度ではさらに約500世代継代した。昨年度に比べ継代回数が大きく上昇したのは、ある程度進化が進んだことにより、人為的な増幅作業が不要になり、効率的な実験が可能になったためである。
本年度の進化実験の結果、最終的にRNA複製反応の効率は100倍以上に上昇した。そして最終的に得られたRNAには38種類の変異が固定されていた。これらの結果は、RNA自己複製反応を継代することにより、ダーウィン型の進化が起きたことを示している。すなわち、複製エラーによりRNAの多様性が生じ、より複製能力の高いRNAがより多くの子孫を残すことによって集団内での割合を上昇させ、その結果、集団内に固定されたことを示唆している。
また最終的に得られた自己複製RNAは、一切の人為的増幅を必要としなくなった。すなわち、ただ栄養として無細胞翻訳システムを供給するだけで、ほぼ無限に増えることができるようになった。このような翻訳を介して再帰的に複製するシステムは、これまで生物以外では存在しておらず、本研究で構築されたシステムは、今後初期生命の成り立ちを理解するうえで有用である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初の計画では3年をかけて進化実験を行い、人為的な複製がなくても再帰的に自己複製できるRNAを進化させることを目的としていた。しかし、2年目となる今年度ですでにこの基準を達成したRNAが進化してきた。したがって、当初の計画以上に進展していると考えられる。これにより、最終年度は進化系列の解析に集中し、より詳細な解析が可能になるだろう。

Strategy for Future Research Activity

継代実験は予想以上に順調に進行し、ほぼ終了した。これにより、継代実験と並行して行う予定であった進化プロセス解析を来年度に集中して行う。方法としては、配列解析、および生化学解析を行う。

  • Research Products

    (9 results)

All 2013 2012

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] A controllable gene expression system in liposomes that includes a positive feedback loop.2013

    • Author(s)
      Kobori S
    • Journal Title

      Mol Biosyst.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] α-Complementation in an artificial genome replication system in liposomes.2012

    • Author(s)
      Nishiyama K
    • Journal Title

      Chembiochem

      Volume: 13 Pages: 2701-2706

    • DOI

      10.1002/cbic.201200586

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of Compartment Size on the Kinetics of Intracompartmental Multimeric Protein Synthesis.2012

    • Author(s)
      Matsuura T
    • Journal Title

      ACS Synth. Biol

      Volume: 1 Pages: 431-437

    • DOI

      10.1021/sb300041z

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Kinetic analysis of aptazyme-regulated gene expression in a cell-free translation system: modeling of ligand-dependent and -independent expression.2012

    • Author(s)
      Kobori S
    • Journal Title

      RNA

      Volume: 18 Pages: 1458-1465

    • DOI

      10.1261/rna.032748.112

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Importance of parasite RNA species repression for prolonged translation-coupled RNA self-replication.2012

    • Author(s)
      Bansho Y
    • Journal Title

      CHEMISTRY BIOLOGY

      Volume: 19 Pages: 478-487

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2012.01.019

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 人工自己複製システムのダーウィン進化2012

    • Author(s)
      市橋伯一
    • Organizer
      「細胞を創る」研究会5.0
    • Place of Presentation
      神奈川県 東京工業大学すずかけ台キャンパス
    • Year and Date
      20121121-20121122
  • [Presentation] 人工自己複製システムのダーウィン進化2012

    • Author(s)
      市橋伯一
    • Organizer
      第50回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      愛知県 名古屋大学 東山キャンパス
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] 人工自己複製RNAの実験室内進化2012

    • Author(s)
      市橋伯一
    • Organizer
      日本進化学会第14回東京大会
    • Place of Presentation
      東京都 首都大学東京南大沢キャンパス
    • Year and Date
      20120821-20120823
  • [Presentation] Darwinian Evolution of Translation-coupled RNA Self-replication System.2012

    • Author(s)
      Ichihashi N
    • Organizer
      The Thirteenth International Conference on the Synthesis and Simulation of Living Systems (Artificial Life XIII)
    • Place of Presentation
      Michigan State University in East Lansing, Michigan, USA
    • Year and Date
      20120719-20120722

URL: 

Published: 2014-07-24  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi