2012 Fiscal Year Annual Research Report
新規下痢原性病原菌Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ａｌｂｅｒｔｉｉのゲノム及び病原性解析
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23790480
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| Research Institution | University of Miyazaki |
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Principal Investigator |
大岡 唯祐 宮崎大学, 医学部, 助教 (50363594)
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| Keywords | Escherichia albertii / ゲノム解析 / 病原性 / 疫学ツール / 細菌 |
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| Research Abstract |
Escherichia albertii は、近年、大腸菌の近縁種として新たに命名された新菌種で、腸管出血性大腸菌や腸管病原性大腸菌と同様に、LEE と呼ばれる領域にコードされるIII 型分泌系を有することが明らかになっている。しかし、ヒト病原菌としての位置づけは十分になされておらず、基本的な生化学的性状なども未だ不明な点が多く、有用な疫学マーカーも存在しない。本研究では、動物及びヒト下痢患者から大腸菌として分離された株の中から26 株のE. albertii を同定し、その遺伝学的・生化学的性状を明らかにした。同定したE. albertii 26 株のうち、進化系統が離れた4 株について、新型シークエンサーRoche454 によるドラフトゲノム配列取得、PCR とその産物のシークエンシング、Fosmid ライブラリーのシークエンシングを行って、4 株全ての全ゲノム配列を決定し、遺伝子アノテーションも完了した。また、全ゲノム配列が明らかとなっている大腸菌を含む近縁種とのゲノム比較を行い、本菌の種特異的遺伝子群や病原関連遺伝子群を数多く同定した（論文投稿準備中）。また、疫学マーカー開発のための予備的な解析として、ゲノム解析株4 株の特異的配列を標的としたPCR 検出系を試験的に構築し、国内で腸管病原性大腸菌による下痢症集団感染として報告されていた事例を再検証した結果、E. albertii に起因する集団感染を2 事例同定した。今後は、本研究で同定した病原関連遺伝子群について個別解析を行うことにより本菌の病原機構を明らかにするとともに、種特異的代謝系遺伝子群を利用した選択培地の開発を進める予定である。
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[Presentation] 新興病原体Escherichia albertiiのゲノム解析2012
Author(s)
大岡唯祐, 勢戸和子, 河野喜美子, 小林秀樹, 江藤良樹, 市原祥子, 瀬戸順次, 磯部順子, 山口敬治, 堀川和美, 小椋義俊, 林哲也
Organizer
第16回腸管出血性大腸菌感染症研究会
Place of Presentation
秋田市
Year and Date
20120719-20
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[Presentation] Significant prevalence of Escherichia albertii among the strains identified as enteropathogenic and enterohemorrhagic E. coli and the presence of Shiga toxin-producing E. albertii strains.2012
Author(s)
T. Ooka, K. Seto, K. Kawano, H. Kobayashi, Y. Etoh, S. Ichihara, N. Kaneko, J. Isobe, K. Yamaguchi, K. Horikawa, T.A. Gomes, A. Linden, et al.
Organizer
VTEC 2012: 8th International Symposium on Shiga Toxin (Verocytotoxin) producing Escherichia coli infections
Place of Presentation
Amsterdam, The Netherlands.
Year and Date
20120506-20120509
