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2013 Fiscal Year Annual Research Report

非内在性マイクロRNAの創成と遺伝子発現制御

Research Project

Project/Area Number 23710270
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

村田 亜沙子  大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (50557121)

KeywordsマイクロRNA / cell-basedセレクション / 低分子化合物
Research Abstract

本研究の目的は,「非内在性マイクロRNA(miRNA)を創製し,それを用いて遺伝子の発現を制御する」ことである。この目的を達成するために,平成25年度は以下の5つの項目に分けて研究を進めた。
1. 人工pre-miRNAライブラリーの作製: 前年度までに,ホタルルシフェラーゼ遺伝子の3’-非翻訳領域(3'-UTR)にmiR122の標的配列を含むレポーターベクターの作製,および,成熟miR122鎖のアンチセンス側を部分的にランダム化したpre-miR122 dopedライブラリーを含む発現ベクターの調製を行った。 2. レポーター遺伝子,および人工pre-miRNAライブラリーを発現する細胞株の作製:前年度までに単離したピューロマイシン耐性耐性株を用いて,cell-basedセレクションの条件検討を行ったところ,最適な条件を見い出すに至らなかった。そこで,新たにピューロマイシン耐性株を単離し,各細胞株のピューロマイシン耐性遺伝子の発現をリアルタイムPCRにより定量し,耐性と発現量の相関を調べた。3. 低分子化合物と人工pre-miRNAとの相互作用をレポーター遺伝子の活性により評価,選別: 2で作製したピューロマイシン耐性株を用いて,化合物に結合する人工pre-miR122の配列を選別する。 4. 化合物に結合する人工pre-miRNA配列をプール化,発現ベクターへの再組み込み:3で得られた配列をプール化し,発現ベクターへ組み込んだのち,HEK293細胞へトランスフェクションする。より厳しい条件(ピューロマイシンの濃度を上げるなど)でセレクションを行う。 5. 得られた人工pre-miRNA配列と化合物による,標的遺伝子の発現制御:3, 4により得られた配列を用い,化合物によって人工pre-miR122のプロセシングが制御できるか,それにより標的遺伝子の発現を調節できるかどうかを検討する。

  • Research Products

    (7 results)

All 2014 2013

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Ligand-inducible formation of RNA pseudoknot2013

    • Author(s)
      Saki Matsumoto, Changfeng Hong, Takahiro Otabe, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 23 Pages: 3539-3541

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2013.04.037

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fluorescent indicator displacement assay of ligands targeting 10 microRNA precursor2013

    • Author(s)
      Asako Murata, Yasue Harada, Takeo Fukuzumi, Kazuhiko Nakatani
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      Volume: 21 Pages: 7101-7106

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2013.09.007

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] RNAの構造・機能を制御する小分子化合物の開発2014

    • Author(s)
      村田亜沙子
    • Organizer
      日本化学会第94春季年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      20140327-20140330
    • Invited
  • [Presentation] Synthesis of the restrained naphthyridine dimer and the exploration for binding RNA by in vitro selection2013

    • Author(s)
      Yue Di, Takahiro Otabe, Jinxing Li, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • Organizer
      ISNAC2013
    • Place of Presentation
      神奈川大学(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      20131113-20131115
  • [Presentation] Targeting secondary structures of pre-miRNA by small molecules : Development of potential inhibitors of pre-miRNA processing2013

    • Author(s)
      Asako Murata, Ayako Sugai, Takeo Fukuzumi, Shiori Umemoto, Chikara Dohno, Kazuhiko Nakatani
    • Organizer
      RNA 2013, the 18th Annual Meeting of the RNA Society
    • Place of Presentation
      Congress Center Davos (Davos, Switzerland)
    • Year and Date
      20130611-20130616
  • [Presentation] Suppression of miR-29a maturation by ligand binding2013

    • Author(s)
      Takahiro Otabe, Asako Murata, Fumie Takei, Kazuhiko Nakatani
    • Organizer
      RNA 2013, the 18th Annual Meeting of the RNA Society
    • Place of Presentation
      Congress Center Davos (Davos, Switzerland)
    • Year and Date
      20130611-20130616
  • [Presentation] Translational regulation by ligand-inducible formation of RNA pseudoknot2013

    • Author(s)
      Saki Matsumoto, Changfeng Hong, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • Organizer
      RNA 2013, the 18th Annual Meeting of the RNA Society
    • Place of Presentation
      Congress Center Davos (Davos, Switzerland)
    • Year and Date
      20130611-20130616

URL: 

Published: 2015-05-28  

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