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2011 Fiscal Year Research-status Report

ホタルルシフェラーゼの補酵素A結合部位の探索と立体選択性発現理由の解明

Research Project

Project/Area Number 23750197
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

加藤 太一郎  兵庫県立大学, 工学研究科, 助教 (60423901)

Project Period (FY) 2011-04-28 – 2014-03-31
Keywordsホタルルシフェラーゼ / チオエステル化 / 立体選択性 / 補酵素A / 結合部位
Research Abstract

発光反応を触媒する酵素として有名なホタルルシフェラーゼは、それとは全く違う立体選択的なチオエステル化反応をも触媒できる。しかし立体選択性発現理由の詳細や補酵素A(coenzyme A)結合部位など、未だ解明されていない部分もある。そこで本研究では、(1)補酵素A結合部位および構造変化に必須のアミノ酸残基を明らかにすること、また得られた情報を基に(2)立体選択性が発現する理由を解明することを目標とした研究を行うことを計画している。 本酵素はアシル-AMP形成酵素スーパーファミリーに属しており、アシル-AMP中間体を経由する2段階反応にてチオエステル化が進行する。申請者はこれまでに、カルボン酸基質としてケトプロフェンを用いたX-線結晶構造解析を進め、本基質のアシル-AMP中間体アナログとヘイケボタル由来ルシフェラーゼ(LUC-H)との複合体像取得に成功している。しかし得られた構造から補酵素A結合部位を特定することはできていなかった。 そこで本年度はまず、チオエステル化活性発現に必要なアミノ酸残基の特定を行うことを目指した。本目標を達成するために申請者は、チオエステル化段階の構造が既に明らかにされているアセチル-CoA シンセターゼの立体構造情報を利用した。本酵素とLUC-Hは高い構造類似性を示した。そこで、それぞれの酵素のドメインごとの構造や補酵素Aとの距離情報を比較することによってLUC-H中に潜むチオエステル化活性発現に重要なアミノ酸残基を予想、これらの部位へのランダム変異体ライブラリーを得た。得られた変異体についてケトプロフェンに対するチオエステル化活性および発光活性を測定した。その結果、発光活性は保持しながら、チオエステル化活性にのみ影響を与える部位を複数ヶ所見出すことに成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度の目的は類似酵素の立体構造情報を基に、ホタルルシフェラーゼにおけるチオエステル化活性発現に必要なアミノ酸残基の特定を行うことであった。検討を進めた結果、チオエステル化活性に影響を与えるアミノ酸残基として10ヶ所を超える部位を見出すことに成功した。よって本年度の目標は十分に達成できたと評価した。

Strategy for Future Research Activity

初年度の検討によって、チオエステル化活性発現に必要なアミノ酸残基を複数部位特定することができた。そこで来年度以降は、特定されたアミノ酸部位が補酵素Aの結合とドメイン構造変化のどちらに関与しているのかを明らかにすることを目指す。具体的には、特定されたアミノ酸部位が、補酵素Aの結合とドメイン構造変化のどちらに関与しているのかを明らかにするために、得られた変異体を用いた速度論解析を行う。補酵素Aに対する速度論パラメータを野生型酵素と比較することによって、どちらの要因によって酵素活性が変化したのかを明らかにする。また、デヒドロルシフェリル-AMPに対する発光阻害を指標とした活性測定も行う。これら2種類のアッセイ結果を総合することによって、それぞれの部位がチオエステル化段階においてどのような役割を担っているのかを明確にする。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

当初計画では、本年度にATTO社製 ルミノメータAB-2200(1270千円)を購入する予定であったが、共同研究先より貸与することができたため、本経費に掛かる部分について来年度以降に繰り越すこととなった。本資金のうち一部は、次年度(平成24年度)カナダにて開催予定の国際学会(ISBC2012)における成果発表旅費として利用する予定である。その他残金については来年度以降の物品購入費用に利用させていただく予定である。

  • Research Products

    (11 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (6 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] 物質生産手段としてのホタルルシフェラーゼの利用法2012

    • Author(s)
      加藤太一郎
    • Journal Title

      化学と工業

      Volume: 65 Pages: 225-226

  • [Journal Article] Enzyme Encapsulation in Freeze-dried Bionanocomposites Prepared from Chitosan and Xanthan Gum Blend2011

    • Author(s)
      H.Liu, K.Nakagawa, D.Kato, D.Chaudhary, M.O.Tadé
    • Journal Title

      Mater. Chem. Phys.

