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2012 Fiscal Year Annual Research Report

次世代シークエンサーによる脂肪細胞特異的な転写制御調節機構の研究

Research Project

Project/Area Number 23791020
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

脇 裕典  東京大学, 医学部附属病院, 特任准教授 (00466765)

KeywordsFAIRE / クロマチン / PPARg / 脂肪細胞 / 転写 / クロマチン免疫沈降 / 次世代シークエンサー / NFI
Research Abstract

3T3-L1 におけるPPARγ、RXRαのChIP-seq によるゲノムワイド解析では、全ゲノム上でそれぞれ31,951箇所、22,928箇所の結合領域を同定、そのうち19,568箇所の重なりがあり、ヘテロダイマー形成を示唆した。マイクロアレイ解析において脂肪細胞分化で誘導される遺伝子が濃縮されていた。オープンクロマチンを検出するFAIRE-seqにより脂肪細胞のゲノム上の転写制御領域の同定を試みた。3T3-L1脂肪細胞(分化前、後)において、非プロモーターFAIREピークはエンハンサー型のヒストン修飾を持ち、イントロンなどゲノム上に幅広く分布していた。プロモーター領域に対し、非プロモーターFAIREピークは細胞種や分化により大きく変化し、分化に伴い強く誘導される遺伝子の周囲には、複数の脂肪細胞特異的FAIREピークがクラスターを形成して存在した。AdipoR2遺伝子領域では従来の方法で同定されなかった遠位エンハンサーを同定した。一方、脂肪細胞特異的FAIREピークのモチーフ解析では、PPARγやC/EBPに加えて転写因子NF-Iファミリーの結合配列が濃縮していた。ChIPアッセイではNFIが、PPARγやC/EBPα、aP2近傍の脂肪細胞特異的制御領域に存在し、3T3-L1細胞におけるNFIAの過剰発現ではこれらの遺伝子が誘導され、分化誘導刺激前に脂肪滴形成を認めた。一方ドミナントネガティブ型NFIAの過剰発現やNFIA・NFIBのノックダウンにより脂肪細胞分化が抑制され、これらの因子の生理的な役割が示唆された。FAIRE-seqは細胞特異的な転写制御領域のゲノムワイド解析と新規制御因子の同定に有用であった。

  • Research Products

    (12 results)

All 2012

All Presentation (11 results) (of which Invited: 3 results) Book (1 results)

  • [Presentation] 脂肪細胞分化におけるクロマチン構造変化とエビゲノム制御の役割2012

    • Author(s)
      脇 裕典、山内敏正、于 静、中村正裕、若林賢一、青山倫久、四谷理沙、武和巳、孫威、亀井望、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会 ワークショップ
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20121210-20121212
    • Invited
  • [Presentation] 脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析による脂肪細胞分化制御因子NFIの同定2012

    • Author(s)
      脇 裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于 静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
    • Organizer
      第33回日本肥満学会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20121010-20121012
  • [Presentation] 脂肪細胞分化におけるクロマチン構造変化とエビゲノム制御の役割2012

    • Author(s)
      脇 裕典、山内 敏正、中村 正裕、于 静、ほか
    • Organizer
      第33回日本肥満学会 シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20121010-20121012
    • Invited
  • [Presentation] Global Mapping of Cell-Type-Specific Open Chromatin by FAIRE-seq Reveals the Regulatory Role of the NFI Family in Adipocyte Differentiation2012

    • Author(s)
      Hironori Waki, Masahiro Nakamura, Toshimasa Yamauchi, Ken-ichi Wakabayashi, et al
    • Organizer
      BENZON SYMPOSIUM No. 58 Adipose Tissue in health and Disease
    • Place of Presentation
      COPENHAGEN, DENMARK
    • Year and Date
      20120827-20120830
  • [Presentation] 脂肪細胞分化におけるクロマチン構造変化とエビゲノム制御の役割2012

    • Author(s)
      脇 裕典、山内敏正、于 静、中村正裕、若林賢一、青山倫久、四谷理沙、武和巳、孫威、亀井望、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
    • Organizer
      第30回日本肥満症治療学会学術集会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20120825-20120825
    • Invited
  • [Presentation] Global Mapping of Cell-Type-Specific Open Chromatin by FAIRE-seq Reveals the Regulatory Role of the NFI Family in Adipocyte Differentiation2012

    • Author(s)
      Hironori Waki, Masahiro Nakamura, Toshimasa Yamauchi, Ken-ichi Wakabayashi, et al
    • Organizer
      The 64th Fujihara Seminar, International Symposium on Adiponectin Biology and Medicine
    • Place of Presentation
      北海道 苫小牧
    • Year and Date
      20120804-20120807
  • [Presentation] 脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析による脂肪細胞分化制御因子NFIの同定2012

    • Author(s)
      脇 裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于 静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
    • Organizer
      第30回日本肥満症治療学会学術集会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20120629-20120630
  • [Presentation] FAIRE-seqによる脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析と分化におけるNFIファミリーの役割2012

    • Author(s)
      脇 裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于 静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
    • Organizer
      第55回日本糖尿病学会年次学術集会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20120517-20120519
  • [Presentation] 脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析による脂肪細胞分化制御因子NFIの同定2012

    • Author(s)
      脇 裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于 静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
    • Organizer
      第6回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20120514-20120515
  • [Presentation] 脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析による脂肪細胞分化制御因子NFIファミリーの同定2012

    • Author(s)
      脇 裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于 静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
    • Organizer
      第85回日本内分泌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20120419-20120421
  • [Presentation] 脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析による脂肪細胞分化制御因子NFIの同定2012

    • Author(s)
      脇 裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于 静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
    • Organizer
      第49回日本臨床分子医学会学術集会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120412-20120413
  • [Book] 医学のあゆみ 白色脂肪細胞のエピジェネティックス2012

    • Author(s)
      脇 裕典、山内敏正、門脇 孝
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      医歯薬出版株式会社

URL: 

Published: 2014-07-24  

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