• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2012 Fiscal Year Annual Research Report

海洋メタゲノムからの金属結合物質シデロフォアの生合成遺伝子探索と異宿主生産

Research Project

Project/Area Number 23790134
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

藤田 雅紀  北海道大学, 創成研究機構, 特任助教 (30505251)

Keywords海洋天然物 / メタゲノム / 生合成 / 異宿主生産 / シデロフォア
Research Abstract

海洋メタゲノム由来生合成遺伝子を利用した物質生産技術の基礎を築くために、医薬品のリードにもなるシデロフォアを対象に検討を行った。その結果、これまでにメタゲノムライブラリから50以上のシデロフォア生産クローンを取得し、また4つのクローンについてはその生合成遺伝子クラスター全長を決定した。そのうちの一つは遺伝子クラスター全長が25 kbp 以上あり、これは土壌および海洋メタゲノムを問わず、機能ベーススクリーニング法で取得された生合成遺伝子クラスターとしては最大級のものであり、その実用性の広さを示した。また、既知類縁遺伝子と比較した結果、新規化合物の生産が期待され、現在その生産物の解析を進めている。また、他のクローンからは2種のシデロフォアvibrioferrinとbisucaberinの生産と同定に成功しており、海洋メタゲノム法による生理活性物質の異宿主生産を実現するとともに、各種生物試験に対し試料の供給を行った。さらに、生合成遺伝子クラスターの一部を、他の遺伝子に置換した改変クラスターを構築したところ、最終産物の構造変換に成功し、生産物多様化の例を示した。一方、bisucaberin生合成酵素は未解明な点が多い酵素による大環状化反応の分子機構を解明するために有用であると考え、構造生物学的な解析を行うために結晶化を試みており、現在初期結晶の取得に成功している。この様に難培養微生物から有用遺伝子を取得するというメタゲノム法から始まり、取得した遺伝子を利用した多様な展開へと発展することができた。

  • Research Products

    (7 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Bisucaberin B, a Linear Hydroxamate Class Siderophore from the Marine Bacterium Tenacibaculum mesophilum2013

    • Author(s)
      Masaki J. Fujita
    • Journal Title

      Molecules

      Volume: 18 Pages: 3917-3926

    • DOI

      doi:10.3390/molecules18043917

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phylogenetically Novel LuxI/LuxR-type Quorum Sensing Systems Isolated Using a Metagenomic Approach2012

    • Author(s)
      Eri Nasuno
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology

      Volume: 22 Pages: 8067-8074

    • DOI

      doi: 10.1128/AEM.01442-12

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 海洋細菌からの非環状ヒドロキサム酸型シデロフォアの単離と推定生合成遺伝子のクローニング2013

    • Author(s)
      藤田 雅紀
    • Organizer
      平成25年度日本水産学会春季大会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学 (東京都)
    • Year and Date
      20130326-20130330
  • [Presentation] メタゲノム法による難培養海洋環境微生物からの新規生合成マシナリーの探索と物質生産2012

    • Author(s)
      藤田 雅紀
    • Organizer
      生合成マシナリー 第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      20121207-20121207
  • [Presentation] メタゲノム法を用いた海洋天然物の異宿主生産2012

    • Author(s)
      藤田 雅紀
    • Organizer
      日本農芸化学会東北支部会第13回若手の会
    • Place of Presentation
      星と森のロマントピア (青森県)
    • Year and Date
      20121005-20121005
    • Invited
  • [Presentation] Functional metagenomic study on marine natural products chemistry2012

    • Author(s)
      Masaki Fujita
    • Organizer
      2012 International Conference of Natural Products Biosynthesis
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台 (兵庫県)
    • Year and Date
      20120618-20120622
    • Invited
  • [Remarks] 海洋生物有機化学研究室ホームページ

    • URL

      http://www.cris.hokudai.ac.jp/fujita/index.html/lab.html

URL: 

Published: 2014-07-24  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi