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2012 Fiscal Year Research-status Report

次世代型DNA解析システムを用いた肺高血圧治療薬の有効性と遺伝子多型の関連の検討

Research Project

Project/Area Number 23791144
Research InstitutionAsahikawa Medical College

Principal Investigator

杉本 昌也  旭川医科大学, 医学部, 助教 (20400096)

Keywords肺高血圧
Research Abstract

次世代型DNA解析システム(SOLiDシステム)を用いて、全エクソンの網羅的塩基配列解析を行い、肺高血圧の原因となる突然変異の有無や、比較シーケンシング(リシーケンシング)を行なって、個体間の多型、変異、構造上のバリエーションなどを同定する。得られた結果と、急性肺血管反応試験および抗肺高血圧治療薬の有効性の比較を行う。という研究計画に基づき研究を進めている。
今年度に行ったことは昨年度に引き続いてサンプル採取である。さらに(1) 心臓カテーテル検査を行い、各種検査値を測定した。心臓カテーテル検査では肺動脈圧(PAP)、体血圧(ABP)、肺体血圧比(Pp/Ps)、肺血管抵抗(Rp)および、心拍出量(C.O.)を求めた。
さらに、急性肺血管反応試験としてNO吸入によるPAPの変化やRpの変化を調査した。それと同時進行で、(2) 血液サンプルの採取とDNAの抽出を行った。PH患者の血液サンプルを採取し、DNAを抽出した。同時に、NT-proBNPやPIIIP、高感度トロポニンIなどの血清バイオマーカーを測定した。
今後、(3)SOLiDシステムの稼働、(4)解析結果の評価へと研究を進めていく予定である。SOLiDシステムで得られた多型、変異、構造上のバリエーションに基づき、肺高血圧治療薬による治療効果の相違点、バイオマーカー値の変動、有効性について検討する。これが明らかになれば、遺伝的背景に基づいた治療効果予測が可能となり、より患者個人に結びついた医療を実現できる可能性がある。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

(1) 心臓カテーテル検査
PH患者を対象に心臓カテーテル検査を行い肺動脈圧(PAP)、体血圧(ABP)、肺体血圧比(Pp/Ps)、肺血管抵抗(Rp)および、心拍出量(C.O.)を求める。さらに、急性肺血管反応試験としてNO吸入によるPAPの変化やRpの変化を調査する。
(2) 血液サンプルの採取とDNAの抽出
PH患者の血液サンプルを採取し、DNAを抽出する。同時に、NT-proBNPやPIIIP、高感度トロポニンIなどの血清バイオマーカーを測定する。
昨年に引き続き現在(1)、(2)までの進行状況であり、ようやくサンプルが集まってきたところである。同時に測定する、血清バイオマーカーの測定は順調に進行している。

Strategy for Future Research Activity

今後の予定として、昨年に引き続き(3) Sure Selectターゲットリシークエンスシステムを用いて、シークエンスしたいターゲット領域を決定する。
そこですべての遺伝子の塩基配列解析を効率良くデータが得られる領域を選定し、DNAオリゴをデザインする。
(4) 次世代型DNA解析システム(SOLiDシステム)による解析
抽出したDNAをSOLiDシステムを用いて、全エクソンの塩基配列解析および、受容体遺伝子多型の解析を行う。
今年度で研究が終了するのでそれまでに成果が出せるよう、効率よく研究を進めていく必要がある。そのためエフォートの配分を調整していく。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

SOLiDシステム(Sure Selectターゲットリシークエンスシステム)を用いる際に必要な試薬に研究費を充てる予定である。

  • Research Products

    (3 results)

All 2013 2012

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Findings in the pulmonary vascular bed in the remote phase after Kawasaki disease.2012

    • Author(s)
      Sugimoto M, Ishido H, Seki M, Masutani S, Tamai A, Senzaki H.
    • Journal Title

      Am J Cardiol

      Volume: 109 (8) Pages: 1219-1222

    • DOI

      doi: 10.1016/j.amjcard.2011.11.062.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Assessment of pulmonary arterial pressure in children with congenital heart disease by velocity-encoded cine magnetic resonance imaging2012

    • Author(s)
      杉本昌也
    • Organizer
      AHA scientific sessions 2012
    • Place of Presentation
      Los Angeles
    • Year and Date
      20121104-20121107
  • [Book] Hemodynamics: Monitoring, Theory and Applications - Serological Monitoring of Hemodynamics2013

    • Author(s)
      Sugimoto M, Senzaki H
    • Total Pages
      131-145
    • Publisher
      Nova Sciences Publishers

URL: 

Published: 2014-07-24  

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