      Volume: 129 Pages: 488-494

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comparison of Acyl-CoA Synthetic Activities and Enantioselectivity toward 2-Arylpropanoic Acids in Firefly Luciferases2011

    • Author(s)
      D.Kato, K.Yokoyama, Y.Hiraishi, M.Takeo, S.Negoro
    • Journal Title

      Biosci. Biotech. Biochem.

      Volume: 75 Pages: 1758-1762

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enantiodifferentiation of Ketoprofen by Japanese Firefly Luciferase from Luciola lateralis2011

    • Author(s)
      D.Kato, T.Tatsumi, A.Bansho, K.Teruya, H.Yoshida, M.Takeo, S.Negoro
    • Journal Title

      J. Mol. Catal. B: Enzymatic

      Volume: 69 Pages: 140-146

    • DOI

      10.1016/j.molcatb.2011.01.008

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Acyl-CoA synthetase (ACS) can catalyze the amide bond formation reaction between fatty acid and amino acid2011

    • Author(s)
      D.Kato, T.Kamon, E.Nishimura, M.Takeo, S.Negoro
    • Organizer
      Biotrans2011 - 10th International Symposium on Biocatalysis
    • Place of Presentation
      Giardini Naxos (Messina) Sicily, Italy
    • Year and Date
      October 2-6, 2011
  • [Presentation] ホタルルシフェラーゼが触媒するチオエステル化反応で基質認識をつかさどる部位の解析2011

    • Author(s)
      加藤太一郎, 平石善洋, 武尾正弘, 根来誠司
    • Organizer
      第63回日本生物工学会大会(2011)
    • Place of Presentation
      東京農工大学小金井キャンパス(東京都)
    • Year and Date
      2011年9月26-28日
  • [Presentation] アシル-CoA シンセターゼは脂肪酸とアミノ酸のアミド化反応も触媒できる2011

    • Author(s)
      加藤太一郎,掃部恭弘, 西村絵梨子, 武尾正弘, 根来誠司
    • Organizer
      第63回日本生物工学会大会(2011)
    • Place of Presentation
      東京農工大学小金井キャンパス(東京都)
    • Year and Date
      2011年9月26-28日
  • [Presentation] 活性部位周辺の水素結合ネットワークに着目したホタルルシフェラーゼの発光色制御2011

    • Author(s)
      前中美華, 加藤太一郎, 久保貴矢, 丹羽一樹, 近江谷克裕, 武尾正弘, 根来誠司
    • Organizer
      第15 回生体触媒化学シンポジウム(東京)
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学薬学部芝共立キャンパス(東京都)
    • Year and Date
      2011年12月22日
  • [Presentation] ゲンジボタル由来ルシフェラーゼ活性中心における酵素-基質間相互作用2011

    • Author(s)
      前中美華, 加藤太一郎, 丹羽一樹, 近江谷克裕, 武尾正弘, 根来誠司
    • Organizer
      生物発光化学発光研究会第28回学術講演会
    • Place of Presentation
      長崎大学文教キャンパス(長崎県)
    • Year and Date
      2011年10月8日
  • [Presentation] ゲンジボタル由来ルシフェラーゼ活性中心Ser286変異体の発光活性解析2011

    • Author(s)
      久保貴矢, 加藤太一郎, 前中美華, 丹羽一樹, 近江谷克裕, 武尾正弘, 根来誠司
    • Organizer
      生物発光化学発光研究会第28回学術講演会
    • Place of Presentation
      長崎大学文教キャンパス(長崎県)
    • Year and Date
      2011年10月8日
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.eng.u-hyogo.ac.jp/msc/msc3/top.html

URL: 

Published: 2013-07-10  

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