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2011 Fiscal Year Research-status Report

哺乳類小胞体トランスロコンの機能解析

Research Project

Project/Area Number 23770151
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

木田 祐一郎  兵庫県立大学, 生命理学研究科, 助教 (10423899)

Project Period (FY) 2011-04-28 – 2013-03-31
Keywordsタンパク質膜透過 / 膜タンパク質 / トランスロコン / 小胞体 / シグナル配列 / 膜トポロジー / 生体膜 / 細胞小器官
Research Abstract

1. 小胞体トランスロコン(タンパク質膜透過チャネル)を介した膜タンパク質の構造形成において、膜貫通配列周辺の正荷電アミノ酸残基は貫通方向(膜トポロジー)を左右する主要因である。この正荷電残基をモデル分泌タンパク質に導入したところ、個数に応じて膜透過が減速・停止したことより、正荷電残基のみで透過阻害作用を発揮することを見出した。また、正荷電残基のクラスターが細胞質側表面で静電的相互作用により捕捉されることも分かった。これらの結果は、膜トポロジー決定の際の正荷電残基の作用機序の理解につながる成果である。(Fujita et al, JCS 2012)2. マルチスパン膜タンパク質である赤血球バンド3の内腔側ループにストレプトアビジンと結合するタグ配列を挿入し無細胞系にて小胞体膜に組み込ませたところ、細胞質側へのストレプトアビジン添加により複数のループで膜透過が阻害された。またこれらループの膜透過は、直後の膜貫通配列への変異導入によって減弱した。マルチスパン膜タンパク質のフォールディングにおいて、内腔側ループの中には一旦細胞質側に露出した後透過するものが存在すること、かつその膜透過に下流の膜貫通配列がかかわることが示唆された。(Yabuki, Kida et al, 投稿準備中)3. 膜透過中のポリペプチド鎖内に現れた膜貫通配列は、トランスロコンで停止し、脂質環境へと側方輸送される。系統的に疎水性を変化させた疎水性配列セットを用いて、各ステップに要求される疎水性度を検討した結果、トランスロコンによる認識に伴う透過停止と脂質膜への組み込みとでは異なる疎水性度が要求されることが分かった。また、透過停止しつつ膜組み込み不全の低疎水性配列が、トランスロコン内に停留されることも分かった。現在、疎水性配列のトランスロコン内外での挙動について更に解析を進めている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

小胞体トランスロコンによる膜貫通配列の認識及び膜組み込み機構の解析については、前述の通り順調に進んでいる。またニワトリDT40細胞を用いたトランスロコン関連因子の解析については、分子シャペロンHSP70と協調して機能するJドメインを小胞体内腔側に持つ膜タンパク質、Sec63及びDNAJC1についてノックアウト株を作成中であり、現在ヘテロノックアウト細胞は構築できている。

Strategy for Future Research Activity

小胞体トランスロコンによる膜貫通配列の認識及び膜組み込み機構の解析については、昨年度に引き続き遂行し成果をまとめる。DT40細胞を用いたトランスロコン関連因子の解析については、Sec63及びDNAJC1についてノックアウト株を作成し、タンパク質膜透過への内腔側分子シャペロンの寄与について明らかにする。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

小胞体膜透過・組み込み解析に使用する生化学実験試薬、遺伝子工学的実験試薬、プラスチック器具、DT40等を扱う培養細胞実験に使用する培地、試薬、プラスチック器具など、消耗品費には多くの費用を割く必要がある。また、本研究の成果を発表するための学会参加費、旅費、論文出版にかかる費用も相応に割り当てる。

  • Research Products

    (18 results)

All 2011 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (15 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Positive charges on the translocating polypeptide chain arrest movement through the translocon.2011

    • Author(s)
      Fujita, H., Yamagishi, M., Kida, Y., and Sakaguchi, M.
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 124 Pages: 4184-4193

    • DOI

      10.1242/jcs.086850

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A sugar chain at a specific position in the nascent polypeptide chain induces forward movement during translocation through the translocon.2011

    • Author(s)
      Yamagishi, M., Fujita, H., Morimoto, F., Kida, Y., and Sakaguchi, M.
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry

      Volume: 149 Pages: 591-600

    • DOI

      10.1093/jb/mvr011

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Marginal hydrophobic sequence with downstream positive charges is arrested at but not integrated into the ER membrane.2011

    • Author(s)
      Kida, Y., Fujita, H., and Sakaguchi, M.
    • Organizer
      EMBO conference series "Protein transport systems: structures, mechanisms, and medical aspects"
    • Place of Presentation
      Hotel Flamingo (Santa Margherita di Pula, Italy)
    • Year and Date
      April 16-19, 2011
  • [Presentation] Positive charges in translocating polypeptide chain regulate the movement through translocon.2011

    • Author(s)
      Fujita, H., Kida, Y., Yamagishi, M., and Sakaguchi, M.
    • Organizer
      EMBO conference series "Protein transport systems: structures, mechanisms, and medical aspects"
    • Place of Presentation
      Hotel Flamingo (Santa Margherita di Pula, Italy)
    • Year and Date
      April 16-19, 2011
  • [Presentation] 小胞体トランスロコンにおける疎水性配列の認識・膜組み込み機構の解析2011

    • Author(s)
      木田祐一郎,藤田英伸,阪口雅郎
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府)
    • Year and Date
      2011年9月24日
  • [Presentation] 小胞体膜トランスロコンにおけるポリペプチド鎖の動き解析2011

    • Author(s)
      藤田英伸,山岸麻里芙,木田祐一郎,阪口雅郎
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府)
    • Year and Date
      2011年9月24日
  • [Presentation] 小胞体トランスロコンを介した膜貫通セグメント形成に対するリボソームの作用2011

    • Author(s)
      山岸麻里芙,大西由希子,藤田英伸,木田祐一郎,阪口雅郎
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府)
    • Year and Date
      2011年9月24日
  • [Presentation] 小胞体トランスロコンへの組み込みを抑制するアミノ末端モチーフの解析2011

    • Author(s)
      阪上春花,岩下昌平,木田祐一郎,阪口雅郎
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府)
    • Year and Date
      2011年9月24日
  • [Presentation] 複雑な膜透過中間体が示す小胞体トランスロコンのポリペプチド鎖収容特性2011

    • Author(s)
      矢吹隆明,木田祐一郎,阪口雅郎
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府)
    • Year and Date
      2011年9月24日
  • [Presentation] 小胞体トランスロコンのタンパク質膜透過に対するコレステロールの多面的影響2011

    • Author(s)
      山本等,藤田英伸,木田祐一郎,阪口雅郎
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府)
    • Year and Date
      2011年9月23日
  • [Presentation] Effect of positive charges on the movement of polypeptide chain through the ER translocon2011

    • Author(s)
      Fujita, H., Kida, Y., Yamagishi, M., and Sakaguchi, M.
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学姫路書写キャンパス(兵庫県)
    • Year and Date
      2011年9月18日
  • [Presentation] Polypeptide movement in the protein conducting channel is modulated by cholesterol of the endoplasmic reticulum membrane.2011

    • Author(s)
      Yamamoto, H., Fujita, H., Kida, Y., and Sakaguchi, M.
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学姫路書写キャンパス(兵庫県)
    • Year and Date
      2011年9月16日
  • [Presentation] 小胞体トランスロコンを介した膜貫通配列組み込み機構の解析2011

    • Author(s)
      木田祐一郎,藤田英伸,阪口雅郎
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府)
    • Year and Date
      2011年6月8日
  • [Presentation] 小胞体トランスロコンを介した膜タンパク質構造形成への正電荷アミノ酸の寄与2011

    • Author(s)
      藤田英伸,木田祐一郎,山岸麻里芙,阪口雅郎
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府)
    • Year and Date
      2011年6月8日
  • [Presentation] タンパク質透過チャンネルでのポリペプチドの動きは小胞体膜脂質に影響される2011

    • Author(s)
      山本等,藤田英伸,木田祐一郎,阪口雅郎
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府)
    • Year and Date
      2011年6月7日
  • [Presentation] ER-targeting Suppression by Short N-terminal Motif of Peroxisomal ABC Transporter, PMP702011

    • Author(s)
      Sakaguchi, M., Iwashita, S., Yamashita, Y., Sakaue, H., and Kida, Y.
    • Organizer
      第63回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道)
    • Year and Date
      2011年6月27日
  • [Presentation] TA膜タンパク質の小胞体組み込み回避とミトコンドリア標的化機構2011

    • Author(s)
      姜公秀,高原教代,木田祐一郎,阪口雅郎
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • Year and Date
      2011年12月15日
  • [Remarks]

    • URL

      http://kyoin.u-hyogo.ac.jp/staff/sci/ykida/

URL: 

Published: 2013-07-10  

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