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2012 Fiscal Year Annual Research Report

腸管出血性大腸菌における志賀毒素耐性機構の解明

Research Project

Project/Area Number 23790478
Research InstitutionUniversity of Miyazaki

Principal Investigator

小椋 義俊  宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 助教 (40363585)

Keywords腸管出血性大腸菌 / 志賀毒素
Research Abstract

前年度までに、O157の志賀毒素(Stx1)耐性に関わるゲノム領域をO157のフォスミドゲノムライブラリー解析により3カ所同定している。また、フォスミドライブラリーのインサートサイズは約40 kbであるが、各領域について複数のフォスミドクローンが共通にカバーしている領域を調べたところ、領域1は5遺伝子、領域2は7遺伝子、領域3は4遺伝子にまで絞ることができた。本年度では、まず、各遺伝子を個別にクローニングし、志賀毒素耐性に関わる遺伝子の特定を試みた。
Stx1発現系にpTB101 (high copy vector)を使用し、志賀毒素耐性化の候補遺伝子はpBAD33(low copy vector)でクローニングした。Stx1 発現系と各候補遺伝子発現系を同時に導入したK-12形質転換体を作成し、IPTGの添加によるStx1高発現で、生育阻害が生じない株の選択を行ったが、有意に生育阻害が回復した株は得られなかった。インサートを導入していないpTB101ベクターのみでも、IPTG添加でK-12の生育阻害が生じていることが発覚したため、Stx1発現系をpCL1920(low copy vector)へ変更したが、このベクターでもIPTG添加でK-12の生育阻害を阻害し、志賀毒素耐性化の原因遺伝子の特定に至らなかった。今後は、K-12の生育を阻害しないStx1発現系(染色体組み込み型の発現系など)を構築すること、志賀毒素耐性化に複数の遺伝子が関わっている可能性を考慮して同時に複数遺伝子を発現する系を構築すること、非コード領域が耐性化に関わる可能性を検証することなどを行う予定である。

Research Products

(14 results)

All 2013 2012

All Journal Article Presentation Book

  • [Journal Article] Transcriptomic analysis of four developmental stages of Strongyloides venezuelensis2013

    • Author(s)
      E. Nagayasu, Y. Ogura, T. Itoh, A. Yoshida, G. Chakraborty, T. Hayashi, H. Maruyama
    • Journal Title

      Parasitol. Int.

      Volume: 62 Pages: 57-65

    • DOI

      10.1016/j.parint.2012.09.006.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A human outbreak case associated with Escherichia albertii2013

    • Author(s)
      T. Ooka, E. Tokuoka, M. Fukuhara, T. Nagamura, Y. Ogura, K. Aisawa, S. Harada, T. Hayashi
    • Journal Title

      Emerg. Infect. Dis.

      Volume: 19 Pages: 144-146

    • DOI

      10.3201/eid1901.120646.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of a Propionibacterium acnes Isolate from a Sarcoidosis Patient2013

    • Author(s)
      K. Minegishi, C. Aikawa, A. Furukawa, T. Watanabe, T. Nakano, Y. Ogura, Y. Ohtsubo, K. Kurokawa, T. Hayashi, F. Maruyama, I. Nakagawa, Y. Eishi
    • Journal Title

      Genome Announc.

      Volume: 1 Pages: 1

    • DOI

      e00016-12

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of diverse aquatic microbes in blood and organs of drowning victims: First metagenomic approach using high- throughput 454-pyrosequencing2012

    • Author(s)
      E. Kakizaki, Y. Ogura, S. Kozawa, S. Nishida, T. Uchiyama, T. Hayashi, N. Yukawa
    • Journal Title

      Forensic Sci. Int.

      Volume: 220 Pages: 135-146

    • DOI

      DOI:10.1016/j.forsciint.2012.02.010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Is bile acid a determinant of the gut microbiota on a high-fat diet?2012

    • Author(s)
      A. Yokota, S. Fukiya, T. Ooka, Y. Ogura, T. Hayashi, S. Ishizuka
    • Journal Title

      Gut Microbes

      Volume: 3(5) Pages: 455-459

    • DOI

      DOI:10.4161/gmic.21216

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 腸管出血性大腸菌における病原性のゲノム進化2012

    • Author(s)
      小椋義俊, 林哲也
    • Journal Title

      感染・炎症・免疫

      Volume: 42 Pages: 182-195

  • [Journal Article] Complete genome sequence of Helicobacter cinaedi strain PAGU611, isolated in a case of human bacteremia2012

    • Author(s)
      T. Goto, Y. Ogura, H. Hirakawa, J. Tomida, Y. Morita, T. Akaike, T. Hayashi, Y. Kawamura
    • Journal Title

      J. Bacteriol.

      Volume: 194 Pages: 3744-3745

    • DOI

      10.1128/JB.00645-12.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Whole-genome sequence of a hypervirulent clinical Mycobacterium intracellulare strain, M.i.1982012

    • Author(s)
      Y. Tateishi, S. Kitada, K. Miki, R. Maekura, Y. Ogura, Y. Ozeki, Y. Nishiuchi, M. Niki, T. Hayashi, K. Hirata, K. Kobayashi, S. Matsumoto
    • Journal Title

      J. Bacteriol.

      Volume: 194 Pages: 6336

    • DOI

      10.1128/JB.01439-12.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 腸管出血性大腸菌O111の進化と病原性2012

    • Author(s)
      小椋義俊, 大岡唯祐, 林哲也
    • Journal Title

      神経内科

      Volume: 76 Pages: 155-163

  • [Presentation] 高解像度系統解析による腸管出血性大腸菌O157のStx2高産生性系統の同定2013

    • Author(s)
      小椋義俊, Md Rakibul Islam, 真子俊博, 大岡唯祐, 大西真, 林哲也
    • Organizer
      第86回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      千葉
    • Year and Date
      20130318-20
  • [Presentation] 腸管出血性大腸菌O26におけるゲノムアダプテーション解析2013

    • Author(s)
      小椋義俊, 桂啓介, 伊藤武彦, Mainil Jacques , 吉野修司, 磯部順子, 勢戸和子, 江藤良樹, 黒木真理子, 木全恵子, 前田詠里子, 後藤恭宏, 大岡唯祐, 林哲也
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      長浜
    • Year and Date
      20130308-10
  • [Presentation] O157 Stx2 phageの包括的ゲノム比較・機能解析により明らかとなったStx2高産生型phagenの存在2012

    • Author(s)
      小椋義俊, Md. Rakibul Islam, 真子俊博, 大岡唯祐, 大西真, 林哲也
    • Organizer
      第16回腸管出血性大腸菌感染症研究会
    • Place of Presentation
      秋田
    • Year and Date
      20120719-20
  • [Presentation] Comparative genomics of Stx2 prophages in O157:H72012

    • Author(s)
      Y. Ogura, T. Mako, T. Ooka, M. Ohnishi, T. Hayashi
    • Organizer
      8th International Symposium on Shiga Toxin (Verocytotoxin) producing Escherichia coli infections
    • Place of Presentation
      Amsterdam
    • Year and Date
      20120506-20120509
  • [Book] 細胞工学別冊 次世代シークエンサー 目的別アドバンスドメソッド2012

    • Author(s)
      小椋義俊, 林哲也
    • Total Pages
      252
    • Publisher
      秀潤社

URL: 

Published: 2014-07-24  

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