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2012 Fiscal Year Annual Research Report

ボツリヌス毒素伝達機構の解明に向けたファージゲノムの解析

Research Project

Project/Area Number 23790479
Research InstitutionUniversity of Miyazaki

Principal Investigator

阪口 義彦  宮崎大学, IR推進機構, 助教 (70403491)

Keywordsボツリヌス菌 / 人獣共通感染症 / ボツリヌス毒素遺伝子 / バクテリオファージ / 伝達 / ファージ変換 / ゲノム解析 / 構造タンパク質
Research Abstract

C型ボツリヌス毒素産生菌は、家畜に強力な致死作用を引き起こすため、畜産分野では脅威となっている。C型毒素遺伝子は、バクテリオファージ(ファージ)により伝播される(ファージ変換)。以前に、C型毒素変換ファージc-stの全ゲノム解析を行った。しかしながら、その大部分の遺伝子情報は未知であった。毒素遺伝子のファージ変換防止には、ファージ遺伝情報の解明が必要である。本研究では、ファージコアゲノム領域の特定を行うことを目的とした。今年度は、1)c-stを構成する構造タンパク質をコードする遺伝子群の特定、2)同種ファージC型毒素変換ファージc-468との比較ゲノム解析を行い、ファージの生命維持に必要なコアゲノムの推定を行った。
1)c-stの構造タンパク質をコードする遺伝子群の特定…CsCl密度勾配遠心法によりc-stの粒子タンパク質を精製し、N末端アミノ酸分析と質量分析を用いて解析したところ、計10個のOpen Reading Frame (ORF)が同定された。これらのORFは全てc-stゲノム上の99-168 kbp領域に存在することが示唆された。
2)c-468との比較ゲノム解析…今年度は、昨年度に続き比較ゲノム解析に使用するc-468 ゲノムの全塩基配列の決定を行った。しかしながら、c-468には異なるサイズのゲノム分子が存在したため、新たにゲノム配列を決定する必要があると考えられた。従って、全ゲノム配列の決定は完全ではない。現在、C型有毒株C468の純培養を行い、得られた菌DNAを使用して宿主菌体内に存在するファージゲノム配列決定を次世代シークエンサーにより行っている。
今年度の結果から、C型毒素変換ファージの構造タンパク質をコードする遺伝子群を明らかにした。今後、解析を進めファージのコアゲノムを特定し、毒素遺伝子の伝播機構(ファージ変換)の解明を行いたい。

  • Research Products

    (10 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (7 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Phospholipase C produced by Clostridium botulinum types C and D: comparison of gene, enzymatic, and biological activities with those of Clostridium perfringens alpha-toxin2013

    • Author(s)
      Fatmawati, N.N.D
    • Journal Title

      Acta Med. Okayama

      Volume: 67(1) Pages: 9-18

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tubulin homolog TubZ in a phage-encoded partition system2012

    • Author(s)
      Oliva, M. A.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.

      Volume: 109(20) Pages: 7711-7716

    • DOI

      10.1073/pnas.1121546109

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] The search for core-genome of Clostridium botulinum bacteriophage converting type C neurotoxin2013

    • Author(s)
      Yoshihiko Sakaguchi
    • Organizer
      The 86th Annual Meeting of Japanese Society for Bacteriology
    • Place of Presentation
      Chiba
    • Year and Date
      20130318-20130320
  • [Presentation] The complete sequence of plasmid encoding neurotoxin gene in Clostridium botulinum type B strain2013

    • Author(s)
      Koji Hosomi
    • Organizer
      The 86th Annual Meeting of Japanese Society for Bacteriology
    • Place of Presentation
      Chiba
    • Year and Date
      20130318-20130320
  • [Presentation] Morphological and genomic analysis of Helicobacter pylori bacteriophage KHP302013

    • Author(s)
      Jumpei Uchiyama
    • Organizer
      The 86th Annual Meeting of Japanese Society for Bacteriology
    • Place of Presentation
      Chiba
    • Year and Date
      20130318-20130320
  • [Presentation] Analysis of pseudolysogenic lifecycle of Clostridium botulinum phage c-st, based on comparative genomics of wild-type and long-term-incubated mutants phages2012

    • Author(s)
      Yoshihiko Sakaguchi
    • Organizer
      The 35th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] Improved adsorption of Enterococcus faecalis bacteriophage ΦEF24C caused by a point mutation in a tail fiber gene2012

    • Author(s)
      Jumpei Uchiyama
    • Organizer
      第4回ファージ研究会
    • Place of Presentation
      前橋市
    • Year and Date
      20120919-20120920
  • [Presentation] C型ボツリヌス毒素変換ファージの構造タンパク質の解析2012

    • Author(s)
      阪口義彦、内山淳平、小椋義俊、山本由弥子、鈴木智典、阪口政清、織田華絵、津田千秋、松崎茂展、林 哲也、小熊惠二
    • Organizer
      第4回ファージ研究会
    • Place of Presentation
      前橋市
    • Year and Date
      20120919-20
  • [Presentation] ピロリ菌バクテリオファージの分離・解析2012

    • Author(s)
      内山淳平、竹内 啓晃、加藤伸一郎、阪口義彦、蒲生啓司、氏原隆子、内山伊代、大畑雅典、松崎茂展
    • Organizer
      第4回ファージ研究会
    • Place of Presentation
      前橋市
    • Year and Date
      20120919-20
  • [Remarks] 宮崎大学型若手研究リーダー育成モデル_IRO特任助教の紹介

    • URL

      http://www.miyazaki-u.ac.jp/ir/?p=92

URL: 

Published: 2014-07-24  

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