2011 Fiscal Year Research-status Report
哺乳動物細胞核に局在化する長いノンコーディングＲＮＡによる転写制御機構の解明
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23790077
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
秋光 信佳 東京大学, アイソトープ総合センター, 准教授 (40294962)
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| Project Period (FY) |
2011-04-28 – 2013-03-31
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| Keywords | 転写 / ノンコーディングＲＮＡ / 非コードＲＮＡ / がん抑制遺伝子 |
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| Research Abstract |
哺乳動物細胞の細胞核に局在する非常に長いノンコーディングRNA（非翻訳RNA、非翻訳RNAとも呼ぶ）であるMALAT1が、細胞運動促進遺伝子の転写制御を通じて、がん細胞の運動性を促進する結果を基盤に、本研究では、MALAT1による転写制御の分子機構解明を目指す。とくに、MALAT1ががん抑制遺伝子ｐ53の発現を転写レベルで負に制御している点に着目して解析した。まず、転写のルシフェラーゼレポーターアッセイ系を利用して、ｐ53遺伝子の転写プロモーター配列の中で、MALAT１による負の制御に応答する最小配列の同定を試みた。p53転写プロモーターの上流2000塩基対をルシフェラーゼ遺伝子の上流に連結したレポータープラスミドを肺がん細胞Ａ549に遺伝子導入し、さらに、ＲＮＡ干渉法でMALAT1をノックダウンすることによってプロモーター活性が変化するかを調べた。その結果、ｐ53遺伝子上流2000塩基対中に、ＭＡＬＡＴ１によって負に転写制御される配列が含まれていること確認できた。次に、この2000塩基対のＤＮＡ配列を段階的に短くしてゆき、ＭＡＬＡＴによって負に制御される最小配列の同定を試みた。その結果、約40塩基対の配列がＭＡＬＡＴ１による負の転写制御に十分な最小配列をコードすることを見出した。この40塩基対ＤＮＡ配列をMALAT1 response elementと名づけた。TRANSFACソフトウエアを用いたバイオインフォマティック解析から、このMALAT1 response element中にコードさされる転写因子結合コンセンサス配列を調査した結果、複数の転写因子の結合コンセンサス配列が見出された。現在、予想された転写因子のうち、いづれがＭＡＬＡＴ１による負の転写制御の標的になっているかを解析している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
予定通りのタイムスケジュールで研究が進行しており、想定外の問題等は生じていないため。
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| Strategy for Future Research Activity |
当初計画に従って、研究遂行にまい進する。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
当初予定におおむねしたがって、効率的かつ計画的に研究費を使用する。
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