• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2012 Fiscal Year Annual Research Report

二環性ベータープロリン誘導体のオリゴマーの規則構造制御と機能化研究

Research Project

Project/Area Number 23790006
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

尾谷 優子  東京大学, 薬学研究科(研究院), 助教 (60451853)

Keywordsオリゴマー / シスートランス異性化 / NMR / 三級アミド / 分子動力学計算 / 規則構造 / 二環性骨格 / 分子の架橋化
Research Abstract

(1)堅牢なトランス体アミドヘリックス構造の創製:二環性の7-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン骨格の橋頭位に置換基を導入することでトランスアミド体を選択的に取るβ-アミノ酸の合成を達成した。構造解析の結果、ホモオリゴマーはトランスアミド構造をとり、温度変化にも安定なことが分かった。
(2)分子動力学計算による規則構造構築メカニズムの解明:三級アミドで連結されたオリゴマーはアミドのシス体とトランス体の平衡混合物となるため、その溶液構造は複雑となる。本研究者らの報告した三級アミド連結二環性β-アミノ酸オリゴマーは、鎖長依存的な規則構造の形成を示唆する円二色性(CD)スペクトルを示す。この現象を分子動力学計算を用いて調査した。単量体のアミド平衡の実験データを再現する独自のパラメータを設定し、biased sampling法を行い広範囲の構造探索を実現した。結果、鎖長が長くなるにつれてトランスアミド体の比が増えることが示唆された。
(3)架橋によるアミドのシス-トランス平衡の制御:以前本研究者らが報告したシスアミド型のオリゴマーは4量体までNMR解析されているが、より長鎖のオリゴマーに関して、詳細な溶液構造(ヘリックスのピッチや1ターンに要する残基数)を実験的に明らかにする必要があると考えた。ヘリックスのターンをまたいだ架橋化により、近傍の残基やその距離を調べることとした。モデル実験として、2量体の橋頭位の側鎖に末端アルケンを導入しこれを閉環メタセシス反応に付し、種々の残基間架橋生成物を得た。すると、原料の非架橋体では見られなかったトランスアミド体が観測された。これは、架橋によりシス体-トランス体のエネルギー差が減少したことにより、本アミドの動的なシス-トランス異性化平衡が観測されたという興味深い事実を示している。さらに、トランス体の比は架橋鎖が短いものほど高い傾向が見られた。

  • Research Products

    (18 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (10 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] CDC25A-inhibitory RE derivatives bind to pocket Q1 Q2 adjacent to the catalytic site2013

    • Author(s)
      Ayako Tsuchiya, 他9名
    • Journal Title

      Molecular Biosystems

      Volume: 9 Pages: 1026-1034

    • DOI

      DOI:10.1039/c3mb00003f

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Stereochemical Evidence for Stabilization of a Nitrogen Cation by Neighboring Chlorine or Bromine2013

    • Author(s)
      Tomohiko Ohwada
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the U.S.A.

      Volume: 110 Pages: 4206-4211

    • DOI

      10.1073/pnas.1300381110

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Attenuated Desensitization of β-Adrenergic Receptor by Water-Soluble N-Nitrosamines That Induce S-Nitrosylation Without NO Release2013

    • Author(s)
      Noriko Makita
    • Journal Title

      Circulation Research

      Volume: 112 Pages: 327-334

    • DOI

      10.1161/​CIRCRESAHA.112.277665

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] GPR34 is a receptor for lysophosphatidylserine with a fatty acid at the sn-2 position2012

    • Author(s)
      Hajime Kitamura, 他10名
    • Journal Title

      J. Biochemistry

      Volume: 151 Pages: 511-518

    • DOI

      DOI:10.1093/jb/mvs011

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Activation of Electrophilicity of Stable Y-Delocalized Carbamate Cations in Intramolecular Aromatic Substitution Reaction: Evidence for Formation of Diprotonated Carbamates Leading to Generation of Isocyanates2012

    • Author(s)
      Hiroaki Kurouchi, Kyoko Kawamoto, Hiromichi Sugimoto, Satoshi Nakamura, Yuko Otani, and Tomohiko Ohwada.
    • Journal Title

      J. Org. Chem.

      Volume: 77 Pages: 9313-9328

    • DOI

      DOI:10.1021/jo3020566

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 二環性β-アミノ酸二量体の側鎖間架橋によるアミドのシス-トランス平衡の制御

    • Author(s)
      劉 シン
    • Organizer
      日本薬学会第133年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
  • [Presentation] 規則構造を取る7-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン β-アミノ酸のオリゴマーの合成

    • Author(s)
      王 思遠
    • Organizer
      日本薬学会第133年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
  • [Presentation] リゾホスファチジルセリン受容体アゴニストの配座に関する研究

    • Author(s)
      中村 翔
    • Organizer
      日本薬学会第133年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
  • [Presentation] テトラヒドロピラン骨格を用いたコンホメーションを固定したリゾホスファチジルセリン誘導体の合成

    • Author(s)
      ジョン セジン
    • Organizer
      日本薬学会第133年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
  • [Presentation] 生細胞に応用可能かつ高効率的な可視光依存的ケージドNO化合物の構造最適化

    • Author(s)
      フィルマン
    • Organizer
      日本薬学会第133年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
  • [Presentation] 強酸を利用した安定なカルバメート化合物からの効率的なイソシアネートカチオン発生法の開発と芳香族求電子置換反応への応用

    • Author(s)
      黒内 寛明
    • Organizer
      日本薬学会第133年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
  • [Presentation] タモキシフェンを基盤としたグルタミン酸トランスポーター阻害剤の開発

    • Author(s)
      大和田 智彦
    • Organizer
      第30回メディシナルケミストリーシンポジウム
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀(東京都)
  • [Presentation] カルバメートから発生するY 型共役により安定化されたカチオンの求電子性の活性化と芳香族求電子置換反応への応用

    • Author(s)
      黒内寛明
    • Organizer
      第38回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀(東京都)
  • [Presentation] 可視光照射によりNOを産生する窒素ピラミッド化ニトロソアミン化合物の創製

    • Author(s)
      フィルマン
    • Organizer
      第42回複素環化学討論会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都府)
  • [Presentation] トランス型三級アミド構造を持つ二環性β-アミノ酸の合成

    • Author(s)
      王 思遠
    • Organizer
      第42回複素環化学討論会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都府)
  • [Remarks] 東京大学大学院薬学系研究科薬化学教室 ホームページ

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~yakka/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] リゾホスファチジルセリン受容体機能調節活性を有する化合物2013

    • Inventor(s)
      大和田智彦、尾谷優子、井久保仁也、中村翔、ジョンセジン
    • Industrial Property Rights Holder
      大和田智彦、尾谷優子、井久保仁也、中村翔、ジョンセジン
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2013-017817
    • Filing Date
      2013-01-31
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 自己免疫疾患治療薬2012

    • Inventor(s)
      青木淳賢、巻出久美子、井上飛鳥、大和田智彦、井久保仁也、尾谷優子
    • Industrial Property Rights Holder
      青木淳賢、巻出久美子、井上飛鳥、大和田智彦、井久保仁也、尾谷優子
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2012/062782
    • Filing Date
      2012-05-18
    • Overseas

URL: 

Published: 2014-07-24  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi